41 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Dde_0142  CDS  NC_007519  133239  133547  -  309  hypothetical protein  YP_386638  unclonable  0.00000000000103365  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0143  CDS  NC_007519  133568  133663  +  96  hypothetical protein  YP_386639  unclonable  0.000000000000174041  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0144  CDS  NC_007519  133664  133804  +  141  hypothetical protein  YP_386640  unclonable  0.000000000000273022  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0145  CDS  NC_007519  133806  134729  +  924  putative glycine betaine/L-proline ABC transporter, solute-binding protein  YP_386641  unclonable  0.000000000075973  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0560  CDS  NC_007519  582979  584499  +  1521  signal recognition particle-docking protein FtsY  YP_387056  unclonable  0.00000000445569  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0727  CDS  NC_007519  747495  749507  +  2013  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  YP_387223  unclonable  0.00000025266  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0793  CDS  NC_007519  814098  814361  -  264  RNA-binding region RNP-1  YP_387289  unclonable  0.000000000000424033  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0880  CDS  NC_007519  910642  911595  -  954  hypothetical protein  YP_387376  unclonable  0.0000000000839852  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_1011  CDS  NC_007519  1034001  1035347  -  1347  hypothetical protein  YP_387507  unclonable  0.000000000669415  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_1046  CDS  NC_007519  1074559  1075785  +  1227  cell division protein FtsA  YP_387542  unclonable  0.000000000515882  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_1139  CDS  NC_007519  1168679  1168846  +  168  hypothetical protein  YP_387635  unclonable  0.000000000000561341  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_1140  CDS  NC_007519  1168904  1169638  +  735  hypothetical protein  YP_387636  unclonable  0.0000000000347629  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_1141  CDS  NC_007519  1169638  1169820  +  183  hypothetical protein  YP_387637  unclonable  0.000000000000497737  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_1142  CDS  NC_007519  1169937  1170158  -  222  hypothetical protein  YP_387638  unclonable  0.000000000000925736  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_1185  CDS  NC_007519  1214202  1215827  -  1626  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  YP_387681  unclonable  0.00000000666118  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_1222  CDS  NC_007519  1247840  1248415  -  576  rubrerythrin  YP_387718  unclonable  0.00000000000672055  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_1279  CDS  NC_007519  1297115  1299301  +  2187  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_387775  unclonable  0.000000558964  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_1320  CDS  NC_007519  1339453  1339950  +  498  rubrerythrin, putative  YP_387816  unclonable  0.00000000000383486  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_1373  CDS  NC_007519  1393365  1393829  +  465  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  YP_387869  unclonable  0.00000000000244394  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_1374  CDS  NC_007519  1393831  1394616  +  786  UDP-N-acetylglucosamine acyltransferase  YP_387870  unclonable  0.0000000000270452  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_1413  CDS  NC_007519  1430377  1432710  +  2334  organic solvent tolerance protein, putative  YP_387907  unclonable  0.00000119943  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_1442  CDS  NC_007519  1466697  1467659  +  963  signal peptide peptidase A  YP_387936  unclonable  0.000000000119274  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_1479  CDS  NC_007519  1498823  1499860  -  1038  CBS  YP_387973  unclonable  0.000000000161298  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_1513  CDS  NC_007519  1532051  1534048  +  1998  FtsH peptidase  YP_388007  unclonable  0.000000097295  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_1618  CDS  NC_007519  1667691  1668290  -  600  flavodoxin-like fold domain-containing protein  YP_388110  unclonable  0.00000000000595904  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_1689  CDS  NC_007519  1740755  1741813  -  1059  OmpA family protein  YP_388181  unclonable  0.000000000195152  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_1755  CDS  NC_007519  1811437  1813254  -  1818  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_388247  unclonable  0.000000036302  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_1791  CDS  NC_007519  1842056  1842616  +  561  ferritin  YP_388283  unclonable  0.00000000000512633  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_1893  CDS  NC_007519  1944974  1947529  +  2556  ATPase, E1-E2 type  YP_388385  unclonable  0.0000048497  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_1973  CDS  NC_007519  2018771  2019271  +  501  HIT family protein  YP_388465  unclonable  0.00000000000182824  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_2017  CDS  NC_007519  2059273  2059401  +  129  hypothetical protein  YP_388509  unclonable  0.000000000000112031  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_2034  CDS  NC_007519  2075331  2076215  -  885  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  YP_388526  unclonable  0.000000000016391  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_2371  CDS  NC_007519  2394087  2395448  -  1362  sodium-dependent symporter family protein  YP_388863  unclonable  0.00000000133814  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_2486  CDS  NC_007519  2505290  2508070  -  2781  excinuclease ABC subunit A  YP_388978  unclonable  0.0000102064  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_2524  CDS  NC_007519  2544697  2545332  +  636  nitroreductase-like  YP_389016  unclonable  0.00000000000539057  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_2525  CDS  NC_007519  2545720  2546670  -  951  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  YP_389017  unclonable  0.0000000000354745  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_2526  CDS  NC_007519  2546740  2546904  -  165  hypothetical protein  YP_389018  unclonable  0.000000000000145334  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_2626  CDS  NC_007519  2640953  2643364  +  2412  ATP-dependent protease, putative  YP_389117  unclonable  0.00000239913  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_2627  CDS  NC_007519  2643404  2644267  +  864  hypothetical protein  YP_389118  unclonable  0.000000000147338  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_3117  CDS  NC_007519  3108090  3109004  +  915  hypothetical protein  YP_389606  unclonable  0.0000000000545618  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_3555  CDS  NC_007519  3515696  3516511  -  816  zinc transporter ZupT  YP_390043  unclonable  0.0000000000223536  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>