30 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Pfl01_0006  CDS  NC_007492  7716  9257  +  1542  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  YP_345739  unclonable  0.0000000000267267  normal  1  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0007  CDS  NC_007492  9415  10239  -  825  phospholipid/glycerol acyltransferase  YP_345740  unclonable  0.000000000000602556  normal  1  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0307  CDS  NC_007492  353183  353998  -  816  methyltransferase FkbM  YP_346040  unclonable  0.000000000000376535  normal  0.78325  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_1658  CDS  NC_007492  1847114  1847437  +  324  hypothetical protein  YP_347390  unclonable  0.00000000000000957137  decreased coverage  0.00112349  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_1672  CDS  NC_007492  1865557  1866012  +  456  hypothetical protein  YP_347404  unclonable  0.000000000000129043  normal  0.0587565  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_2383  CDS  NC_007492  2741796  2743784  +  1989  peptidase U32  YP_348115  normal  1  unclonable  0.0000437173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_2384  CDS  NC_007492  2743845  2745155  -  1311  major facilitator transporter  YP_348116  normal  1  unclonable  0.0000340178  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_2385  CDS  NC_007492  2745510  2746535  +  1026  transcriptional regulator  YP_348117  normal  0.259464  unclonable  0.0000372406  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_2386  CDS  NC_007492  2746557  2747621  -  1065  Alpha/beta hydrolase fold  YP_348118  normal  0.250689  unclonable  0.0000387671  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_2387  CDS  NC_007492  2747842  2748096  +  255  hypothetical protein  YP_348119  normal  0.137385  unclonable  0.0000292693  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_2388  CDS  NC_007492  2748193  2749029  +  837  AraC family transcriptional regulator  YP_348120  normal  0.262251  unclonable  0.0000340178  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_2684  CDS  NC_007492  3088049  3091135  +  3087  Outer membrane autotransporter barrel  YP_348415  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_2685  CDS  NC_007492  3091193  3092881  +  1689  triacylglycerol lipase  YP_348416  normal  0.871664  unclonable  0.0000237171  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_2686  CDS  NC_007492  3092982  3094835  +  1854  lipase, class 3  YP_348417  normal  0.458877  unclonable  0.0000292693  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_3190  CDS  NC_007492  3668385  3669464  +  1080  ATPase domain-containing protein  YP_348919  unclonable  0.000000000000797397  unclonable  0.000049795  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_4793  CDS  NC_007492  5409193  5410749  +  1557  hypothetical protein  YP_350521  hitchhiker  0.000600328  unclonable  0.0000272859  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_4794  CDS  NC_007492  5410841  5411185  +  345  pentapeptide repeat-containing protein  YP_350522  hitchhiker  0.000000103308  unclonable  0.0000208152  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_4795  CDS  NC_007492  5411405  5411677  +  273  TfoX-like  YP_350523  hitchhiker  0.0000000150833  unclonable  0.0000206045  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_4796  CDS  NC_007492  5411693  5412484  +  792  cyclic nucleotide-binding (cNMP-bd) protein  YP_350524  hitchhiker  0.00000000000370555  unclonable  0.0000216721  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_4797  CDS  NC_007492  5412711  5413562  -  852  hypothetical protein  YP_350525  unclonable  0.000000000000115582  unclonable  0.0000208152  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_4918  CDS  NC_007492  5540845  5541765  +  921  histone deacetylase superfamily protein  YP_350646  unclonable  0.000000000000273279  normal  1  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_5064  CDS  NC_007492  5697899  5698432  -  534  50S ribosomal protein L6  YP_350792  unclonable  0.0000000000000965255  normal  0.133122  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_5065  CDS  NC_007492  5698445  5698837  -  393  30S ribosomal protein S8  YP_350793  unclonable  0.0000000000000451262  normal  0.127719  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_5066  CDS  NC_007492  5699047  5699352  -  306  30S ribosomal protein S14  YP_350794  unclonable  0.0000000000000167621  normal  0.114431  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_5067  CDS  NC_007492  5699366  5699905  -  540  50S ribosomal protein L5  YP_350795  unclonable  0.0000000000000562403  normal  0.121811  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_5068  CDS  NC_007492  5699926  5700240  -  315  50S ribosomal protein L24  YP_350796  unclonable  0.0000000000000162639  normal  0.122565  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_5069  CDS  NC_007492  5700252  5700620  -  369  50S ribosomal protein L14  YP_350797  unclonable  0.0000000000000172755  normal  0.126935  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_5099  CDS  NC_007492  5733436  5734947  +  1512  peptidase M23B  YP_350827  unclonable  0.0000000000186305  normal  1  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_5181  CDS  NC_007492  5827109  5827996  +  888  RarD protein  YP_350909  unclonable  0.000000000000181331  normal  0.141075  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_5219  CDS  NC_007492  5869683  5873135  -  3453  glucose-methanol-choline oxidoreductase  YP_350947  hitchhiker  0.0000490282  unclonable  0.0000721023  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>