45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene tRNA-Asn-2 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  tRNA-Asn-2  tRNA-Asn  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0708592  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1997  tRNA-Asn  94.59 
 
 
74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  94.59 
 
 
74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0149702  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1780  tRNA-Asn  94.59 
 
 
74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.319362  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0185  tRNA-Asn  94.59 
 
 
74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00655162  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Asn-3  tRNA-Asn  94.59 
 
 
74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0026  tRNA-Asn  100 
 
 
74 bp  85.7  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000145037  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2604  tRNA-Asn  100 
 
 
74 bp  85.7  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0040  tRNA-Asn  90.16 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0275291  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0049  tRNA-Asn  90.16 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.000000000433504  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0050  tRNA-Asn  90.16 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.000000000354715  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0051  tRNA-Asn  90.16 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.000000000442391  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0013  tRNA-Asn  87.93 
 
 
76 bp  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0012  tRNA-Asn  87.93 
 
 
76 bp  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00142633  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0014  tRNA-Asn  92.86 
 
 
73 bp  52  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000102189  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0012  tRNA-Asn  92.86 
 
 
73 bp  52  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0049  tRNA-Asn  86.89 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000556498  normal  0.485056 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0067  tRNA-Asn  86.89 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0043  tRNA-Asn  86.89 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.362716  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0407  tRNA-Asn  88.68 
 
 
73 bp  50.1  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000764097  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0408  tRNA-Asn  88.68 
 
 
73 bp  50.1  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000233964  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0193  tRNA-Asn  88.68 
 
 
73 bp  50.1  0.00007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0036  tRNA-Lys  87.5 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000293435  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt01  tRNA-Asn  87.27 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt01  tRNA-Asn  87.27 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0023  tRNA-His  85.71 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000859824  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R85  tRNA-Asn  86.44 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000392711  normal  0.139557 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0023  tRNA-His  85.71 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000017569  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0006  tRNA-Pro  100 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000451843  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0001  tRNA-Met  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.103849  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35030  tRNA-Thr  96.15 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.838574  normal  0.836072 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0061  tRNA-Leu  100 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0076  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.509004  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0075  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0078  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.184642 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0076  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0067  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.143044  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0056  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.880886  decreased coverage  0.00985409 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0031  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0885898  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0073  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0452  tRNA-Asn  90.48 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.133298 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1563  tRNA-Asn  90.48 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0028  tRNA-Asn  89.47 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1796  tRNA-Asn  90.48 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  6.3013000000000006e-24 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1802  tRNA-Asn  90.48 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000154266 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>