121 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BCE_0087  CDS  NC_003909  97325  98782  +  1458  glutamyl-tRNA synthetase  NP_976415  unclonable  0.0000000536948  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0093  CDS  NC_003909  102990  103649  +  660  RNA polymerase factor sigma-70  NP_976421  unclonable  0.000000000440627  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0094  CDS  NC_003909  103777  103923  +  147  50S ribosomal protein L33  NP_976422  unclonable  0.0000000000258554  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0095  CDS  NC_003909  103956  104135  +  180  preprotein translocase subunit SecE  NP_976423  unclonable  0.0000000000231467  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0096  CDS  NC_003909  104267  104800  +  534  transcription antitermination protein NusG  NP_976424  unclonable  0.000000000261698  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0097  CDS  NC_003909  104968  105393  +  426  50S ribosomal protein L11  NP_976425  unclonable  0.000000000212022  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0098  CDS  NC_003909  105571  106263  +  693  50S ribosomal protein L1  NP_976426  unclonable  0.000000000678721  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0104  CDS  NC_003909  115656  115937  +  282  hypothetical protein  NP_976432  unclonable  0.0000000000288714  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0107  CDS  NC_003909  117181  119259  +  2079  elongation factor G  NP_976435  unclonable  0.00000143993  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0108  CDS  NC_003909  119377  120564  +  1188  elongation factor Tu  NP_976436  unclonable  0.0000000077853  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0109  CDS  NC_003909  120965  121273  +  309  30S ribosomal protein S10  NP_976437  unclonable  0.0000000000877818  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0110  CDS  NC_003909  121308  121940  +  633  50S ribosomal protein L3  NP_976438  unclonable  0.000000000528056  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0111  CDS  NC_003909  121966  122589  +  624  50S ribosomal protein L4  NP_976439  unclonable  0.000000000572324  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0112  CDS  NC_003909  122589  122879  +  291  50S ribosomal protein L23  NP_976440  unclonable  0.0000000000886787  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0113  CDS  NC_003909  122908  123738  +  831  50S ribosomal protein L2  NP_976441  unclonable  0.00000000200839  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0114  CDS  NC_003909  123799  124077  +  279  30S ribosomal protein S19  NP_976442  unclonable  0.0000000000793752  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0115  CDS  NC_003909  124095  124436  +  342  50S ribosomal protein L22  NP_976443  unclonable  0.0000000000818335  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0123  CDS  NC_003909  127371  127556  +  186  30S ribosomal protein S14  NP_976451  unclonable  0.0000000000176609  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0124  CDS  NC_003909  127586  127984  +  399  30S ribosomal protein S8  NP_976452  unclonable  0.0000000000599604  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0133  CDS  NC_003909  132965  133183  +  219  translation initiation factor IF-1  NP_976461  unclonable  0.0000000000119555  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0134  CDS  NC_003909  133219  133332  +  114  50S ribosomal protein L36  NP_976462  unclonable  0.00000000000809318  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0135  CDS  NC_003909  133354  133719  +  366  30S ribosomal protein S13  NP_976463  unclonable  0.0000000000332211  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0197  CDS  NC_003909  204469  205281  -  813  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  NP_976525  unclonable  0.00000000066517  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0263  CDS  NC_003909  262378  263793  +  1416  amino acid permease  NP_976591  unclonable  0.0000000358452  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0369  CDS  NC_003909  388754  389902  -  1149  restriction endonuclease, putative  NP_976697  unclonable  0.0000000200287  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0375  CDS  NC_003909  393769  394857  +  1089  hypothetical protein  NP_976703  unclonable  0.0000000123702  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0376  CDS  NC_003909  394909  395457  +  549  hypothetical protein  NP_976704  unclonable  0.00000000043617  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0382  CDS  NC_003909  399794  400546  +  753  phage antirepressor protein, putative  NP_976710  unclonable  0.000000000707014  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0554  CDS  NC_003909  565387  566880  +  1494  PTS system, N-acetylglucosamine-specific IIBC component, putative  NP_976881  unclonable  0.0000000878879  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0597  CDS  NC_003909  613446  614222  +  777  penicillin-binding domain-containing protein  NP_976924  unclonable  0.00000000108833  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0614  CDS  NC_003909  631228  632778  -  1551  glycine betaine transporter  NP_976940  unclonable  0.00000015754  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0714  CDS  NC_003909  737076  737633  +  558  RNA polymerase sigma factor  NP_977039  unclonable  0.000000000248853  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0740  CDS  NC_003909  763103  765502  +  2400  immune inhibitor A metalloprotease  NP_977065  unclonable  0.0000142513  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0744  CDS  NC_003909  768953  769804  +  852  phospholipase C  NP_977069  unclonable  0.00000000141243  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0757  CDS  NC_003909  781246  782631  -  1386  proton/peptide symporter family protein  NP_977082  unclonable  0.0000000369558  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0758  CDS  NC_003909  782823  782921  +  99  hypothetical protein  NP_977083  unclonable  0.000000000025335  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0794  CDS  NC_003909  827353  828507  -  1155  M24/M37 family peptidase  NP_977118  unclonable  0.000000011526  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0878  CDS  NC_003909  903826  905460  -  1635  Na/Pi-cotransporter family protein  NP_977201  unclonable  0.000000242556  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0984  CDS  NC_003909  1009891  1011480  +  1590  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  NP_977307  unclonable  0.0000000810888  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_1055  CDS  NC_003909  1077885  1078235  +  351  hypothetical protein  NP_977378  unclonable  0.0000000000725313  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_1126  CDS  NC_003909  1132773  1134455  +  1683  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  NP_977449  unclonable  0.000000204459  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_1232  CDS  NC_003909  1243049  1243252  +  204  cold shock protein CspA  NP_977554  unclonable  0.0000000000325579  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_1269  CDS  NC_003909  1278483  1279718  -  1236  ammonium transporter  NP_977590  unclonable  0.0000000200287  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_1270  CDS  NC_003909  1279932  1281233  +  1302  alpha-amylase family protein  NP_977591  unclonable  0.0000000443122  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_1353  CDS  NC_003909  1357555  1359033  -  1479  sodium/proline symporter family protein  NP_977674  unclonable  0.0000000718577  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_1554  CDS  NC_003909  1527541  1528812  -  1272  M24/M37 family peptidase  NP_977875  unclonable  0.0000000152765  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_1556  CDS  NC_003909  1530649  1531167  +  519  hypothetical protein  NP_977877  unclonable  0.000000000259051  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_1557  CDS  NC_003909  1531323  1532804  +  1482  Na+/H+ antiporter family protein  NP_977878  unclonable  0.0000000408774  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_1611  CDS  NC_003909  1580921  1581433  +  513  CAAX amino terminal protease family protein  NP_977932  unclonable  0.000000000156991  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_1617  CDS  NC_003909  1584597  1585883  +  1287  glutamate dehydrogenase  NP_977938  unclonable  0.0000000388705  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_1889  CDS  NC_003909  1822662  1823906  +  1245  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  NP_978205  unclonable  0.0000000270589  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_2073  CDS  NC_003909  2002489  2003649  +  1161  protease, putative  NP_978386  unclonable  0.0000000121211  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_2226  CDS  NC_003909  2129043  2129774  +  732  hypothetical protein  NP_978538  unclonable  0.0000000010453  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_2269  CDS  NC_003909  2176830  2177465  +  636  azoreductase  NP_978580  unclonable  0.000000000607817  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_2270  CDS  NC_003909  2177576  2178295  +  720  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  NP_978581  unclonable  0.00000000119102  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_2271  CDS  NC_003909  2178334  2179053  -  720  hemolysin III  NP_978582  unclonable  0.00000000142686  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_2515  CDS  NC_003909  2398275  2398682  +  408  hypothetical protein  NP_978824  unclonable  0.000000000112808  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_2516  CDS  NC_003909  2398971  2399753  +  783  hypothetical protein  NP_978825  unclonable  0.000000000821985  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_2571  CDS  NC_003909  2446627  2449302  +  2676  neutral protease A, bacillolysin  NP_978879  unclonable  0.0000442231  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_2839  CDS  NC_003909  2678823  2680892  -  2070  uvrD/Rep helicase family protein  NP_979143  unclonable  0.00000185117  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_2979  CDS  NC_003909  2786753  2787580  +  828  hypothetical protein  NP_979282  unclonable  0.00000000165918  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_3033  CDS  NC_003909  2845024  2845773  -  750  IclR family transcriptional regulator  NP_979336  unclonable  0.000000000487376  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_3034  CDS  NC_003909  2845924  2847465  +  1542  amino acid permease family protein  NP_979337  unclonable  0.0000000778692  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_3037  CDS  NC_003909  2850297  2852681  -  2385  proteinase  NP_979340  unclonable  0.0000211319  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_3488  CDS  NC_003909  3244453  3245217  +  765  hypothetical protein  NP_979786  unclonable  0.000000000482446  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_3553  CDS  NC_003909  3304422  3304622  -  201  cold shock protein CspB  NP_979850  unclonable  0.0000000000960966  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_3554  CDS  NC_003909  3304839  3305738  -  900  BNR repeat-containing protein  NP_979851  unclonable  0.00000000374039  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_3555  CDS  NC_003909  3305755  3306198  -  444  flavodoxin  NP_979852  unclonable  0.000000000142004  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_3556  CDS  NC_003909  3306324  3306944  -  621  hypothetical protein  NP_979853  unclonable  0.000000000310297  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_3716  CDS  NC_003909  3467812  3468033  -  222  hypothetical protein  NP_980013  unclonable  0.0000000000393903  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_3717  CDS  NC_003909  3468112  3468552  -  441  hypothetical protein  NP_980014  unclonable  0.000000000110555  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_3741  CDS  NC_003909  3491422  3492375  -  954  tRNA delta(2)-isopentenylpyrophosphate transferase  NP_980038  unclonable  0.00000000167613  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_3744  CDS  NC_003909  3494145  3496001  -  1857  PTS system, fructose-specific IIABC component  NP_980041  unclonable  0.000000405115  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_3756  CDS  NC_003909  3505457  3505729  +  273  DNA-binding protein HU  NP_980053  unclonable  0.0000000000231467  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_3795  CDS  NC_003909  3537926  3538723  +  798  cell wall hydrolase, putative  NP_980092  unclonable  0.00000000105599  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_3814  CDS  NC_003909  3563035  3564393  -  1359  recombinase A  NP_980111  unclonable  0.0000000388705  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_3828  CDS  NC_003909  3578272  3580653  -  2382  stage III sporulation protein E  NP_980125  unclonable  0.0000134118  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_3837  CDS  NC_003909  3585242  3586474  -  1233  aspartate kinase I  NP_980134  unclonable  0.0000000273355  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_3868  CDS  NC_003909  3617474  3618175  -  702  30S ribosomal protein S2  NP_980165  unclonable  0.000000000560898  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_3869  CDS  NC_003909  3618524  3619303  -  780  transcriptional repressor CodY  NP_980166  unclonable  0.000000000736114  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_3875  CDS  NC_003909  3623701  3625779  -  2079  DNA topoisomerase I  NP_980172  unclonable  0.00000221974  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_3882  CDS  NC_003909  3631546  3631890  -  345  50S ribosomal protein L19  NP_980179  unclonable  0.000000000143455  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_3883  CDS  NC_003909  3632037  3632771  -  735  tRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  NP_980180  unclonable  0.00000000151535  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_3884  CDS  NC_003909  3632771  3633286  -  516  16S rRNA-processing protein RimM  NP_980181  unclonable  0.000000000398495  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_3885  CDS  NC_003909  3633408  3633641  -  234  KH domain-containing protein  NP_980182  unclonable  0.0000000000801997  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_3886  CDS  NC_003909  3633650  3633922  -  273  30S ribosomal protein S16  NP_980183  unclonable  0.0000000000793752  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_3887  CDS  NC_003909  3634023  3635372  -  1350  signal recognition particle protein  NP_980184  unclonable  0.0000000347799  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_3896  CDS  NC_003909  3644360  3644953  -  594  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  NP_980193  unclonable  0.00000000171057  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_3900  CDS  NC_003909  3649820  3650008  +  189  50S ribosomal protein L28  NP_980197  unclonable  0.0000000000717977  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_3948  CDS  NC_003909  3698584  3699453  -  870  sporulation sigma factor SigG  NP_980243  unclonable  0.00000000196829  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_4141  CDS  NC_003909  3866671  3868197  -  1527  sodium-dependent symporter family protein  NP_980434  unclonable  0.0000000962307  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_4248  CDS  NC_003909  3961116  3961955  -  840  hemolysin A  NP_980541  unclonable  0.000000000872961  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_4324  CDS  NC_003909  4012160  4013554  +  1395  sodium:dicarboxylate symporter family protein  NP_980617  unclonable  0.0000000495156  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_4366  CDS  NC_003909  4050600  4051910  -  1311  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  NP_980659  unclonable  0.0000000110703  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_4372  CDS  NC_003909  4056642  4057769  -  1128  RNA polymerase sigma factor RpoD  NP_980665  unclonable  0.00000000624256  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_4394  CDS  NC_003909  4074818  4075933  -  1116  chaperone protein DnaJ  NP_980687  unclonable  0.00000000485596  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_4484  CDS  NC_003909  4153657  4154424  -  768  hesA/moeB/thiF family protein  NP_980777  unclonable  0.000000000692664  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_4502  CDS  NC_003909  4172546  4173685  -  1140  queuine tRNA-ribosyltransferase  NP_980795  unclonable  0.00000000575969  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_4604  CDS  NC_003909  4267501  4268295  -  795  Type II restriction endonuclease, putative  NP_980897  unclonable  0.00000000226675  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_4712  CDS  NC_003909  4365163  4365555  -  393  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  NP_981005  unclonable  0.000000000187984  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>