94 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
GBAA_0093  CDS  NC_007530  102990  103646  +  657  RNA polymerase factor sigma-70  YP_016697  unclonable  0.000000000000656402  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_0094  CDS  NC_007530  103778  103924  +  147  50S ribosomal protein L33  YP_022517  unclonable  0.000000000000015203  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_0095  CDS  NC_007530  103957  104136  +  180  preprotein translocase subunit SecE  YP_016698  unclonable  0.0000000000000233788  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_0096  CDS  NC_007530  104268  104801  +  534  transcription antitermination protein NusG  YP_016699  unclonable  0.000000000000457799  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_0097  CDS  NC_007530  104969  105394  +  426  50S ribosomal protein L11  YP_016700  unclonable  0.000000000000283134  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_0098  CDS  NC_007530  105572  106264  +  693  50S ribosomal protein L1  YP_016701  unclonable  0.00000000000205875  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_0099  CDS  NC_007530  106497  106997  +  501  50S ribosomal protein L10  YP_016703  unclonable  0.000000000000718586  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_0107  CDS  NC_007530  117180  119258  +  2079  elongation factor G  YP_016712  unclonable  0.0000000392838  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_0108  CDS  NC_007530  119376  120563  +  1188  elongation factor Tu  YP_016713  unclonable  0.0000000000587402  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_0109  CDS  NC_007530  120962  121270  +  309  30S ribosomal protein S10  YP_016714  unclonable  0.000000000000209715  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_0110  CDS  NC_007530  121305  121937  +  633  50S ribosomal protein L3  YP_016715  unclonable  0.00000000000246604  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_0111  CDS  NC_007530  121963  122586  +  624  50S ribosomal protein L4  YP_016716  unclonable  0.00000000000163463  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_0112  CDS  NC_007530  122586  122876  +  291  50S ribosomal protein L23  YP_016717  unclonable  0.000000000000156815  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_0113  CDS  NC_007530  122905  123735  +  831  50S ribosomal protein L2  YP_016718  unclonable  0.00000000000512601  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_0114  CDS  NC_007530  123796  124074  +  279  30S ribosomal protein S19  YP_016719  unclonable  0.000000000000118397  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_0115  CDS  NC_007530  124092  124433  +  342  50S ribosomal protein L22  YP_016720  unclonable  0.00000000000016654  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_0116  CDS  NC_007530  124437  125096  +  660  30S ribosomal protein S3  YP_016721  unclonable  0.00000000000165133  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_0132  CDS  NC_007530  132147  132893  +  747  methionine aminopeptidase  YP_016737  unclonable  0.00000000000383298  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_0133  CDS  NC_007530  132962  133180  +  219  translation initiation factor IF-1  YP_016738  unclonable  0.0000000000000769266  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_0134  CDS  NC_007530  133216  133329  +  114  50S ribosomal protein L36  YP_016739  unclonable  0.0000000000000370464  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_0336  CDS  NC_007530  346049  346561  +  513  hypothetical protein  YP_016952  unclonable  0.000000000000656402  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_0371  CDS  NC_007530  384056  385720  +  1665  glycosyl hydrolase family protein  YP_016991  unclonable  0.00000000236448  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_0543  CDS  NC_007530  541339  542115  +  777  penicillin-binding domain-containing protein  YP_017165  unclonable  0.00000000000216504  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_0677  CDS  NC_007530  695145  695996  +  852  phospholipase C  YP_017306  unclonable  0.0000000000065254  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_0689  CDS  NC_007530  706192  707577  -  1386  proton/peptide symporter family protein  YP_017318  unclonable  0.000000000179263  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_0724  CDS  NC_007530  750669  751829  -  1161  M23/37 family peptidase  YP_017357  unclonable  0.0000000000754893  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_0898  CDS  NC_007530  912754  914343  +  1590  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  YP_017533  unclonable  0.00000000140449  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_1161  CDS  NC_007530  1132149  1132370  +  222  hypothetical protein  YP_022562  unclonable  0.000000000000103911  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_1246  CDS  NC_007530  1200812  1202290  -  1479  sodium/proline symporter family protein  YP_017861  unclonable  0.000000000709794  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_1247  CDS  NC_007530  1202582  1202770  +  189  hypothetical protein  YP_017862  unclonable  0.0000000000000510263  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_1449  CDS  NC_007530  1371750  1373003  -  1254  M23/37 family peptidase  YP_018073  unclonable  0.000000000128519  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_1450  CDS  NC_007530  1373496  1374767  +  1272  proton/glutamate symporter family protein  YP_018074  unclonable  0.000000000273308  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_1500  CDS  NC_007530  1420974  1421588  +  615  M23/37 family peptidase  YP_018123  unclonable  0.00000000000118576  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_1503  CDS  NC_007530  1423689  1423937  -  249  ferredoxin  YP_018126  unclonable  0.0000000000000800797  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_1506  CDS  NC_007530  1426816  1427379  +  564  CAAX amino terminal protease family protein  YP_018129  unclonable  0.00000000000177137  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_1507  CDS  NC_007530  1427402  1427881  +  480  lysm domain-containing protein  YP_018130  unclonable  0.00000000000123436  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_1817  CDS  NC_007530  1700956  1702200  +  1245  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  YP_018454  unclonable  0.0000000000725042  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_1897  CDS  NC_007530  1781019  1781249  -  231  hypothetical protein  YP_018540  unclonable  0.0000000000000617246  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_1898  CDS  NC_007530  1781497  1782414  +  918  hypothetical protein  YP_018541  unclonable  0.0000000000129159  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_1903  CDS  NC_007530  1788067  1789761  +  1695  M23/37 family peptidase  YP_018546  unclonable  0.00000000402629  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_1995  CDS  NC_007530  1877117  1878277  +  1161  protease  YP_018641  unclonable  0.0000000000762612  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_2165  CDS  NC_007530  2017833  2018564  +  732  hypothetical protein  YP_018808  unclonable  0.00000000000608319  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_2186  CDS  NC_007530  2039610  2040908  +  1299  aspartyl-tRNA synthetase  YP_018827  unclonable  0.000000000172174  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_2251  CDS  NC_007530  2099601  2101502  +  1902  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  YP_018897  unclonable  0.0000000160892  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_2484  CDS  NC_007530  2311483  2311890  +  408  hypothetical protein  YP_019123  unclonable  0.0000000000000939903  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_2528  CDS  NC_007530  2351179  2352411  +  1233  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  YP_019166  unclonable  0.0000000000564272  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_2814  CDS  NC_007530  2607908  2609977  -  2070  uvrD/Rep helicase family protein  YP_019456  unclonable  0.0000000183326  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_2944  CDS  NC_007530  2708767  2709594  +  828  polysaccharide deacetylase  YP_019585  unclonable  0.00000000000517931  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_2997  CDS  NC_007530  2764500  2765249  -  750  IclR family transcriptional regulator  YP_019640  unclonable  0.00000000000512601  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_2998  CDS  NC_007530  2765517  2766941  +  1425  amino acid permease family protein  YP_019641  unclonable  0.000000000337351  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_3595  CDS  NC_007530  3299990  3300880  -  891  BNR repeat-containing protein  YP_020230  unclonable  0.0000000000028959  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_3596  CDS  NC_007530  3300906  3301349  -  444  flavodoxin  YP_020231  unclonable  0.000000000000203482  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_3597  CDS  NC_007530  3301491  3302111  -  621  hypothetical protein  YP_020232  unclonable  0.00000000000113907  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_3742  CDS  NC_007530  3442945  3443166  -  222  hypothetical protein  YP_020380  unclonable  0.0000000000000939903  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_3766  CDS  NC_007530  3460577  3460801  -  225  hypothetical protein  YP_022656  unclonable  0.000000000000141795  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_3767  CDS  NC_007530  3460862  3461794  -  933  prophage lambdaba01, n-acetylmuramoyl-l-alanine amidase family protein 2  YP_020403  unclonable  0.0000000000174527  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_3799  CDS  NC_007530  3484566  3485549  -  984  hypothetical protein  YP_020431  unclonable  0.0000000000157836  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_3858  CDS  NC_007530  3530610  3530882  +  273  DNA-binding protein HU  YP_020495  unclonable  0.0000000000000587043  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_3915  intron  NC_007530  3590395  3591753  -  1359      unclonable  0.000000000162036  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_3936  CDS  NC_007530  3612602  3613834  -  1233  aspartate kinase I  YP_020576  unclonable  0.000000000118555  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_3966  CDS  NC_007530  3643254  3644033  -  780  transcriptional repressor CodY  YP_020605  unclonable  0.00000000000207979  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_3977  CDS  NC_007530  3655622  3656173  -  552  signal peptidase I S  YP_020616  unclonable  0.000000000000843557  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_3978  CDS  NC_007530  3656275  3656619  -  345  50S ribosomal protein L19  YP_020617  unclonable  0.000000000000147607  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_3979  CDS  NC_007530  3656766  3657500  -  735  tRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  YP_020618  unclonable  0.00000000000280936  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_3980  CDS  NC_007530  3657500  3658015  -  516  16S rRNA-processing protein RimM  YP_020619  unclonable  0.00000000000074804  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_3981  CDS  NC_007530  3658136  3658363  -  228  kh domain-containing protein  YP_020620  unclonable  0.000000000000103911  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_3982  CDS  NC_007530  3658378  3658650  -  273  30S ribosomal protein S16  YP_020621  unclonable  0.000000000000152128  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_3983  CDS  NC_007530  3658751  3660100  -  1350  signal recognition particle protein  YP_020622  unclonable  0.000000000408298  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_3995  CDS  NC_007530  3673805  3674167  -  363  hypothetical protein  YP_020635  unclonable  0.000000000000107112  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_3996  CDS  NC_007530  3674546  3674734  +  189  50S ribosomal protein L28  YP_020636  unclonable  0.0000000000000359454  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_4042  CDS  NC_007530  3720723  3721502  -  780  sporulation sigma factor SigG  YP_020684  unclonable  0.00000000000307551  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_4376  CDS  NC_007530  3991199  3991978  -  780  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  YP_021021  unclonable  0.00000000000139221  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_4399  CDS  NC_007530  4014176  4015015  -  840  hemolysin A  YP_021043  unclonable  0.00000000000782309  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_4469  CDS  NC_007530  4063442  4064836  +  1395  sodium:dicarboxylate symporter family protein  YP_021112  unclonable  0.000000000172174  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_4509  CDS  NC_007530  4102271  4103581  -  1311  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  YP_021153  unclonable  0.000000000163692  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_4515  CDS  NC_007530  4108345  4109466  -  1122  RNA polymerase sigma factor RpoD  YP_021160  unclonable  0.0000000000315443  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_4538  CDS  NC_007530  4126334  4127449  -  1116  chaperone protein DnaJ  YP_021184  unclonable  0.0000000000345209  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_4630  CDS  NC_007530  4206590  4207357  -  768  hesA/moeB/thiF family protein  YP_021278  unclonable  0.00000000000445557  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_4819  CDS  NC_007530  4380762  4381322  -  561  translation initiation factor IF-3  YP_021465  unclonable  0.000000000000690292  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_4825  CDS  NC_007530  4388318  4388710  -  393  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  YP_021471  unclonable  0.000000000000134857  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_4826  CDS  NC_007530  4388865  4388999  -  135  hypothetical protein  YP_022703  unclonable  0.0000000000000211504  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_4827  CDS  NC_007530  4389091  4390119  -  1029  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  YP_021472  unclonable  0.000000000027958  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_5298  CDS  NC_007530  4799621  4800802  -  1182  NupC family nucleoside transporter  YP_021956  unclonable  0.0000000000710562  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_5301  CDS  NC_007530  4804400  4805830  -  1431  sodium/alanine symporter family protein  YP_021959  unclonable  0.000000000212742  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_5345  CDS  NC_007530  4844804  4845433  -  630  hypothetical protein  YP_022003  unclonable  0.00000000000140645  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_5508  CDS  NC_007530  4995230  4995664  -  435  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  YP_022174  unclonable  0.000000000000439699  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_5564  CDS  NC_007530  5050590  5050976  +  387  hypothetical protein  YP_022232  unclonable  0.000000000000197435  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_5668  CDS  NC_007530  5152193  5153392  -  1200  major facilitator family transporter  YP_022348  unclonable  0.0000000000480591  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_5716  CDS  NC_007530  5207311  5208600  -  1290  adenylosuccinate synthetase  YP_022402  unclonable  0.000000000188586  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_5717  CDS  NC_007530  5208816  5210177  -  1362  replicative DNA helicase  YP_022403  unclonable  0.000000000293177  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_pXO1_0199  CDS  NC_007322  166698  167747  +  1050  hypothetical protein  YP_022460  unclonable  1.3269600000000002e-32  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
tRNA-Arg-3  tRNA  NC_007530  4287628  4287704  -  77  tRNA-Arg    unclonable  0.0000000000000137515  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
tRNA-Gln-2  tRNA  NC_007530  245551  245625  +  75  tRNA-Gln    unclonable  0.0000000000000106014  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
tRNA-Gly-6  tRNA  NC_007530  4287706  4287779  -  74  tRNA-Gly    unclonable  0.0000000000000146044  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>