15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene tRNA-Thr-2 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.53423  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0053  tRNA-Thr  93.75 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0001  tRNA-Thr  93.75 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00463461  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0002  tRNA-Thr  93.75 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0189454  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0024  tRNA-Thr  93.02 
 
 
75 bp  54  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.9344  normal  0.172928 
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  94.12 
 
 
74 bp  52  0.00002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0002  tRNA-Thr  87.04 
 
 
76 bp  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.10498 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4555  tRNA-Thr  87.04 
 
 
76 bp  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0002  tRNA-Thr  87.04 
 
 
76 bp  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0136  tRNA-Thr  88.89 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0051  tRNA-Thr  88.64 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0075  tRNA-Thr  90.48 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.648131  normal  0.30015 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0021  tRNA-Thr  90.48 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404313  normal  0.107554 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0078  tRNA-Thr  90.48 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0001  tRNA-Thr  90.48 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.710276 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>