122 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BCZK0001  CDS  NC_006274  408  1748  +  1341  chromosomal replication initiation protein  YP_081620  unclonable  0.00000000459109  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0056  CDS  NC_006274  63789  64271  +  483  hypothetical protein  YP_081673  unclonable  0.00000000000079318  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0083  CDS  NC_006274  97315  98772  +  1458  glutamyl-tRNA synthetase  YP_081699  unclonable  0.00000000937191  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0091  CDS  NC_006274  104961  105386  +  426  50S ribosomal protein L11  YP_081708  unclonable  0.0000000000002609  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0092  CDS  NC_006274  105564  106256  +  693  50S ribosomal protein L1  YP_081709  unclonable  0.00000000000339498  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0093  CDS  NC_006274  106489  106989  +  501  50S ribosomal protein L10  YP_081710  unclonable  0.000000000000338487  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0099  CDS  NC_006274  116045  116467  +  423  30S ribosomal protein S12  YP_081716  unclonable  0.000000000000147316  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0102  CDS  NC_006274  119371  120558  +  1188  elongation factor Tu  YP_081719  unclonable  0.00000000109965  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0103  CDS  NC_006274  120957  121265  +  309  30S ribosomal protein S10  YP_081720  unclonable  0.0000000000000504345  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0104  CDS  NC_006274  121300  121932  +  633  50S ribosomal protein L3  YP_081721  unclonable  0.00000000000168091  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0105  CDS  NC_006274  121958  122581  +  624  50S ribosomal protein L4  YP_081722  unclonable  0.00000000000256275  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0106  CDS  NC_006274  122581  122871  +  291  50S ribosomal protein L23  YP_081723  unclonable  0.0000000000000563087  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0127  CDS  NC_006274  132957  133175  +  219  translation initiation factor IF-1  YP_081744  unclonable  0.0000000000000150239  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0205  CDS  NC_006274  217078  217611  +  534  invasion protein LagB  YP_081820  unclonable  0.000000000000341948  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0430  CDS  NC_006274  497186  498283  +  1098  A/G-specific adenine glycosylase  YP_082039  unclonable  0.000000000440987  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0451  CDS  NC_006274  523516  524292  +  777  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  YP_082058  unclonable  0.0000000000185121  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0555  CDS  NC_006274  650117  650494  +  378  OsmC-like protein  YP_082161  unclonable  0.0000000000000799335  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0556  CDS  NC_006274  650557  650991  +  435  HIT (histidine triad) family protein  YP_082162  unclonable  0.000000000000140034  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0557  CDS  NC_006274  651171  651728  +  558  RNA polymerase sigma factor  YP_082163  unclonable  0.000000000000417875  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0588  CDS  NC_006274  685052  685903  +  852  phospholipase C  YP_082194  unclonable  0.0000000000230796  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0600  CDS  NC_006274  696097  697482  -  1386  peptide symporter family protein  YP_082206  unclonable  0.00000000822499  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0603  CDS  NC_006274  700927  702474  -  1548  hypothetical protein  YP_082209  unclonable  0.0000000260984  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0634  CDS  NC_006274  740630  741790  -  1161  peptidase NLP/P60 /M23/M37 peptidase domain-containing protein  YP_082239  unclonable  0.000000000528425  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0683  CDS  NC_006274  784111  785766  -  1656  sodium-dependent phosphate transporter  YP_082287  unclonable  0.000000253455  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0800  CDS  NC_006274  917558  919147  +  1590  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  YP_082404  unclonable  0.0000000328713  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0884  CDS  NC_006274  1005195  1006931  +  1737  S-layer protein  YP_082487  unclonable  0.000000197101  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0922  CDS  NC_006274  1035302  1036321  +  1020  hypothetical protein  YP_082524  unclonable  0.0000000000636245  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0937  CDS  NC_006274  1047361  1048197  +  837  glycerol uptake facilitator protein  YP_082539  unclonable  0.0000000000181424  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0944  CDS  NC_006274  1054231  1055409  +  1179  cell cycle protein FtsW  YP_082546  unclonable  0.000000000881234  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0946  CDS  NC_006274  1055467  1055952  -  486  MarR family transcriptional regulator  YP_082547  unclonable  0.000000000000341948  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1056  CDS  NC_006274  1162797  1164029  -  1233  ammonium transporter  YP_082657  unclonable  0.000000003226  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1314  CDS  NC_006274  1408158  1409429  +  1272  proton/sodium-glutamate symport protein  YP_082913  unclonable  0.00000000288738  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1336  CDS  NC_006274  1427489  1429531  +  2043  penicillin-binding protein 2A  YP_082935  unclonable  0.00000691863  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1361  CDS  NC_006274  1456100  1456714  +  615  cell wall endopeptidase  YP_082960  unclonable  0.00000000000286273  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1362  CDS  NC_006274  1456745  1457431  -  687  hypothetical protein  YP_082961  unclonable  0.00000000000658238  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1363  CDS  NC_006274  1457979  1458557  +  579  hypothetical protein  YP_082962  unclonable  0.000000000000746858  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1367  CDS  NC_006274  1461774  1462340  +  567  CAAX amino terminal protease family protein  YP_082966  unclonable  0.00000000000155141  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1483  CDS  NC_006274  1576279  1577442  -  1164  Na+/H+ exchanger family protein  YP_083078  unclonable  0.000000000497564  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1628  CDS  NC_006274  1713237  1714478  +  1242  S-layer protein and N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase fusion protein  YP_083222  unclonable  0.00000000159428  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1703  CDS  NC_006274  1802501  1803172  +  672  deoxyribose-phosphate aldolase  YP_083298  unclonable  0.00000000000427517  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1727  CDS  NC_006274  1850132  1851097  -  966  arsenical-resistance protein  YP_083322  unclonable  0.0000000000732374  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1728  CDS  NC_006274  1851458  1852084  +  627  azoreductase  YP_083323  unclonable  0.00000000000241266  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1744  CDS  NC_006274  1868710  1869708  -  999  S-layer protein  YP_083339  unclonable  0.000000000139139  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1767  CDS  NC_006274  1891407  1892360  +  954  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  YP_083362  unclonable  0.0000000000563802  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1791  CDS  NC_006274  1917951  1918772  +  822  polysaccharide deacetylase  YP_083386  unclonable  0.00000000000907429  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1807  CDS  NC_006274  1934940  1936100  +  1161  murein endopeptidase  YP_083402  unclonable  0.000000000440987  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1965  CDS  NC_006274  2078271  2079002  +  732  hypothetical protein  YP_083557  unclonable  0.0000000000219502  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK2023  CDS  NC_006274  2146746  2147381  +  636  azoreductase  YP_083615  unclonable  0.00000000000234094  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK2231  CDS  NC_006274  2360389  2360796  +  408  hypothetical protein  YP_083822  unclonable  0.000000000000213459  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK2250  CDS  NC_006274  2379425  2380705  -  1281  alpha-ketoglutarate permease  YP_083840  unclonable  0.00000000207173  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK2268  CDS  NC_006274  2400534  2401766  +  1233  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  YP_083858  unclonable  0.00000000138501  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK2464  CDS  NC_006274  2599187  2600890  -  1704  extracellular neutral metalloprotease, bacillolysin  YP_084053  unclonable  0.000000399034  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK2539  CDS  NC_006274  2661507  2663576  -  2070  UvrD/Rep helicase family protein  YP_084128  unclonable  0.0000078955  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK2661  CDS  NC_006274  2768799  2769626  +  828  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  YP_084248  unclonable  0.0000000000138252  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK2666  CDS  NC_006274  2774398  2776371  -  1974  phosphoglycerol transferase  YP_084253  unclonable  0.00000321801  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK2716  CDS  NC_006274  2834536  2835960  +  1425  amino acid permease; arginine permease  YP_084303  unclonable  0.0000000134476  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK2985  CDS  NC_006274  3116127  3116708  -  582  TetR family transcriptional regulator  YP_084572  unclonable  0.00000000000207551  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK2986  CDS  NC_006274  3116933  3118177  +  1245  major facilitator superfamily permease  YP_084573  unclonable  0.0000000015466  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK3182  CDS  NC_006274  3305977  3306357  -  381  group-specific protein  YP_084768  unclonable  0.000000000000130545  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK3248  CDS  NC_006274  3371355  3371555  -  201  cold shock protein  YP_084834  unclonable  0.0000000000000222014  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK3249  CDS  NC_006274  3371772  3372662  -  891  hypothetical protein  YP_084835  unclonable  0.0000000000421279  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK3250  CDS  NC_006274  3372688  3373152  -  465  flavodoxin  YP_084836  unclonable  0.000000000000245665  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK3386  CDS  NC_006274  3522232  3522453  -  222  hypothetical protein  YP_084970  unclonable  0.000000000000105781  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK3387  CDS  NC_006274  3522532  3522972  -  441  hypothetical protein  YP_084971  unclonable  0.00000000000112597  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK3407  CDS  NC_006274  3542072  3543127  -  1056  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  YP_084991  unclonable  0.000000000173531  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK3435  CDS  NC_006274  3565989  3566990  -  1002  hypothetical protein  YP_085018  unclonable  0.000000000106103  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK3436  CDS  NC_006274  3567182  3568930  -  1749  hypothetical protein  YP_085019  unclonable  0.000000371646  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK3486  CDS  NC_006274  3611973  3612245  +  273  DNA-binding protein HU  YP_085068  unclonable  0.000000000000148823  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK3487  CDS  NC_006274  3612393  3614810  -  2418  heavy metal-transporting ATPase  YP_085069  unclonable  0.000442964  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK3559  CDS  NC_006274  3693029  3694261  -  1233  aspartate kinase I  YP_085141  unclonable  0.00000000159428  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK3587  CDS  NC_006274  3723682  3724461  -  780  transcriptional repressor CodY  YP_085169  unclonable  0.0000000000152873  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK3600  CDS  NC_006274  3737194  3737928  -  735  tRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  YP_085182  unclonable  0.00000000000482276  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK3601  CDS  NC_006274  3737928  3738443  -  516  16S rRNA-processing protein RimM  YP_085183  unclonable  0.000000000000401419  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK3602  CDS  NC_006274  3738565  3738792  -  228  hypothetical protein  YP_085184  unclonable  0.0000000000000183566  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK3603  CDS  NC_006274  3738807  3739079  -  273  30S ribosomal protein S16  YP_085185  unclonable  0.0000000000000351748  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK3604  CDS  NC_006274  3739180  3740529  -  1350  signal recognition particle protein  YP_085186  unclonable  0.00000000432061  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK3617  CDS  NC_006274  3754976  3755164  +  189  50S ribosomal protein L28  YP_085199  unclonable  0.00000000000000996715  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK3618  CDS  NC_006274  3755385  3756026  -  642  thiamine pyrophosphokinase  YP_085200  unclonable  0.0000000000017674  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK3648  CDS  NC_006274  3788502  3789416  -  915  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  YP_085230  unclonable  0.0000000000563802  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK3662  CDS  NC_006274  3801032  3801901  -  870  sporulation sigma factor SigG  YP_085244  unclonable  0.0000000000167357  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK3718  CDS  NC_006274  3856563  3857354  -  792  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  YP_085299  unclonable  0.0000000000237867  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK3906  CDS  NC_006274  4029389  4029595  -  207  group-specific protein  YP_085486  unclonable  0.0000000000000654327  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK3922  CDS  NC_006274  4045370  4046896  -  1527  hemagglutinin  YP_085502  unclonable  0.0000000356284  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK3929  CDS  NC_006274  4054953  4055792  -  840  hemolysin A  YP_085509  unclonable  0.0000000000268336  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK3977  CDS  NC_006274  4089896  4090120  -  225  hypothetical protein  YP_085557  unclonable  0.000000000000012422  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK4035  CDS  NC_006274  4144314  4145624  -  1311  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  YP_085615  unclonable  0.00000000492575  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK4042  CDS  NC_006274  4150370  4151491  -  1122  RNA polymerase sigma factor RpoD  YP_085621  unclonable  0.00000000102439  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK4047  CDS  NC_006274  4156883  4157788  -  906  GTP-binding protein Era  YP_085626  unclonable  0.0000000000669103  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK4096  CDS  NC_006274  4202585  4203085  -  501  hypothetical protein  YP_085675  unclonable  0.000000000000575667  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK4130  CDS  NC_006274  4235354  4235767  -  414  Holliday junction resolvase-like protein  YP_085709  unclonable  0.000000000000238321  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK4161  CDS  NC_006274  4268777  4269916  -  1140  queuine tRNA-ribosyltransferase  YP_085740  unclonable  0.000000000310592  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK4162  CDS  NC_006274  4269929  4270981  -  1053  S-adenosylmethionine:tRNA ribosyltransferase-isomerase  YP_085741  unclonable  0.000000000119694  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK4165  CDS  NC_006274  4272205  4272822  -  618  Holliday junction DNA helicase RuvA  YP_085744  unclonable  0.00000000000436229  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK4214  CDS  NC_006274  4321271  4323601  -  2331  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  YP_085793  unclonable  0.000107008  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK4317  CDS  NC_006274  4428890  4429477  -  588  translation initiation factor IF-3  YP_085896  unclonable  0.00000000000117232  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK4323  CDS  NC_006274  4436447  4436839  -  393  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  YP_085902  unclonable  0.000000000000166185  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK4324  CDS  NC_006274  4437221  4438249  -  1029  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  YP_085903  unclonable  0.000000000123361  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK4612  CDS  NC_006274  4701491  4702444  +  954  1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase  YP_086187  unclonable  0.0000000000569669  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK4613  CDS  NC_006274  4702554  4703285  +  732  DnaK suppressor protein  YP_086188  unclonable  0.00000000000678403  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK4614  CDS  NC_006274  4703330  4703530  -  201  cold shock protein  YP_086189  unclonable  0.0000000000000169422  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>