54 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
HS_0059  CDS  NC_008309  63460  64086  +  627  50S ribosomal protein L3  YP_718265  unclonable  0.00000000158228  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0060  CDS  NC_008309  64102  64704  +  603  50S ribosomal protein L4  YP_718266  unclonable  0.00000000107913  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0061  CDS  NC_008309  64701  65006  +  306  50S ribosomal protein L23  YP_718267  unclonable  0.000000000105028  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0062  CDS  NC_008309  65027  65848  +  822  50S ribosomal protein L2  YP_718268  unclonable  0.00000000394369  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0070  CDS  NC_008309  71086  71457  +  372  50S ribosomal protein L14  YP_718276  unclonable  0.000000000146326  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0095  CDS  NC_008309  87921  90158  +  2238  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  YP_718302  unclonable  0.000291848  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0117  CDS  NC_008309  105057  105977  +  921  acyltransferase  YP_718321  unclonable  0.0000000125573  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0118  CDS  NC_008309  105959  106426  +  468  hypothetical protein  YP_718322  unclonable  0.000000000449189  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0195  CDS  NC_008309  175770  176954  -  1185  elongation factor Tu  YP_718402  unclonable  0.0000000854566  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0256  CDS  NC_008309  253414  254979  +  1566  cytochrome D ubiquinol oxidase, subunit I  YP_718464  unclonable  0.00000101407  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0328  CDS  NC_008309  325053  325913  -  861  chelated iron ABC transporter, periplasmic-binding protein  YP_718536  unclonable  0.00000000651268  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0329  CDS  NC_008309  326040  326369  -  330  sulfite reductase-like protein  YP_718537  unclonable  0.00000000011498  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0330  CDS  NC_008309  326447  327109  -  663  integral membrane protein  YP_718538  unclonable  0.00000000128049  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0338  CDS  NC_008309  335169  336857  -  1689  putative symporter YidK  YP_718546  unclonable  0.00000369581  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0348  CDS  NC_008309  353182  354765  +  1584  carbon starvation protein A  YP_718558  unclonable  0.00000180552  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0362  CDS  NC_008309  369596  370870  +  1275  cell division protein FtsA  YP_718572  unclonable  0.0000000795904  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0363  CDS  NC_008309  371056  372171  +  1116  cell division protein FtsZ  YP_718573  unclonable  0.0000000281943  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0464  CDS  NC_008309  494512  495141  -  630  superoxide dismutase, manganese  YP_718675  unclonable  0.00000000102594  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0511  CDS  NC_008309  550922  552367  -  1446  glycerol 3-phosphate transporter  YP_718722  unclonable  0.00000061877  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0582  CDS  NC_008309  616932  619298  -  2367  heme uptake protein  YP_718794  unclonable  0.000461965  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0624  CDS  NC_008309  670750  671370  +  621  disulfide bond formation protein B  YP_718836  unclonable  0.000000000750855  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0684  CDS  NC_008309  730010  730309  +  300  cell division protein ZapA  YP_718896  unclonable  0.0000000000536576  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0701  CDS  NC_008309  743326  744378  +  1053  TRAP dicarboxylate transporter, periplasmic component  YP_718913  unclonable  0.0000000267748  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0749  CDS  NC_008309  803777  804697  +  921  ribokinase  YP_718959  unclonable  0.00000000720941  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0767  CDS  NC_008309  822127  823065  -  939  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  YP_718977  unclonable  0.0000000173406  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0768  CDS  NC_008309  823280  824770  +  1491  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  YP_718978  unclonable  0.00000105666  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0856  CDS  NC_008309  932597  932806  +  210  cold-shock DNA-binding protein family protein  YP_719066  unclonable  0.0000000000189352  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0857  CDS  NC_008309  932878  933324  -  447  hypothetical protein  YP_719067  unclonable  0.000000000117366  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0874  CDS  NC_008309  954122  954727  +  606  hypothetical protein  YP_719084  unclonable  0.000000000956069  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0971  CDS  NC_008309  1070718  1071668  -  951  ompH family outer membrane protein  YP_719182  unclonable  0.0000000094699  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_1006  CDS  NC_008309  1107112  1108428  +  1317  lysine/cadaverine antiporter  YP_719217  unclonable  0.000000705878  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_1055  CDS  NC_008309  1161299  1162234  -  936  malate dehydrogenase  YP_719267  unclonable  0.00000000618832  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_1076  CDS  NC_008309  1192980  1194053  -  1074  homoserine O-acetyltransferase  YP_719288  unclonable  0.0000000373874  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_1120  CDS  NC_008309  1255786  1258410  -  2625  alanyl-tRNA synthetase  YP_719332  unclonable  0.00495062  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_1127  CDS  NC_008309  1264599  1265654  -  1056  rod shape-determining protein MreB  YP_719339  unclonable  0.0000000227657  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_1160  CDS  NC_008309  1310334  1311419  +  1086  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  YP_719372  unclonable  0.0000000302553  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_1163  CDS  NC_008309  1315768  1318413  +  2646  DNA gyrase subunit A  YP_719375  unclonable  0.00841835  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_1186  CDS  NC_008309  1336965  1339676  -  2712  DNA translocase FtsK  YP_719398  unclonable  0.00816417  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_1265  CDS  NC_008309  1450879  1451508  -  630  outer membrane protein precursor  YP_719477  unclonable  0.00000000128049  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_1291  CDS  NC_008309  1479422  1480291  -  870  Dna-J like membrane chaperone protein  YP_719503  unclonable  0.00000000651268  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_1306  CDS  NC_008309  1494813  1496891  +  2079  iron-regulated outer membrane protein  YP_719518  unclonable  0.0000656516  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_1309  CDS  NC_008309  1498984  1499313  -  330  hypothetical protein  YP_719521  unclonable  0.000000000243937  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_1387  CDS  NC_008309  1585825  1586151  -  327  hypothetical protein  YP_719599  unclonable  0.000000000195659  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_1388  CDS  NC_008309  1586124  1586660  -  537  lysozyme, phage-related lysozyme  YP_719600  unclonable  0.000000000577391  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_1538  CDS  NC_008309  1736080  1736355  -  276  DNA-binding protein HU  YP_719743  unclonable  0.0000000000676058  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_1561  CDS  NC_008309  1759227  1759817  -  591  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  YP_719766  unclonable  0.00000000134759  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_1562  CDS  NC_008309  1759927  1761177  -  1251  tryptophan-specific transport protein  YP_719767  unclonable  0.000000304843  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_1563  CDS  NC_008309  1761577  1762494  +  918  hypothetical protein  YP_719768  unclonable  0.0000000159898  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_1584  CDS  NC_008309  1798287  1799783  -  1497  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  YP_719789  unclonable  0.00000121824  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_1655  CDS  NC_008309  1887245  1887994  +  750  VacJ lipoprotein  YP_719860  unclonable  0.00000000371202  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_1676  CDS  NC_008309  1906732  1907013  -  282  hypothetical protein  YP_719881  unclonable  0.0000000000636346  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_1715  CDS  NC_008309  1941365  1942081  -  717  DNA transformation protein  YP_719920  unclonable  0.00000000335694  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_tHis01  tRNA  NC_008309  1395013  1395091  -  79  tRNA-His    unclonable  0.0000000000397081  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_tPro01  tRNA  NC_008309  1394930  1395009  -  80  tRNA-Pro    unclonable  0.0000000000413507  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>