70 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Ava_0083  CDS  NC_007413  106817  112159  +  5343  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  YP_320604  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0434  CDS  NC_007413  553560  555584  +  2025  Serine/threonine protein kinase  YP_320955  unclonable  0.000000000341904  normal  0.409693  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0711  CDS  NC_007413  885325  885549  +  225  translation initiation factor IF-1  YP_321230  unclonable  0.0000000000000362397  normal  1  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0744  CDS  NC_007413  917927  918982  +  1056  anti-sigma-factor antagonist (STAS) and sugar transfersase  YP_321263  unclonable  0.00000000000102583  normal  1  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0781  CDS  NC_007413  958604  959608  -  1005  phosphoribulokinase  YP_321300  unclonable  0.0000000000028784  unclonable  0.0000000817454  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0782  CDS  NC_007413  960777  962099  +  1323  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  YP_321301  hitchhiker  0.00024869  unclonable  0.0000000785266  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0783  CDS  NC_007413  962323  963612  +  1290  homoserine dehydrogenase  YP_321302  hitchhiker  0.00270854  unclonable  0.0000000575852  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0885  CDS  NC_007413  1081570  1082124  -  555  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  YP_321404  normal  1  unclonable  0.000000127189  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0886  CDS  NC_007413  1082262  1082498  +  237  hypothetical protein  YP_321405  normal  1  unclonable  0.000000120945  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0887  CDS  NC_007413  1082593  1083087  +  495  acetyltransferase  YP_321406  normal  1  unclonable  0.000000133756  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0888  CDS  NC_007413  1083128  1083703  +  576  hypothetical protein  YP_321407  normal  1  unclonable  0.000000142126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0889  CDS  NC_007413  1083841  1084290  +  450  hypothetical protein  YP_321408  normal  1  unclonable  0.000000137854  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0890  CDS  NC_007413  1084547  1085539  -  993  MscS mechanosensitive ion channel  YP_321409  normal  1  unclonable  0.000000201965  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0891  CDS  NC_007413  1085628  1085747  -  120  potassium channel protein  YP_321410  normal  1  unclonable  0.000000139287  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_1060  CDS  NC_007413  1290899  1291492  -  594  hypothetical protein  YP_321579  unclonable  0.000000000000122836  decreased coverage  0.00000222645  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_1357  CDS  NC_007413  1673689  1674303  -  615  hypothetical protein  YP_321876  unclonable  0.0000000000002681  normal  0.0119499  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_1461  CDS  NC_007413  1801932  1802975  -  1044  rod shape-determining protein MreB  YP_321979  hitchhiker  0.000000000397491  unclonable  0.000000242005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_1462  CDS  NC_007413  1803310  1803672  +  363  single-stranded DNA-binding protein  YP_321980  unclonable  0.0000000000000299636  hitchhiker  0.000565917  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_1463  CDS  NC_007413  1803736  1804482  -  747  hypothetical protein  YP_321981  unclonable  0.000000000000388338  hitchhiker  0.000639516  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_1466  CDS  NC_007413  1809178  1811061  +  1884  cell wall hydrolase/autolysin  YP_321984  unclonable  0.000000000100817  normal  0.166489  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_1505  CDS  NC_007413  1852432  1853463  -  1032  30S ribosomal protein S1  YP_322023  unclonable  0.00000000000040832  normal  1  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_1506  CDS  NC_007413  1853791  1853898  -  108  photosystem II reaction center protein T  YP_322024  unclonable  0.00000000000000303065  normal  1  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_1507  CDS  NC_007413  1853989  1855518  -  1530  photosystem antenna protein-like  YP_322025  unclonable  0.0000000000124352  normal  1  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_1583  CDS  NC_007413  1954349  1955431  -  1083  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  YP_322101  unclonable  0.00000000000169219  normal  1  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_1597  CDS  NC_007413  1971884  1972966  -  1083  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  YP_322115  unclonable  0.00000000000196706  normal  1  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_1939  CDS  NC_007413  2408515  2408760  +  246  hypothetical protein  YP_322456  unclonable  0.0000000000000145773  normal  1  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_2013  CDS  NC_007413  2494737  2495102  -  366  hypothetical protein  YP_322530  unclonable  0.0000000000000489269  normal  1  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_2084  CDS  NC_007413  2574626  2576557  -  1932  Serine/threonine protein kinase  YP_322601  unclonable  0.0000000000649074  unclonable  0.000000262207  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_2085  CDS  NC_007413  2576722  2577210  +  489  hypothetical protein  YP_322602  hitchhiker  0.00000000089244  unclonable  0.000000103026  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_2086  CDS  NC_007413  2577482  2577778  -  297  hypothetical protein  YP_322603  hitchhiker  0.0000000544815  unclonable  0.0000000904049  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_2087  CDS  NC_007413  2578320  2578607  +  288  prevent-host-death protein  YP_322604  hitchhiker  0.000000757578  unclonable  0.0000000885843  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_2088  CDS  NC_007413  2578617  2578949  +  333  addiction module toxin, Txe/YoeB  YP_322605  hitchhiker  0.0000111653  unclonable  0.0000000950728  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_2089  CDS  NC_007413  2578953  2580866  -  1914  small GTP-binding protein domain-containing protein  YP_322606  hitchhiker  0.000643797  unclonable  0.000000212393  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_2365  CDS  NC_007413  2945263  2946414  +  1152  hypothetical protein  YP_322878  unclonable  0.00000000000580643  normal  1  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_2410  CDS  NC_007413  2998069  2998956  -  888  peptidoglycan-binding LysM  YP_322922  hitchhiker  0.000688679  unclonable  0.000000112748  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_2411  CDS  NC_007413  2999314  3000519  +  1206  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  YP_322923  hitchhiker  0.00000241562  unclonable  0.000000145022  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_2412  CDS  NC_007413  3000591  3000935  -  345  hypothetical protein  YP_322924  hitchhiker  0.0000000914307  unclonable  0.0000000834111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_2413  CDS  NC_007413  3001113  3001646  -  534  condensin subunit ScpB  YP_322925  decreased coverage  0.00000000000581218  unclonable  0.0000000885843  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_2510  CDS  NC_007413  3103321  3105045  -  1725  S-layer region-like  YP_323020  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_2511  CDS  NC_007413  3105412  3105693  -  282  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  YP_323021  unclonable  0.0000000000000204873  normal  0.0924158  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_2512  CDS  NC_007413  3106302  3107357  -  1056  photosystem II reaction centre protein PsbD/D2  YP_323022  unclonable  0.00000000000139889  normal  0.112901  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_2899  CDS  NC_007413  3602972  3603640  +  669  hypothetical protein  YP_323405  hitchhiker  0.0000414809  unclonable  0.000000149465  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_2900  CDS  NC_007413  3604015  3604611  +  597  hypothetical protein  YP_323406  unclonable  0.000000000000121592  unclonable  0.000000137854  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_2901  CDS  NC_007413  3604710  3605522  +  813  pyrroline-5-carboxylate reductase  YP_323407  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_2902  CDS  NC_007413  3605669  3608350  +  2682  Type III restriction enzyme, res subunit  YP_323408  normal  1  unclonable  0.000000284094  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_2990  CDS  NC_007413  3708967  3710295  +  1329  Serine/threonine protein kinase  YP_323495  unclonable  0.0000000000108087  normal  0.539453  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_3195  CDS  NC_007413  3970284  3972548  +  2265  peptidoglycan-binding LysM  YP_323698  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_3315  CDS  NC_007413  4139371  4140591  +  1221  hypothetical protein  YP_323817  unclonable  0.00000000000305692  normal  0.429894  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_3731  CDS  NC_007413  4642256  4643272  +  1017  hypothetical protein  YP_324231  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_3972  CDS  NC_007413  4921847  4922332  +  486  hypothetical protein  YP_324472  unclonable  0.0000000000000622089  hitchhiker  0.00288517  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_4059  CDS  NC_007413  5044434  5046179  +  1746  S-layer region-like  YP_324558  unclonable  0.0000000000841951  normal  0.105376  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_4166  CDS  NC_007413  5215892  5216170  +  279  hypothetical protein  YP_324660  unclonable  0.0000000000000150238  decreased coverage  0.00000143914  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_4357  CDS  NC_007413  5463155  5463415  -  261  30S ribosomal protein S16  YP_324850  unclonable  0.00000000000000929169  normal  1  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_4400  CDS  NC_007413  5513198  5514070  +  873  hypothetical protein  YP_324893  unclonable  0.00000000000196706  unclonable  0.000000129781  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_4808  CDS  NC_007413  6042793  6043623  +  831  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  YP_325300  unclonable  0.000000000000603288  normal  0.956727  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_4861  CDS  NC_007413  6124393  6125838  -  1446  glutamyl-tRNA synthetase  YP_325353  unclonable  0.00000000000702508  unclonable  0.000000180865  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_4862  CDS  NC_007413  6126457  6127983  -  1527  Serine/threonine protein kinase  YP_325354  hitchhiker  0.0000000403484  unclonable  0.000000197931  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_4863  CDS  NC_007413  6128039  6129643  -  1605  Serine/threonine protein kinase  YP_325355  hitchhiker  0.00126679  unclonable  0.000000230163  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_4864  CDS  NC_007413  6129977  6131161  -  1185  hypothetical protein  YP_325356  normal  0.019631  unclonable  0.000000201965  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_4865  CDS  NC_007413  6131381  6132865  -  1485  hypothetical protein  YP_325357  normal  0.120137  unclonable  0.000000212393  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_4866  CDS  NC_007413  6132915  6134120  +  1206  aminotransferase, class V  YP_325358  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_4867  CDS  NC_007413  6134485  6135573  +  1089  HEAT repeat-containing PBS lyase  YP_325359  normal  0.116369  unclonable  0.000000150992  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_4868  CDS  NC_007413  6135836  6136450  +  615  hypothetical protein  YP_325360  normal  0.359447  unclonable  0.00000012465  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_4869  CDS  NC_007413  6136595  6137041  -  447  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  YP_325361  normal  0.536474  unclonable  0.0000000999645  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_4900  CDS  NC_007413  6168967  6171975  -  3009  ATPase, E1-E2 type  YP_325392  unclonable  0.0000000821628  normal  0.0255689  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_B0094  CDS  NC_007410  104475  105056  -  582  hypothetical protein  YP_319995  unclonable  0.0000000000049462  n/a    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_B0323  CDS  NC_007410  348500  349396  +  897  hypothetical protein  YP_320222  unclonable  0.0000000000250631  n/a    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_D0044  CDS  NC_014000  31145  33658  +  2514  hypothetical protein  YP_003541167  unclonable  0.00826544  n/a    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_R0019  tRNA  NC_007413  2494613  2494686  -  74  tRNA-Pro    unclonable  0.0000000000000100673  normal  1  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_R0059  tRNA  NC_007413  6126002  6126075  -  74  tRNA-Asp    unclonable  0.00000000000000338363  unclonable  0.0000000922471  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>