14 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Mbar_A0026  CDS  NC_007355  31258  32436  -  1179  hypothetical protein  YP_303597  unclonable  0.00000000112198  hitchhiker  0.00859577  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
 
Mbar_A0027  CDS  NC_007355  32530  34323  -  1794  hypothetical protein  YP_303598  unclonable  0.0000000139812  decreased coverage  0.00503722  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0776  CDS  NC_007355  938251  938676  -  426  hypothetical protein  YP_304333  normal  1  unclonable  0.000000000433123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0777  CDS  NC_007355  938846  939616  -  771  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  YP_304334  normal  1  unclonable  0.000000000602932  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0778  CDS  NC_007355  940292  940717  -  426  nodulation protein L  YP_304335  normal  1  unclonable  0.00000000043759  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0779  CDS  NC_007355  941070  942176  -  1107  hypothetical protein  YP_304336  normal  1  unclonable  0.000000000590838  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A1797  CDS  NC_007355  2227623  2228840  +  1218  hypothetical protein  YP_305318  unclonable  0.000000000782574  normal  1  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
 
Mbar_A1820  CDS  NC_007355  2274639  2275865  -  1227  acetate kinase  YP_305341  unclonable  0.00000000179563  normal  1  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A1995  CDS  NC_007355  2511422  2517070  +  5649  cell surface protein  YP_305509  unclonable  0.00993075  normal  0.508368  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A2007  CDS  NC_007355  2531886  2532218  -  333  hypothetical protein  YP_305521  unclonable  0.0000000000152037  normal  1  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
 
Mbar_A2689  CDS  NC_007355  3406638  3408377  +  1740  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  YP_306173  unclonable  0.00000000864453  normal  0.0786508  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A3040  CDS  NC_007355  3918973  3919725  -  753  hypothetical protein  YP_306512  unclonable  0.000000000131903  normal  0.41258  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
 
Mbar_A3387  CDS  NC_007355  4345690  4345911  -  222  30S ribosomal protein S28e  YP_306840  unclonable  0.0000000000025371  normal  0.0615713  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A3388  CDS  NC_007355  4345936  4346298  -  363  50S ribosomal protein L7Ae  YP_306841  unclonable  0.00000000000732492  normal  0.0682764  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>