17 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Mlg_0001  CDS  NC_008340  75  1430  +  1356  chromosomal replication initiation protein  YP_740850  unclonable  0.000000764641  normal  0.435321  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0195  CDS  NC_008340  226766  227773  -  1008  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  YP_741040  unclonable  0.00000014787  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0416  CDS  NC_008340  465925  466653  -  729  hypothetical protein  YP_741260  unclonable  0.0000000286057  normal  0.0207815  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0590  CDS  NC_008340  642484  642861  -  378  type IV pilus assembly PilZ  YP_741434  hitchhiker  0.0040025  unclonable  1.11393e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0591  CDS  NC_008340  642915  643775  -  861  bifunctional 5,10-methylene-tetrahydrofolate dehydrogenase/ 5,10-methylene-tetrahydrofolate cyclohydrolase  YP_741435  hitchhiker  0.0000074286  unclonable  2.0108800000000004e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0592  CDS  NC_008340  644453  645295  -  843  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  YP_741436  hitchhiker  0.000000801291  unclonable  2.22313e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0593  CDS  NC_008340  645765  646871  +  1107  porin  YP_741437  unclonable  0.000000197819  unclonable  2.8842300000000004e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0594  CDS  NC_008340  647221  648285  +  1065  porin  YP_741438  unclonable  0.000000227625  unclonable  3.1886500000000004e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0613  CDS  NC_008340  664134  664652  -  519  phasin family protein  YP_741457  unclonable  0.0000000122223  hitchhiker  0.0000006864  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_2599  CDS  NC_008340  2945050  2945727  -  678  nitroreductase  YP_743429  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_2676  CDS  NC_008340  3030615  3030818  -  204  cold-shock DNA-binding protein family protein  YP_743506  hitchhiker  0.00000256327  unclonable  1.4308e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_2677  CDS  NC_008340  3031106  3032089  +  984  hypothetical protein  YP_743507  unclonable  0.000000440708  hitchhiker  1.63518e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_2788  CDS  NC_008340  3170819  3171847  -  1029  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  YP_743618  unclonable  0.000000133752  normal  1  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_R0022  tRNA  NC_008340  643969  644045  +  77  tRNA-Pro    hitchhiker  0.000000445739  unclonable  9.38504e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_R0023  tRNA  NC_008340  644094  644170  +  77  tRNA-Arg    hitchhiker  0.0000000416946  unclonable  9.7747e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_R0024  tRNA  NC_008340  644208  644283  +  76  tRNA-His    hitchhiker  0.0000000441767  unclonable  9.7747e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_R0025  tRNA  NC_008340  644290  644365  +  76  tRNA-Lys    hitchhiker  0.0000000416946  unclonable  9.48259e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>