75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene tRNA-Gly-1 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0048  tRNA-Gly  94.87 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0048  tRNA-Gly  94.87 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  97.06 
 
 		 71 bp  60  0.00000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0701067  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0011  tRNA-Gly  97.06 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  2.9187400000000002e-24  normal  0.0779261 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0006  tRNA-Gly  97.06 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.328073  hitchhiker  0.00695117 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna36  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0073  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0044  tRNA-Gly  94.29 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265162  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0059  tRNA-Gly  94.29 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000597216  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0074  tRNA-Gly  94.29 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000352958  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3826  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.216257  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3459  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000712395  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA37  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0779293 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0037  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0010  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137284  normal  0.0116313 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0007  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0064  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0013  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179187  normal  0.143307 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0069  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.024134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0016  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.511994  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0013  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000407891  normal  0.589115 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0052  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.789064 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0022  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.600355 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0071  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000687699  normal  0.228297 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0058  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136383  hitchhiker  0.000000693164 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0049  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.323662  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0009  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.365276  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0007  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0038  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0062  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0121694  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0021  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.292095 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0009  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0052  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0161202 
 
 
-
 
NC_003295  RS05586  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000136136  normal  0.200305 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00107854  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0057  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00632698  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0040    94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3796  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000000939303  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0021  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000327134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0019  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0025  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000880116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3086  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000101818  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0028  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.721667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3764  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188016  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0078  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000230991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0055  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.3002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0041  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0058  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1904  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000012603  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0013  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000164045  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1215  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0012  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000183499  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0012  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3188  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469441  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0060  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.0000000611366  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0035  tRNA-Gly  93.94 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t22  tRNA-Gly  93.94 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.656712  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0017  tRNA-Gly  93.94 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.292285 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4566  tRNA-Gly  93.94 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.778703  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0034  tRNA-Gly  93.94 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.849322  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1214  tRNA-Gly  93.94 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0017  tRNA-Gly  93.94 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00877648 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0018  tRNA-Gly  93.94 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.395535  normal  0.2939 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0561  tRNA-Gly  93.94 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000476059  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0308  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0035  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0578114  normal  0.382636 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0049  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111127  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0078  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0043  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.11456  normal  0.782815 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0017  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.255177  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0034  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0014  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.030133  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0025  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0032  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.629344  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>