19 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Rxyl_0002  CDS  NC_008148  1853  2980  +  1128  DNA polymerase III, beta subunit  YP_642795  unclonable  0.000000418991  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0399  CDS  NC_008148  427722  428930  -  1209  ROK domain-containing protein  YP_643186  unclonable  0.00000118651  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0403  CDS  NC_008148  432980  434635  +  1656  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  YP_643190  unclonable  0.00000492986  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
 
Rxyl_0575  CDS  NC_008148  604020  605459  +  1440  Na+/solute symporter  YP_643359  unclonable  0.00000227559  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0576  CDS  NC_008148  605484  607013  +  1530  histidine ammonia-lyase  YP_643360  unclonable  0.00000203792  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0676  CDS  NC_008148  708568  711228  +  2661  ATPase AAA-2  YP_643458  unclonable  0.000220966  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0814  CDS  NC_008148  847856  849478  +  1623  chaperonin GroEL  YP_643594  unclonable  0.00000301367  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_1008  CDS  NC_008148  1044367  1045236  -  870  RNA polymerase, sigma 28 subunit  YP_643786  unclonable  0.000000100967  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_1028  CDS  NC_008148  1062650  1063342  -  693  GntR family transcriptional regulator  YP_643806  unclonable  0.000000104073  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_1398  CDS  NC_008148  1421168  1422088  +  921  SSU ribosomal protein S2P  YP_644172  unclonable  0.000000184086  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_1619  CDS  NC_008148  1643340  1644779  +  1440  beta-lactamase-like protein  YP_644392  unclonable  0.00000199695  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_1756  CDS  NC_008148  1782856  1783803  -  948  phenylacetic acid catabolic  YP_644527  unclonable  0.000000367689  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_2230  CDS  NC_008148  2239015  2240640  +  1626  hypothetical protein  YP_644981  unclonable  0.00000361135  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_2698  CDS  NC_008148  2713179  2713667  -  489  hypothetical protein  YP_645427  unclonable  0.0000000176947  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_2699  CDS  NC_008148  2713901  2714449  -  549  hypothetical protein  YP_645428  unclonable  0.0000000277762  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_2700  CDS  NC_008148  2714618  2715130  -  513  hypothetical protein  YP_645429  unclonable  0.000000018428  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
 
Rxyl_3031    NC_008148  3038739  3040011  -  1273      unclonable  0.0000017706  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_3183  CDS  NC_008148  3195659  3196039  -  381  glycine cleavage system protein H  YP_645900  unclonable  0.0000000182392  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_3190  CDS  NC_008148  3202639  3203247  -  609  TetR family transcriptional regulator  YP_645907  unclonable  0.0000000548437  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>