150 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
SAG0051  CDS  NC_004116  66825  67205  +  381  MORN motif-containing protein  NP_687087  unclonable  0.00000239093  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0052  CDS  NC_004116  67202  68980  +  1779  hypothetical protein  NP_687088  unclonable  0.000983267  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0053  CDS  NC_004116  69250  71892  +  2643  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  NP_687089  unclonable  0.00824493  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0054  CDS  NC_004116  72071  73087  +  1017  alcohol dehydrogenase  NP_687090  unclonable  0.000063384  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0108  CDS  NC_004116  117633  118559  +  927  hypothetical protein  NP_687144  unclonable  0.0000248564  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0113  CDS  NC_004116  123041  124495  +  1455  glutamyl-tRNA synthetase  NP_687149  unclonable  0.000311302  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0129  CDS  NC_004116  138990  139178  +  189  50S ribosomal protein L28  NP_687165  unclonable  0.00000311049  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0130  CDS  NC_004116  139310  139675  +  366  hypothetical protein  NP_687166  unclonable  0.00000409279  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0136  CDS  NC_004116  144329  145879  -  1551  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein/permease protein  NP_687172  unclonable  0.000337877  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0147  CDS  NC_004116  157648  158883  -  1236  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  NP_687183  unclonable  0.00007845  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0148  CDS  NC_004116  159124  160779  +  1656  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein, putative  NP_687184  unclonable  0.000587403  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0172  CDS  NC_004116  193424  194089  +  666  protease, putative  NP_687207  unclonable  0.0000101892  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0260  CDS  NC_004116  267645  268361  -  717  ABC transporter, ATP-binding protein  NP_687295  unclonable  0.0000146773  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0266  CDS  NC_004116  271678  272826  +  1149  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  NP_687301  unclonable  0.000106441  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0302  CDS  NC_004116  311317  311649  +  333  cell division protein GpsB  NP_687337  unclonable  0.00000377139  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0360  CDS  NC_004116  371857  372669  -  813  PTS system, mannose-specific IIC component  NP_687394  unclonable  0.0000269759  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0398  CDS  NC_004116  406906  407445  +  540  BioY family protein  NP_687432  unclonable  0.00000949175  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0399  CDS  NC_004116  407584  408360  +  777  AtsA/ElaC family protein  NP_687433  unclonable  0.0000165635  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0400  CDS  NC_004116  408360  408866  +  507  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  NP_687434  unclonable  0.00000750433  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0401  CDS  NC_004116  408968  409102  +  135  hypothetical protein  NP_687435  unclonable  0.00000213904  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0402  CDS  NC_004116  409138  410487  +  1350  glucose-6-phosphate isomerase  NP_687436  unclonable  0.000236735  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0441  CDS  NC_004116  456126  456437  +  312  hypothetical protein  NP_687472  unclonable  0.0000028095  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0449  CDS  NC_004116  464852  465916  +  1065  hypothetical protein  NP_687480  unclonable  0.0000397187  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0450  CDS  NC_004116  466030  467022  +  993  asparagine synthetase AsnA  NP_687481  unclonable  0.0000314133  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0488  CDS  NC_004116  501870  504131  -  2262  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  NP_687518  unclonable  0.00725796  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0491  CDS  NC_004116  504801  505493  +  693  amino acid ABC transporter, permease protein  NP_687521  unclonable  0.0000198933  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0505  CDS  NC_004116  517969  518244  +  276  DNA-binding protein HU  NP_687535  unclonable  0.00000181795  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0506  CDS  NC_004116  518441  518638  +  198  hypothetical protein  NP_687536  unclonable  0.00000176345  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0507  CDS  NC_004116  518682  519614  -  933  dihydroorotate dehydrogenase 1A  NP_687537  unclonable  0.0000369994  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0524  CDS  NC_004116  538679  541186  +  2508  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  NP_687553  unclonable  0.00517102  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0539  CDS  NC_004116  554829  555272  +  444  flavodoxin  NP_687568  unclonable  0.00000706098  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0547  CDS  NC_004116  560334  560891  -  558  hypothetical protein  NP_687576  unclonable  0.00000466929  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0548  CDS  NC_004116  560893  561690  -  798  prophage LambdaSa1, repressor protein, putative  NP_687577  unclonable  0.0000127482  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0623  CDS  NC_004116  611651  613603  +  1953  DNA gyrase subunit B  NP_687647  unclonable  0.00302751  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0624  CDS  NC_004116  613697  615421  +  1725  septation ring formation regulator EzrA  NP_687648  unclonable  0.00118243  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0627  CDS  NC_004116  616675  617130  -  456  hypothetical protein  NP_687651  unclonable  0.0000090207  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0686  CDS  NC_004116  677555  678340  +  786  DNA-entry nuclease, putative  NP_687702  unclonable  0.0000269759  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0707  CDS  NC_004116  699851  700855  +  1005  RegM family transcriptional regulator  NP_687722  unclonable  0.0000462743  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0718  CDS  NC_004116  712240  712995  -  756  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  NP_687733  unclonable  0.0000110627  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0762  CDS  NC_004116  757604  758800  +  1197  elongation factor Tu  NP_687777  unclonable  0.000170202  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0770  CDS  NC_004116  767630  768316  +  687  hypothetical protein  NP_687785  unclonable  0.0000115194  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0771  CDS  NC_004116  768495  770033  +  1539  cell wall surface anchor family protein  NP_687786  unclonable  0.000478369  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0808  CDS  NC_004116  807332  808261  +  930  foldase protein PrsA  NP_687823  unclonable  0.0000278355  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0843  CDS  NC_004116  841645  842904  +  1260  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  NP_687858  unclonable  0.0000776334  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0853  CDS  NC_004116  853443  855311  +  1869  glycogen branching enzyme  NP_687868  unclonable  0.00164465  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0876  CDS  NC_004116  881804  883180  -  1377  tRNA modification GTPase TrmE  NP_687890  unclonable  0.000254143  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0946  CDS  NC_004116  953605  953934  +  330  phnA protein  NP_687958  unclonable  0.00000317474  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0947  CDS  NC_004116  954069  954710  +  642  amino acid ABC transporter, permease protein  NP_687959  unclonable  0.0000099829  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0960  CDS  NC_004116  966643  969102  +  2460  DNA gyrase subunit A  NP_687972  unclonable  0.00632258  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0965  CDS  NC_004116  972846  973229  +  384  IS1381 transposase protein A  NP_687977  unclonable  0.00000400817  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0966  CDS  NC_004116  973262  973651  +  390  IS1381 transposase protein B  NP_687978  unclonable  0.00000481364  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0993  CDS  NC_004116  1002308  1003618  -  1311  NOL1/NOP2/sun family protein  NP_688004  unclonable  0.000219997  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1002  CDS  NC_004116  1009537  1010415  -  879  protease, putative  NP_688013  unclonable  0.0000825875  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1005  CDS  NC_004116  1014001  1016121  -  2121  DNA topoisomerase I  NP_688016  unclonable  0.00429671  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1049  CDS  NC_004116  1058869  1060410  -  1542  ABC transporter, ATP-binding protein  NP_688059  unclonable  0.000311302  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1050    NC_004116  1060541  1060879  -  339      unclonable  0.00000344373  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1090  CDS  NC_004116  1097922  1099922  -  2001  potassium uptake protein, putative  NP_688099  unclonable  0.00180767  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1092  CDS  NC_004116  1100881  1101873  -  993  phosphotransacetylase  NP_688101  unclonable  0.000027546  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1134  CDS  NC_004116  1139034  1139675  -  642  GntR family transcriptional regulator  NP_688143  unclonable  0.0000105089  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1142  CDS  NC_004116  1143007  1145286  -  2280  ATP-dependent DNA helicase PcrA  NP_688151  unclonable  0.00645373  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1144  CDS  NC_004116  1145911  1147236  -  1326  uracil permease  NP_688153  unclonable  0.00015053  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1150  CDS  NC_004116  1152810  1154012  -  1203  30S ribosomal protein S1  NP_688159  unclonable  0.000136012  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1151  CDS  NC_004116  1154356  1154586  -  231  hypothetical protein  NP_688160  unclonable  0.00000229617  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1153  CDS  NC_004116  1155806  1158265  -  2460  DNA topoisomerase IV subunit A  NP_688162  unclonable  0.00798408  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1224  CDS  NC_004116  1234712  1236052  -  1341  MATE efflux family protein  NP_688231  unclonable  0.000144559  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1225  CDS  NC_004116  1236152  1236562  -  411  hypothetical protein  NP_688232  unclonable  0.00000443563  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1226  CDS  NC_004116  1236572  1237069  -  498  hypothetical protein  NP_688233  unclonable  0.00000631981  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1227  CDS  NC_004116  1237291  1237887  +  597  hypothetical protein  NP_688234  unclonable  0.0000082221  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1233  CDS  NC_004116  1241015  1243483  -  2469  streptococcal histidine triad family protein  NP_688238  unclonable  0.00703595  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1234  CDS  NC_004116  1243496  1244416  -  921  laminin-binding surface protein  NP_688239  unclonable  0.0000444188  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1279  CDS  NC_004116  1283368  1283667  -  300  hypothetical protein  NP_688279  unclonable  0.00000205244  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1297  CDS  NC_004116  1308706  1310061  -  1356  C-5 cytosine-specific DNA methylase  NP_688295  unclonable  0.000219997  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1302  CDS  NC_004116  1311826  1312326  -  501  50S ribosomal protein L10  NP_688300  unclonable  0.0000076628  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1306  CDS  NC_004116  1315909  1317285  -  1377  amino acid permease  NP_688304  unclonable  0.000234157  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1307  CDS  NC_004116  1317415  1318065  -  651  hypothetical protein  NP_688305  unclonable  0.0000136788  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1308  CDS  NC_004116  1318223  1318726  -  504  hypothetical protein  NP_688306  unclonable  0.0000069876  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1333  CDS  NC_004116  1340840  1342912  +  2073  5'-nucleotidase family protein  NP_688331  unclonable  0.00306106  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1358  CDS  NC_004116  1368946  1369218  -  273  30S ribosomal protein S16  NP_688356  unclonable  0.00000511359  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1368  CDS  NC_004116  1378706  1378990  -  285  50S ribosomal protein L27  NP_688366  unclonable  0.00000272527  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1369  CDS  NC_004116  1379021  1379359  -  339  hypothetical protein  NP_688367  unclonable  0.00000330577  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1370  CDS  NC_004116  1379366  1379680  -  315  50S ribosomal protein L21  NP_688368  unclonable  0.00000286753  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1371  CDS  NC_004116  1379870  1381048  -  1179  hypothetical protein  NP_688369  unclonable  0.000119096  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1372  CDS  NC_004116  1381150  1382364  -  1215  thiamine biosynthesis protein ThiI  NP_688370  unclonable  0.000114319  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1385  CDS  NC_004116  1394227  1394910  -  684  cytidylate kinase  NP_688383  unclonable  0.0000116404  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1386  CDS  NC_004116  1394921  1395445  -  525  hypothetical protein  NP_688384  unclonable  0.00000839573  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1421  CDS  NC_004116  1432941  1433672  -  732  glycosyl transferase, group 2 family protein  NP_688418  unclonable  0.00000839573  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1428  CDS  NC_004116  1440385  1440762  +  378  large conductance mechanosensitive channel protein  NP_688425  unclonable  0.00000461871  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1429  CDS  NC_004116  1440859  1441035  -  177  30S ribosomal protein S21  NP_688426  unclonable  0.00000209576  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1430  CDS  NC_004116  1441139  1441642  -  504  hypothetical protein  NP_688427  unclonable  0.00000892693  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1431  CDS  NC_004116  1441725  1442531  -  807  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  NP_688428  unclonable  0.0000284109  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1436  CDS  NC_004116  1446755  1448128  -  1374  glycerol-3-phosphate transporter, putative  NP_688433  unclonable  0.000217705  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1444  CDS  NC_004116  1457503  1458975  +  1473  proton/peptide symporter family protein  NP_688441  unclonable  0.000293034  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1480  CDS  NC_004116  1500261  1501649  +  1389  amino acid permease  NP_688474  unclonable  0.000231717  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1482  CDS  NC_004116  1502203  1504608  -  2406  VacB/Rnb family exoribonuclease  NP_688476  unclonable  0.0098629  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1483  CDS  NC_004116  1504721  1504957  -  237  preprotein translocase subunit SecG  NP_688477  unclonable  0.00000405026  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1484  CDS  NC_004116  1505004  1505150  -  147  50S ribosomal protein L33  NP_688478  unclonable  0.00000298588  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1518  CDS  NC_004116  1530169  1531785  -  1617  peptide ABC transporter, peptide-binding protein  NP_688512  unclonable  0.000374669  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1523  CDS  NC_004116  1536544  1537758  -  1215  M20/M25/M40 family peptidase  NP_688517  unclonable  0.000131931  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1533  CDS  NC_004116  1547790  1548716  -  927  manganese ABC transporter, manganese-binding adhesion liprotein  NP_688527  unclonable  0.000021133  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1534  CDS  NC_004116  1548883  1549530  +  648  iron-dependent transcriptional regulator  NP_688528  unclonable  0.00000830846  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>