59 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
AFE_0252  CDS  NC_011761  228273  229289  +  1017  CDP-6-deoxy-L-threo-D-glycero-4-hexulose-3- dehydrase reductase, putative  YP_002424759  unclonable  0.00410911  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0253  CDS  NC_011761  229352  229720  +  369  hypothetical protein  YP_002424760  unclonable  0.00023327  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0306  CDS  NC_011761  274144  274797  -  654  OmpA family protein  YP_002424813  unclonable  0.000558154  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0307  CDS  NC_011761  274789  274986  +  198  hypothetical protein  YP_002424814  unclonable  0.0000963451  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0308  tRNA  NC_011761  275027  275111  +  85  tRNA-Tyr    unclonable  0.0000522223  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0367  CDS  NC_011761  314585  315328  -  744  AhpC/TSA family/glutaredoxin domain protein  YP_002424870  unclonable  0.000740319  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0368  CDS  NC_011761  315464  316447  -  984  phosphoserine phosphatase  YP_002424871  unclonable  0.00427946  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0382  CDS  NC_011761  331796  332839  +  1044  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  YP_002424884  unclonable  0.00597114  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0522  CDS  NC_011761  453529  454305  -  777  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, PPIC-type  YP_002425014  unclonable  0.000852615  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0530  CDS  NC_011761  463114  464055  -  942  carbohydrate kinase, PfkB family  YP_002425022  unclonable  0.00148509  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0536  CDS  NC_011761  468611  469483  +  873  phosphoribulokinase  YP_002425028  unclonable  0.00207145  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0544  CDS  NC_011761  476519  477349  -  831  hypothetical protein  YP_002425036  unclonable  0.00193081  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0569  CDS  NC_011761  506987  507832  +  846  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family  YP_002425061  unclonable  0.00260954  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0995  CDS  NC_011761  909231  910280  -  1050  site-specific recombinase, phage integrase family  YP_002425468  unclonable  0.00503137  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0996  CDS  NC_011761  910130  910489  -  360  DNA binding protein, excisionase family  YP_002425469  unclonable  0.000176087  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0997  CDS  NC_011761  910510  910932  -  423  hypothetical protein  YP_002425470  unclonable  0.000287867  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_0998  CDS  NC_011761  911295  912026  -  732  transcriptional regulator, putative  YP_002425471  unclonable  0.000689636  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_1044  CDS  NC_011761  942655  942924  -  270  hypothetical protein  YP_002425516  unclonable  0.000183384  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_1045  CDS  NC_011761  942952  943341  +  390  hypothetical protein  YP_002425517  unclonable  0.000366285  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_1051  CDS  NC_011761  947295  947564  +  270  hypothetical protein  YP_002425523  unclonable  0.0000888837  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_1052  CDS  NC_011761  947587  947796  +  210  hypothetical protein  YP_002425524  unclonable  0.0000748972  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_1072  CDS  NC_011761  966834  967562  +  729  hypothetical protein  YP_002425544  unclonable  0.000933482  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_1073  CDS  NC_011761  967633  968574  +  942  BRO family protein  YP_002425545  unclonable  0.00174599  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_1074  CDS  NC_011761  968571  968825  +  255  hypothetical protein  YP_002425546  unclonable  0.0000828244  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_1075  CDS  NC_011761  968890  970008  +  1119  hypothetical protein  YP_002425547  unclonable  0.00702033  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_1085  CDS  NC_011761  976486  977310  +  825  thiol:disulfide interchange domain protein  YP_002425557  unclonable  0.00153173  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_1145  CDS  NC_011761  1022137  1023042  -  906  tyrosine recombinase, phage integrase family  YP_002425617  unclonable  0.00135559  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_1146  CDS  NC_011761  1023249  1023611  +  363  hypothetical protein  YP_002425618  unclonable  0.000174281  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_1147  CDS  NC_011761  1023623  1023889  +  267  hypothetical protein  YP_002425619  unclonable  0.000115522  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_1197  CDS  NC_011761  1036579  1037418  -  840  hypothetical protein  YP_002425634  unclonable  0.00120009  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_1221  CDS  NC_011761  1075392  1076006  -  615  modification methylase, putative  YP_002425657  unclonable  0.000763333  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_1222  CDS  NC_011761  1076212  1076925  +  714  hypothetical protein  YP_002425658  unclonable  0.00121289  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_1223  CDS  NC_011761  1076987  1077580  -  594  hypothetical protein  YP_002425660  unclonable  0.000755507  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_1224  CDS  NC_011761  1076934  1077062  +  129  hypothetical protein  YP_002425659  unclonable  0.0000811597  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_1225  CDS  NC_011761  1077701  1077793  -  93  hypothetical protein  YP_002425661  unclonable  0.0000549164  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_1244  CDS  NC_011761  1090726  1091016  -  291  hypothetical protein  YP_002425680  unclonable  0.000149959  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_1245  CDS  NC_011761  1091016  1091528  -  513  hypothetical protein  YP_002425681  unclonable  0.000341314  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_1498  CDS  NC_011761  1299188  1300111  -  924  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  YP_002425926  unclonable  0.00436727  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_1557  CDS  NC_011761  1348643  1348876  -  234  hypothetical protein  YP_002425985  unclonable  0.000105482  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_1559  CDS  NC_011761  1349087  1349365  +  279  hypothetical protein  YP_002425986  unclonable  0.000127709  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_1560  CDS  NC_011761  1349368  1349706  +  339  hypothetical protein  YP_002425987  unclonable  0.000179699  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_1583  CDS  NC_011761  1373270  1373593  +  324  integration host factor, alpha subunit, putative  YP_002426010  unclonable  0.000127709  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_1584  CDS  NC_011761  1373660  1373935  +  276  DNA-binding protein HU family protein  YP_002426011  unclonable  0.000100307  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_1693  CDS  NC_011761  1465595  1466452  +  858  hypothetical protein  YP_002426115  unclonable  0.00150047  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_1783  CDS  NC_011761  1547506  1548657  +  1152  glutamate 5-kinase  YP_002426201  unclonable  0.00674296  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_1881  CDS  NC_011761  1638285  1639073  +  789  hypothetical protein  YP_002426295  unclonable  0.00135559  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_1922  CDS  NC_011761  1673774  1674991  +  1218  ammonium transporter family protein  YP_002426331  unclonable  0.00667378  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_2019  CDS  NC_011761  1764539  1765516  -  978  hypothetical protein  YP_002426423  unclonable  0.00266391  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_2369  CDS  NC_011761  2116745  2117047  -  303  transcriptional regulator, ArsR family  YP_002426759  unclonable  0.000230878  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_2811  CDS  NC_011761  2497202  2497507  -  306  lipoprotein, putative  YP_002427181  unclonable  0.000106575  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_2940  CDS  NC_011761  2627701  2628435  +  735  TonB-dependent receptor domain protein  YP_002427307  unclonable  0.00105315  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_2941  CDS  NC_011761  2629162  2629293  -  132  hypothetical protein  YP_002427309  unclonable  0.0000898042  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_2942  CDS  NC_011761  2628629  2629207  +  579  hypothetical protein  YP_002427308  unclonable  0.000655601  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_3145  CDS  NC_011761  2828694  2828810  -  117  hypothetical protein  YP_002427507  unclonable  0.0000845231  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_3146  CDS  NC_011761  2828862  2829425  -  564  rusticyanin  YP_002427508  unclonable  0.000525489  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_3147  CDS  NC_011761  2829793  2829987  -  195  cytochrome c oxidase, aa3-type, subunit IV  YP_002427509  unclonable  0.000109854  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_3148  CDS  NC_011761  2830028  2830582  -  555  cytochrome c oxidase, aa3-type, subunit III  YP_002427510  unclonable  0.000456698  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_3240  CDS  NC_011761  2917446  2917973  -  528  Rrf2 family protein  YP_002427593  unclonable  0.000396914  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
AFE_3295  CDS  NC_011761  2969801  2970685  -  885  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  YP_002427648  unclonable  0.00238421  n/a    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>