121 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
DET0041  CDS  NC_002936  35760  36266  -  507  quinone methlytransferase  YP_180796  unclonable  0.00000105816  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0042  CDS  NC_002936  36271  36363  -  93  hypothetical protein  YP_180797  unclonable  0.000000126857  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0043  CDS  NC_002936  36374  36568  -  195  hypothetical protein  YP_180798  unclonable  0.000000220124  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0044  CDS  NC_002936  36711  37082  +  372  hypothetical protein  YP_180799  unclonable  0.000000336906  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0045  CDS  NC_002936  37216  37662  +  447  redox family protein  YP_180800  unclonable  0.000000553397  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0046  CDS  NC_002936  37659  38762  -  1104  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  YP_180801  unclonable  0.00000860975  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0057  CDS  NC_002936  51068  53542  +  2475  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  YP_180810  unclonable  0.00724799  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0334  CDS  NC_002936  318432  319913  -  1482  polyA polymerase family protein  YP_181081  unclonable  0.0000707313  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0340  CDS  NC_002936  324652  325080  +  429  MraZ  YP_181087  unclonable  0.000000320074  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0341  CDS  NC_002936  325087  326136  +  1050  S-adenosyl-methyltransferase MraW  YP_181088  unclonable  0.00000642562  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0345  CDS  NC_002936  329593  331878  +  2286  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  YP_181092  unclonable  0.00309044  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0346  CDS  NC_002936  331885  331992  +  108  hypothetical protein  YP_181093  unclonable  0.0000000927006  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0347  CDS  NC_002936  332109  332693  +  585  hypothetical protein  YP_181094  unclonable  0.00000102624  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0348  CDS  NC_002936  332662  334296  +  1635  radical SAM domain-containing protein  YP_181095  unclonable  0.000123778  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0349  CDS  NC_002936  334345  334794  -  450  GatB/YqeY domain-containing protein  YP_181096  unclonable  0.000000526076  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0350  CDS  NC_002936  334797  334991  -  195  30S ribosomal protein S21  YP_181097  unclonable  0.000000144824  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0351  CDS  NC_002936  335166  335396  -  231  hypothetical protein  YP_181098  unclonable  0.00000017069  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0352  CDS  NC_002936  335508  336938  -  1431  hypothetical protein  YP_181099  unclonable  0.0000516311  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0353  CDS  NC_002936  337146  337487  +  342  hypothetical protein  YP_181100  unclonable  0.00000018318  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0354  CDS  NC_002936  337471  338382  +  912  phage domain-containing protein  YP_181101  unclonable  0.00000288808  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0364  CDS  NC_002936  344622  345755  +  1134  carboxyl-terminal protease  YP_181110  unclonable  0.0000110985  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0377  CDS  NC_002936  358588  359325  -  738  30S ribosomal protein S2  YP_181123  unclonable  0.00000247942  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0383  CDS  NC_002936  364790  365560  +  771  hypothetical protein  YP_181128  unclonable  0.00000258226  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0384  CDS  NC_002936  365645  366790  -  1146  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  YP_181129  unclonable  0.0000205726  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0391  CDS  NC_002936  371093  372919  -  1827  ATP-dependent metalloprotease FtsH  YP_181136  unclonable  0.000322193  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0419  CDS  NC_002936  394234  395016  -  783  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  YP_181164  unclonable  0.00000266261  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0420  CDS  NC_002936  395060  395170  -  111  hypothetical protein  YP_181165  unclonable  0.000000097573  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0421  CDS  NC_002936  395219  396058  -  840  degV family protein  YP_181166  unclonable  0.00000322806  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0428  CDS  NC_002936  400891  401667  +  777  pantothenate kinase  YP_181172  unclonable  0.00000188548  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0429  CDS  NC_002936  401769  402950  +  1182  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase  YP_181173  unclonable  0.0000160974  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0459  CDS  NC_002936  433005  433328  -  324  hypothetical protein  YP_181203  unclonable  0.000000607041  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0469  CDS  NC_002936  442098  442214  +  117  hypothetical protein  YP_181213  unclonable  0.000000137676  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0470  CDS  NC_002936  442383  442817  +  435  30S ribosomal protein S12  YP_181214  unclonable  0.000000814349  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0487  CDS  NC_002936  451853  452038  +  186  30S ribosomal protein S14  YP_181231  unclonable  0.000000160451  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0497  CDS  NC_002936  457298  457519  +  222  translation initiation factor IF-1  YP_181241  unclonable  0.000000154065  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0498  CDS  NC_002936  457548  457661  +  114  50S ribosomal protein L36  YP_181242  unclonable  0.0000000794474  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0499  CDS  NC_002936  457671  458060  +  390  30S ribosomal protein S13  YP_181243  unclonable  0.000000323492  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0500  CDS  NC_002936  458086  458478  +  393  30S ribosomal protein S11  YP_181244  unclonable  0.000000251151  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0555    NC_002936  513056  513484  +  429      unclonable  0.000000438313  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0556  CDS  NC_002936  513481  513648  -  168  hypothetical protein  YP_181299  unclonable  0.000000136222  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0557  CDS  NC_002936  513683  513916  +  234  hypothetical protein  YP_181300  unclonable  0.000000213486  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0568  CDS  NC_002936  521409  521657  -  249  30S ribosomal protein S16  YP_181311  unclonable  0.00000021123  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0569  CDS  NC_002936  521809  522474  +  666  endonuclease V  YP_181312  unclonable  0.00000150735  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0589  CDS  NC_002936  539264  540442  -  1179  tubulin/FtsZ family protein  YP_181331  unclonable  0.0000157682  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0627  CDS  NC_002936  580984  582333  +  1350  hypothetical protein  YP_181369  unclonable  0.0000326555  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0708  CDS  NC_002936  654040  655836  +  1797  aspartyl-tRNA synthetase  YP_181449  unclonable  0.000309343  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0734  CDS  NC_002936  676613  676999  +  387  hypothetical protein  YP_181470  unclonable  0.000000750313  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0766  CDS  NC_002936  703728  705854  -  2127  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  YP_181498  unclonable  0.0013002  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0767  CDS  NC_002936  706040  706270  +  231  ATPase, C subunit family protein  YP_181499  unclonable  0.000000160451  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0768  CDS  NC_002936  706346  706675  -  330  hypothetical protein  YP_181500  unclonable  0.000000286376  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0799  CDS  NC_002936  735412  735594  -  183  hypothetical protein  YP_181531  unclonable  0.000000163895  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0800  CDS  NC_002936  735677  736009  +  333  hypothetical protein  YP_181532  unclonable  0.000000298248  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0834  CDS  NC_002936  762697  764364  -  1668  dihydroxy-acid dehydratase  YP_181561  unclonable  0.00030605  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0835  CDS  NC_002936  764466  765107  -  642  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  YP_181562  unclonable  0.00000200463  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0846  CDS  NC_002936  775743  776981  -  1239  histidyl-tRNA synthetase, putative  YP_181573  unclonable  0.0000126725  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0859  CDS  NC_002936  785976  787793  +  1818  GTP-binding protein LepA  YP_181585  unclonable  0.00045747  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0976  CDS  NC_002936  895517  896788  -  1272  adenylosuccinate synthetase  YP_181699  unclonable  0.0000393074  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0992  CDS  NC_002936  909962  910675  -  714  50S ribosomal protein L1  YP_181715  unclonable  0.00000282908  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0997  CDS  NC_002936  912110  913312  -  1203  elongation factor Tu  YP_181720  unclonable  0.0000193617  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1036  CDS  NC_002936  940140  940955  +  816  serine protease  YP_181752  unclonable  0.00000475095  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1045  CDS  NC_002936  949381  949788  -  408  single-strand binding protein  YP_181761  unclonable  0.000000383918  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1101  CDS  NC_002936  1004005  1004577  -  573  hypothetical protein  YP_181816  unclonable  0.00000139057  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1102  CDS  NC_002936  1004570  1005709  -  1140  hypothetical protein  YP_181817  unclonable  0.0000164334  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1134  CDS  NC_002936  1037633  1038214  -  582  hypothetical protein  YP_181849  unclonable  0.00000076644  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1184  CDS  NC_002936  1081773  1082420  -  648  BioY family protein  YP_181897  unclonable  0.00000330178  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1185  CDS  NC_002936  1082469  1082705  -  237  hypothetical protein  YP_181898  unclonable  0.000000480496  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1186  CDS  NC_002936  1082804  1083100  +  297  hypothetical protein  YP_181899  unclonable  0.000000564932  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1207  CDS  NC_002936  1104646  1105911  -  1266  protein export protein, putative  YP_181920  unclonable  0.0000285401  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1226  CDS  NC_002936  1124972  1125571  +  600  RdgB/HAM1 family non-canonical purine NTP pyrophosphatase  YP_181939  unclonable  0.00000113561  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1227  CDS  NC_002936  1125734  1126870  +  1137  DNA polymerase III, beta subunit  YP_181940  unclonable  0.0000128167  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1260  CDS  NC_002936  1146867  1148087  +  1221  argininosuccinate synthase  YP_181972  unclonable  0.0000184052  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1261  CDS  NC_002936  1148088  1149473  +  1386  argininosuccinate lyase  YP_181973  unclonable  0.0000476291  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1262  CDS  NC_002936  1149483  1149671  -  189  50S ribosomal protein L28  YP_181974  unclonable  0.000000202821  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1263  CDS  NC_002936  1149800  1151434  +  1635  DAK2 domain-containing protein  YP_181975  unclonable  0.000174743  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1285  CDS  NC_002936  1171954  1173138  -  1185  serine protease  YP_181997  unclonable  0.0000207933  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1286  CDS  NC_002936  1173221  1174039  -  819  serine protease  YP_181998  unclonable  0.00000322806  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1294  CDS  NC_002936  1179908  1180450  -  543  DNA-binding response regulator  YP_182006  unclonable  0.00000125664  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1325  CDS  NC_002936  1203133  1203531  +  399  50S ribosomal protein L21  YP_182036  unclonable  0.000000243577  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1360  CDS  NC_002936  1231137  1231481  -  345  general secretion family protein  YP_182071  unclonable  0.000000388019  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1361  CDS  NC_002936  1231597  1231695  -  99  hypothetical protein  YP_182072  unclonable  0.000000152437  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1362  CDS  NC_002936  1231704  1232471  +  768  type IV prepilin leader peptidase family protein  YP_182073  unclonable  0.00000297795  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1363  CDS  NC_002936  1232590  1234674  +  2085  bifunctional mannosyl-3-phosphoglycerate synthase/mannosyl-3 phosphoglycerate phosphatase  YP_182074  unclonable  0.0011007  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1371  CDS  NC_002936  1239268  1239840  +  573  NADPH-dependent FMN reductase  YP_182082  unclonable  0.000000814349  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1375  CDS  NC_002936  1241981  1242883  +  903  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  YP_182086  unclonable  0.00000447138  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1383    NC_002936  1249670  1251218  -  1549      unclonable  0.000117498  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1384  CDS  NC_002936  1251240  1251518  -  279  preprotein translocase, YajC subunit  YP_182094  unclonable  0.000000396106  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1385  CDS  NC_002936  1251529  1252785  -  1257  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  YP_182095  unclonable  0.0000358756  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1404  CDS  NC_002936  1272059  1272556  +  498  hypothetical protein  YP_182113  unclonable  0.000000594645  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1405  CDS  NC_002936  1272585  1272734  -  150  hypothetical protein  YP_182114  unclonable  0.000000122956  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1406  CDS  NC_002936  1272745  1272846  -  102  hypothetical protein  YP_182115  unclonable  0.0000000836227  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1408    NC_002936  1276341  1277616  -  1276      unclonable  0.0000173103  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1437  CDS  NC_002936  1307586  1307816  +  231  hypothetical protein  YP_182145  unclonable  0.000000241003  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1438  CDS  NC_002936  1307826  1308149  +  324  hypothetical protein  YP_182146  unclonable  0.000000264193  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1443  CDS  NC_002936  1308641  1308799  -  159  hypothetical protein  YP_182147  unclonable  0.0000000946312  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1445  CDS  NC_002936  1309438  1309995  +  558  hypothetical protein  YP_182148  unclonable  0.000000632214  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1448  CDS  NC_002936  1310633  1310773  -  141  hypothetical protein  YP_182151  unclonable  0.0000000871419  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1449  CDS  NC_002936  1310864  1311475  -  612  MarC membrane protein  YP_182152  unclonable  0.000000727679  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1456  CDS  NC_002936  1315300  1315881  +  582  2'-5' RNA ligase family protein  YP_182159  unclonable  0.000000758334  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1457  CDS  NC_002936  1315953  1316156  +  204  hypothetical protein  YP_182160  unclonable  0.000000107901  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1458  CDS  NC_002936  1316196  1316897  +  702  comF family protein, putative  YP_182161  unclonable  0.00000115929  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>