38 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Clim_0038  CDS  NC_010803  45263  45499  +  237  SirA family protein  YP_001942125  unclonable  0.00000000000000689982  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_0132  CDS  NC_010803  145571  146662  +  1092  permease  YP_001942211  unclonable  0.00000000000160751  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_0133  CDS  NC_010803  146807  147508  +  702  PHP domain protein  YP_001942212  unclonable  0.000000000000141938  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_0134  CDS  NC_010803  147556  149754  -  2199  catalase/peroxidase HPI  YP_001942213  unclonable  0.000000000854212  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_0135  CDS  NC_010803  149922  150341  -  420  ferric uptake regulator, Fur family  YP_001942214  unclonable  0.0000000000000297915  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_0136  CDS  NC_010803  150641  150868  +  228  hypothetical protein  YP_001942215  unclonable  0.00000000000000624078  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_0199  CDS  NC_010803  224173  224658  -  486  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxyl carrier protein  YP_001942277  unclonable  0.0000000000000283274  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_0349  CDS  NC_010803  385593  387353  +  1761  30S ribosomal protein S1  YP_001942421  unclonable  0.000000000135822  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_0362  CDS  NC_010803  400457  401746  +  1290  Cytochrome b/b6 domain  YP_001942434  unclonable  0.00000000000296669  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_0386  CDS  NC_010803  423547  425667  +  2121  ATP-dependent DNA helicase RecG  YP_001942458  unclonable  0.000000000898372  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_0387  CDS  NC_010803  425704  426660  +  957  ribosome small subunit-dependent GTPase A  YP_001942459  unclonable  0.00000000000179584  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_0388  CDS  NC_010803  426706  428082  +  1377  Aldehyde Dehydrogenase_  YP_001942460  unclonable  0.0000000000227501  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_0389  CDS  NC_010803  428162  429376  -  1215  hypothetical protein  YP_001942461  unclonable  0.00000000000587209  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_0498  CDS  NC_010803  564527  566170  +  1644  chaperonin GroEL  YP_001942570  unclonable  0.0000000000658221  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_0521  CDS  NC_010803  588243  589517  -  1275  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  YP_001942592  unclonable  0.00000000000204597  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_0747  CDS  NC_010803  818838  820172  +  1335  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  YP_001942807  unclonable  0.00000000000257607  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_0748  CDS  NC_010803  820208  820669  +  462  peptidoglycan-associated lipoprotein  YP_001942808  unclonable  0.00000000000000605399  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_1167  CDS  NC_010803  1261160  1262176  -  1017  ADP-L-glycero-D-manno-heptose-6-epimerase  YP_001943214  unclonable  0.000000000000444503  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_1168  CDS  NC_010803  1262287  1262709  -  423  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  YP_001943215  unclonable  0.0000000000000143232  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_1399  CDS  NC_010803  1504017  1505366  -  1350  signal recognition particle protein  YP_001943438  unclonable  0.00000000000293601  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_1448  CDS  NC_010803  1554224  1555216  -  993  hypothetical protein  YP_001943486  unclonable  0.00000000000102298  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_1519  CDS  NC_010803  1638755  1640572  -  1818  aspartyl-tRNA synthetase  YP_001943549  unclonable  0.0000000000463103  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_1634  CDS  NC_010803  1766733  1767026  -  294  hypothetical protein  YP_001943657  unclonable  0.0000000000000171547  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_1635  CDS  NC_010803  1767040  1769454  -  2415  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  YP_001943658  unclonable  0.00000000574827  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_1659  CDS  NC_010803  1794370  1797411  -  3042  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  YP_001943681  unclonable  0.000000123584  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_1705  CDS  NC_010803  1875452  1875853  -  402  transcriptional regulator, MerR family  YP_001943726  unclonable  0.0000000000000310194  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_1868  CDS  NC_010803  2053636  2054931  -  1296  hypothetical protein  YP_001943883  unclonable  0.00000000000489897  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_1956  CDS  NC_010803  2172696  2172908  +  213  hypothetical protein  YP_001943967  unclonable  0.0000000000000189663  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_1968  CDS  NC_010803  2184910  2185446  -  537  hypothetical protein  YP_001943979  unclonable  0.0000000000000218249  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_2452  CDS  NC_010803  2685811  2686695  -  885  hypothetical protein  YP_001944451  unclonable  0.00000000000038613  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_2453  CDS  NC_010803  2686706  2687626  -  921  protein of unknown function DUF89  YP_001944452  unclonable  0.000000000000820322  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_2487  CDS  NC_010803  2727359  2727841  -  483  hypothetical protein  YP_001944485  unclonable  0.0000000000000274795  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_2488  CDS  NC_010803  2728315  2728860  -  546  F0F1 ATP synthase subunit delta  YP_001944486  unclonable  0.0000000000000402457  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_R0043  tRNA  NC_010803  1769606  1769677  -  72  tRNA-Glu    unclonable  0.00000000000000374465  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_R0044  tRNA  NC_010803  1769685  1769758  -  74  tRNA-His    unclonable  0.00000000000000342103  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_R0045  tRNA  NC_010803  1769782  1769857  -  76  tRNA-Arg    unclonable  0.00000000000000300165  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_R0046  tRNA  NC_010803  1769886  1769958  -  73  tRNA-Pro    unclonable  0.000000000000003033  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_R0054  tRNA  NC_010803  2728125  2728200  -  76  tRNA-Ala    unclonable  0.00000000000000229051  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>