44 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Psyc_0001  CDS  NC_007204  520  1965  +  1446  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_263309  hitchhiker  0.0000000168448  unclonable  0.00000204804  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0002  CDS  NC_007204  2125  3300  +  1176  DNA polymerase III, beta subunit  YP_263310  hitchhiker  0.0000000000104576  unclonable  0.00000179673  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0003  CDS  NC_007204  3463  4677  +  1215  DNA replication and repair protein RecF  YP_263311  hitchhiker  0.00736355  unclonable  0.00000172391  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0162  CDS  NC_007204  187480  189006  +  1527  exopolyphosphatase  YP_263469  normal  1  unclonable  0.00000221963  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0163  CDS  NC_007204  189235  190038  +  804  acetyl-coenzyme A carboxylase carboxyl transferase subunit alpha  YP_263470  normal  1  unclonable  0.00000143666  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0164  CDS  NC_007204  190316  191893  +  1578  hypothetical protein  YP_263471  normal  0.156481  unclonable  0.00000174204  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0402  CDS  NC_007204  502506  503840  +  1335  hypothetical protein  YP_263703  unclonable  0.00000000000118923  unclonable  0.000000857241  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0573  CDS  NC_007204  677216  678583  -  1368  macrolide secretion protein MacA  YP_263868  unclonable  0.00000000000123833  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0984  CDS  NC_007204  1179272  1179640  -  369  hypothetical protein  YP_264271  hitchhiker  0.0000000000010147  unclonable  0.00000139166  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0985  CDS  NC_007204  1180570  1180917  +  348  DNA binding protein  YP_264272  hitchhiker  0.0000000000123712  unclonable  0.0000012964  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0986  CDS  NC_007204  1180939  1181484  +  546  neutral zinc metallopeptidase  YP_264273  hitchhiker  0.000000837307  unclonable  0.00000139166  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0987  CDS  NC_007204  1181960  1182868  -  909  hypothetical protein  YP_264274  hitchhiker  0.0025318  unclonable  0.0000015741  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0988  CDS  NC_007204  1182865  1183734  -  870  hypothetical protein  YP_264275  normal  0.140861  unclonable  0.00000155773  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0989  CDS  NC_007204  1184381  1185100  -  720  S24 family peptidase  YP_264276  normal  1  unclonable  0.00000125637  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_1203  CDS  NC_007204  1444480  1446306  +  1827  aspartyl-tRNA synthetase  YP_264488  unclonable  0.000000000120939  decreased coverage  0.0042207  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_1270  CDS  NC_007204  1527217  1528545  -  1329  serine protease  YP_264554  unclonable  0.000000000000478038  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_1308  CDS  NC_007204  1576097  1577014  -  918  hypothetical protein  YP_264592  unclonable  0.0000000000000275009  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_1329  CDS  NC_007204  1605538  1606278  -  741  TetR family transcriptional regulator  YP_264613  unclonable  0.00000000000000704239  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_1403  CDS  NC_007204  1697731  1698927  +  1197  aromatic amino acid aminotransferase  YP_264685  unclonable  0.000000000000415206  normal  0.0752089  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_1466  CDS  NC_007204  1779392  1780114  +  723  hypothetical protein  YP_264748  unclonable  0.00000000000000205564  hitchhiker  0.0000276724  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_1468  CDS  NC_007204  1783417  1785900  +  2484  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  YP_264750  normal  0.614381  unclonable  0.0000024056  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_1469  CDS  NC_007204  1786000  1786875  +  876  hypothetical protein  YP_264751  normal  1  unclonable  0.00000125637  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_1470  CDS  NC_007204  1786992  1787918  +  927  ribosomal protein L11 methyltransferase  YP_264752  normal  0.456616  unclonable  0.00000118267  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_1471  CDS  NC_007204  1788227  1788586  +  360  Fis-type transcriptional activator  YP_264753  normal  0.161075  unclonable  0.000000848327  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_1472  CDS  NC_007204  1788784  1790364  +  1581  bifunctional phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase/IMP cyclohydrolase  YP_264754  normal  0.255919  unclonable  0.00000132318  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_1473  CDS  NC_007204  1790558  1792432  -  1875  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  YP_264755  hitchhiker  0.000000000182317  unclonable  0.00000148108  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_1633  CDS  NC_007204  2019038  2019757  +  720  ribonuclease T  YP_264915  unclonable  0.00000000000000360038  hitchhiker  0.000696557  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_1634  CDS  NC_007204  2020398  2021243  -  846  nucleotidylyl transferase, pyrophosphorylase  YP_264916  unclonable  0.0000000000000137687  hitchhiker  0.000684892  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_1635  CDS  NC_007204  2021356  2021664  -  309  cell division protein FtsB  YP_264917  unclonable  9.0689e-17  hitchhiker  0.000571859  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_1642  CDS  NC_007204  2030108  2031205  -  1098  porin  YP_264924  unclonable  0.0000000000000869717  unclonable  0.00000125637  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_1643  CDS  NC_007204  2031762  2033966  -  2205  malate synthase G  YP_264925  hitchhiker  0.0049939  unclonable  0.00000183387  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_1744  CDS  NC_007204  2147782  2148744  -  963  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase  YP_265026  unclonable  0.000000000000048167  normal  0.132089  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_1745  CDS  NC_007204  2149177  2150373  -  1197  cell division protein FtsZ  YP_265027  unclonable  0.00000000000013123  normal  0.221257  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_1894  CDS  NC_007204  2338442  2339632  -  1191  elongation factor Tu  YP_265176  unclonable  0.000000000000375523  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_1910  CDS  NC_007204  2358027  2359046  +  1020  carbohydrate kinase  YP_265192  unclonable  0.0000000000000704659  hitchhiker  0.00127543  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_1970  CDS  NC_007204  2429332  2430543  -  1212  tyrosyl-tRNA synthetase  YP_265251  normal  0.362658  unclonable  0.00000174204  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_1971  CDS  NC_007204  2430663  2432063  +  1401  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  YP_265252  hitchhiker  0.0000301173  unclonable  0.00000139166  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_1972  CDS  NC_007204  2432160  2433575  +  1416  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase II  YP_265253  decreased coverage  0.000000000116517  unclonable  0.00000139166  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_2047  CDS  NC_007204  2516655  2517563  -  909  DNA/RNA non-specific endonuclease (Mg-dependent)  YP_265328  unclonable  0.000000000000019362  normal  1  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_2144  CDS  NC_007204  2647569  2649266  -  1698  putative inner membrane protein translocase component YidC  YP_265425  hitchhiker  0.00651842  unclonable  0.00000165557  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_2145  CDS  NC_007204  2649484  2649858  -  375  hypothetical protein  YP_265426  hitchhiker  0.0000000165245  unclonable  0.00000111229  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_2146  CDS  NC_007204  2649860  2650231  -  372  ribonuclease P protein component  YP_265427  hitchhiker  0.0000000000164935  unclonable  0.0000011472  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_2147  CDS  NC_007204  2650418  2650552  -  135  50S ribosomal protein L34  YP_265428  unclonable  2.00251e-17  unclonable  0.00000111229  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_R0043  tRNA  NC_007204  2019984  2020059  +  76  tRNA-Glu    unclonable  7.66398e-18  hitchhiker  0.000611065  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>