30 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CHU_0040  CDS  NC_008255  50518  53673  +  3156  DNA repair ATPase  YP_676674  unclonable  0.00000057692  hitchhiker  0.00102482  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_1522  CDS  NC_008255  1760942  1763860  +  2919  hypothetical protein  YP_678133  unclonable  0.000000106004  normal  0.087723  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_1523  CDS  NC_008255  1764007  1764573  +  567  hypothetical protein  YP_678134  unclonable  0.0000000000000102654  normal  0.135541  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_1524  CDS  NC_008255  1764585  1769444  +  4860  hypothetical protein  YP_678135  unclonable  0.0000611783  normal  0.152369  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_2149  CDS  NC_008255  2497450  2500776  -  3327  glycoside hydrolase family 5 protein  YP_678754  unclonable  0.000000532282  normal  1  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_2206  CDS  NC_008255  2562575  2564404  -  1830  cytochrome c oxidase, subunit I  YP_678811  unclonable  0.000000000515262  normal  1  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_2379  CDS  NC_008255  2741518  2745000  -  3483  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  YP_678979  unclonable  0.000000600941  normal  1  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_2895  CDS  NC_008255  3311131  3315105  +  3975  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  YP_679483  unclonable  0.00000343468  normal  0.0609683  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_2924  CDS  NC_008255  3340823  3344017  +  3195  hypothetical protein  YP_679508  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_2925  CDS  NC_008255  3344068  3345753  +  1686  hypothetical protein  YP_679509  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_2948  CDS  NC_008255  3373410  3375995  -  2586  hypothetical protein  YP_679532  unclonable  0.0000000754112  unclonable  0.0000101752  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_2949  CDS  NC_008255  3376047  3377486  -  1440  site-specific recombinase  YP_679533  hitchhiker  0.00000000764647  unclonable  0.00000628307  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_2950  CDS  NC_008255  3377518  3377706  -  189  hypothetical protein  YP_679534  hitchhiker  0.0000000094216  unclonable  0.00000411859  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_2951  CDS  NC_008255  3377725  3378129  -  405  hypothetical protein  YP_679535  hitchhiker  0.0000000097185  unclonable  0.00000428891  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_2952  CDS  NC_008255  3378335  3378670  -  336  hypothetical protein  YP_679536  hitchhiker  0.00000000112801  unclonable  0.00000424513  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_2953  CDS  NC_008255  3378667  3379038  -  372  hypothetical protein  YP_679537  hitchhiker  0.000000000151184  unclonable  0.00000442068  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_2954  CDS  NC_008255  3379035  3379442  -  408  hypothetical protein  YP_679538  decreased coverage  0.00000000017576  unclonable  0.00000451115  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_2955  CDS  NC_008255  3379892  3381943  +  2052  hypothetical protein  YP_679539  decreased coverage  0.00000296771  unclonable  0.00000929698  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_2956  CDS  NC_008255  3381945  3382997  +  1053  hypothetical protein  YP_679540  hitchhiker  0.000000111336  unclonable  0.00000687657  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_2957  CDS  NC_008255  3383113  3388779  +  5667  hypothetical protein  YP_679541  unclonable  0.000786902  unclonable  0.0000338005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_2958  CDS  NC_008255  3388772  3391078  +  2307  GTPase  YP_679542  unclonable  0.000000016463  unclonable  0.0000121851  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_2959  CDS  NC_008255  3391105  3392247  -  1143  hypothetical protein  YP_679543  hitchhiker  0.000000000813097  unclonable  0.00000716096  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_2960  CDS  NC_008255  3392683  3393336  +  654  DNA resolvase  YP_679544  decreased coverage  0.00000000000168825  unclonable  0.00000591562  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_2961  CDS  NC_008255  3393346  3393774  -  429  hypothetical protein  YP_679545  hitchhiker  0.0000000714757  unclonable  0.00000514012  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_2962  CDS  NC_008255  3393810  3394640  -  831  hypothetical protein  YP_679546  hitchhiker  0.00000474154  unclonable  0.00000551426  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_2963  CDS  NC_008255  3394692  3395003  -  312  hypothetical protein  YP_679547  hitchhiker  0.0000201554  unclonable  0.00000479136  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_2964  CDS  NC_008255  3395024  3396406  -  1383  hypothetical protein  YP_679548  hitchhiker  0.00000989535  unclonable  0.00000920206  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_2965  CDS  NC_008255  3396476  3397087  +  612  sigma 24 related  YP_679549  hitchhiker  0.00314986  unclonable  0.00000799779  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_2966  CDS  NC_008255  3397448  3397879  -  432  hypothetical protein  YP_679550  normal  0.548269  unclonable  0.00000730752  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_2967  CDS  NC_008255  3398002  3398190  +  189  hypothetical protein  YP_679551  normal  0.243732  unclonable  0.00000687657  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>