63 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CPF_0101  CDS  NC_008261  121682  122422  +  741  hypothetical protein  YP_694565  unclonable  0.0000000075579  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0102  CDS  NC_008261  122534  123406  +  873  hypothetical protein  YP_694566  unclonable  0.0000000170522  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0238  CDS  NC_008261  287113  289440  -  2328  GGDEF/EAL domain-containing protein  YP_694700  unclonable  0.0000652634  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0277  CDS  NC_008261  332413  332652  -  240  AbrB family transcriptional regulator  YP_694737  unclonable  0.00000000039637  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0348  CDS  NC_008261  414446  415225  +  780  hypothetical protein  YP_694806  unclonable  0.0000000132581  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0359  CDS  NC_008261  429345  431828  +  2484  hypothetical protein  YP_694816  unclonable  0.000526889  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0360  CDS  NC_008261  432083  432409  +  327  hypothetical protein  YP_694817  unclonable  0.00000000114826  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0361  CDS  NC_008261  432472  434523  +  2052  type III restriction-modification system, Mod subunit  YP_694818  unclonable  0.0000361373  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0471  CDS  NC_008261  557796  559688  +  1893  heparinase II/III-like protein  YP_694926  unclonable  0.00000500761  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0472  CDS  NC_008261  559699  561078  +  1380  putative capK protein  YP_694927  unclonable  0.00000021402  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0473  CDS  NC_008261  561106  562176  +  1071  glycosyl transferase, group 1  YP_694928  unclonable  0.0000000388083  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0474  CDS  NC_008261  562178  563644  +  1467  putative polysaccharide transporter protein  YP_694929  unclonable  0.000000432304  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0475  CDS  NC_008261  563631  564848  +  1218  hypothetical protein  YP_694930  unclonable  0.000000101664  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0541  CDS  NC_008261  643462  644883  +  1422  PTS system, trehalose-specific IIBC component  YP_694995  unclonable  0.000000364471  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0625  CDS  NC_008261  752131  752547  -  417  flavodoxin  YP_695078  unclonable  0.000000000760525  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0635  CDS  NC_008261  763274  764065  +  792  relA/spoT family protein  YP_695088  unclonable  0.0000000118611  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0717  CDS  NC_008261  852189  853028  +  840  zinc transporter ZupT  YP_695169  unclonable  0.0000000126072  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0917  CDS  NC_008261  1081573  1082385  +  813  licD family protein  YP_695366  unclonable  0.0000000119843  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_1014  CDS  NC_008261  1164914  1166227  +  1314  hypothetical protein  YP_695460  unclonable  0.000000199416  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_1015  CDS  NC_008261  1166292  1166957  -  666  hypothetical protein  YP_695461  unclonable  0.00000000389978  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_1016  CDS  NC_008261  1166971  1168458  -  1488  putative type II restriction endonuclease  YP_695462  unclonable  0.000000561814  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_1017  CDS  NC_008261  1168761  1169984  +  1224  DNA-cytosine methyltransferase  YP_695463  unclonable  0.000000173246  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_1018  CDS  NC_008261  1170044  1171384  +  1341  DNA-cytosine methyltransferase  YP_695464  unclonable  0.000000487753  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_1019  CDS  NC_008261  1171434  1171916  -  483  hypothetical protein  YP_695465  unclonable  0.00000000271806  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_1020  CDS  NC_008261  1172294  1172719  -  426  hypothetical protein  YP_695466  unclonable  0.00000000136149  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_1182  CDS  NC_008261  1348121  1348795  +  675  hypothetical protein  YP_695628  unclonable  0.00000000961119  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_1226  CDS  NC_008261  1394596  1396506  +  1911  hypothetical protein  YP_695672  unclonable  0.00000692495  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_1256  CDS  NC_008261  1431385  1431540  +  156  hypothetical protein  YP_695702  unclonable  0.00000000019657  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_1257  CDS  NC_008261  1431768  1432382  +  615  hypothetical protein  YP_695703  unclonable  0.00000000444267  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_1334  CDS  NC_008261  1509910  1510164  +  255  hypothetical protein  YP_695780  unclonable  0.000000000327564  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_1370  CDS  NC_008261  1548207  1549427  +  1221  sodium:dicarboxylate symporter family protein  YP_695816  unclonable  0.0000000579538  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_1439  CDS  NC_008261  1619394  1622543  -  3150  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  YP_695884  unclonable  0.00896108  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_1497  CDS  NC_008261  1704972  1707809  -  2838  ATPase domain-containing protein  YP_695940  unclonable  0.0028368  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_1526  CDS  NC_008261  1744050  1744754  -  705  sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  YP_695969  unclonable  0.00000000656832  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_1527  CDS  NC_008261  1744792  1745784  -  993  putative iron-sulfur cluster-binding protein  YP_695970  unclonable  0.0000000239897  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_1528  CDS  NC_008261  1745929  1746438  -  510  serine O-acetyltransferase  YP_695971  unclonable  0.00000000191347  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_1529  CDS  NC_008261  1746457  1747359  -  903  cysteine synthase A  YP_695972  unclonable  0.000000033727  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_1531  CDS  NC_008261  1749309  1750097  +  789  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  YP_695974  unclonable  0.0000000230414  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_1562  CDS  NC_008261  1781006  1782667  -  1662  NlpC/P60 family protein  YP_696005  unclonable  0.00000246871  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_1650  CDS  NC_008261  1865685  1867271  +  1587  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  YP_696091  unclonable  0.00000109109  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_1756  CDS  NC_008261  1974886  1976184  -  1299  uracil transporter  YP_696192  unclonable  0.000000176806  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_2019  CDS  NC_008261  2258872  2260110  -  1239  cell division protein FtsA  YP_696452  unclonable  0.000000129502  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_2107  CDS  NC_008261  2338461  2338910  -  450  hypothetical protein  YP_696536  unclonable  0.00000000203247  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_2125  CDS  NC_008261  2356082  2356798  -  717  WecB/TagA/CpsF family glycosyl transferase  YP_696553  unclonable  0.00000000472054  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_2126  CDS  NC_008261  2356814  2357911  -  1098  TPR domain-containing protein  YP_696554  unclonable  0.0000000503657  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_2166  CDS  NC_008261  2402861  2403517  -  657  single-stranded DNA-binding protein  YP_696590  unclonable  0.00000000374562  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_2242  CDS  NC_008261  2489656  2491518  -  1863  sensor histidine kinase  YP_696666  unclonable  0.0000101794  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_2354  CDS  NC_008261  2619173  2620429  -  1257  hypothetical protein  YP_696777  unclonable  0.0000000469448  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_2393  CDS  NC_008261  2662297  2663094  -  798  septum site-determining protein MinD  YP_696816  unclonable  0.00000000328791  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_2466  CDS  NC_008261  2735105  2736187  -  1083  peptide chain release factor 1  YP_696880  unclonable  0.0000000799175  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_2715  CDS  NC_008261  2974959  2975267  -  309  30S ribosomal protein S10  YP_697095  unclonable  0.000000000442606  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_2725  CDS  NC_008261  2989558  2990247  -  690  50S ribosomal protein L1  YP_697105  unclonable  0.00000000462552  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_2726  CDS  NC_008261  2990305  2990730  -  426  50S ribosomal protein L11  YP_697106  unclonable  0.000000000920277  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_2727  CDS  NC_008261  2990805  2991326  -  522  transcription antitermination protein NusG  YP_697107  unclonable  0.00000000231541  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_2728  CDS  NC_008261  2991364  2991588  -  225  preprotein translocase subunit SecE  YP_697108  unclonable  0.00000000036945  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_2729  CDS  NC_008261  2991642  2991791  -  150  50S ribosomal protein L33  YP_697109  unclonable  0.000000000221707  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_2730  CDS  NC_008261  2991974  2993167  -  1194  elongation factor Tu  YP_697110  unclonable  0.0000000782822  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_2797  CDS  NC_008261  3057379  3057783  -  405  hypothetical protein  YP_697162  unclonable  0.000000000939181  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_2798  CDS  NC_008261  3057843  3058163  -  321  putative cell division protein FtsL  YP_697163  unclonable  0.00000000066737  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_2799  CDS  NC_008261  3058259  3058633  -  375  spore cortex biosynthesis protein YabQ  YP_697164  unclonable  0.000000000883899  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_2800  CDS  NC_008261  3058643  3058942  -  300  sporulation protein YabP  YP_697165  unclonable  0.000000000715998  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_2801  CDS  NC_008261  3059073  3059333  -  261  S4 domain-containing protein  YP_697166  unclonable  0.000000000568506  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_2910  CDS  NC_008261  3183567  3184916  +  1350  nucleoside recognition domain-containing protein  YP_697274  unclonable  0.000000209711  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>