46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2213 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp2213  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  206  7e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2185  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  206  7e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0278  periplasmic or secreted lipoprotein  34.26 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.406104  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4004  transport-associated  39.39 
 
 		 104 aa  51.6  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.38345  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2170  transport-associated  34.12 
 
 		 104 aa  47.8  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.395466  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3244  transport-associated  40 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.688311  normal  0.631575 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1376  osmotically inducible protein Y  37.7 
 
 		 174 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3027  phospholipid-binding domain-containing protein  37.7 
 
 		 184 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.119447  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3156  phospholipid-binding domain-containing protein  37.7 
 
 		 246 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  47.83 
 
 		 202 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  47.83 
 
 		 204 aa  46.2  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2343  transport-associated  39.34 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259537  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  47.83 
 
 		 202 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0477  transport-associated  32.08 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  39.34 
 
 		 205 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  39.34 
 
 		 205 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  39.34 
 
 		 205 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  39.34 
 
 		 205 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  39.34 
 
 		 205 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3514  transport-associated  39.44 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3465  periplasmic protein  37.7 
 
 		 202 aa  45.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2837  transport-associated  38.03 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.47962  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3867  transport-associated  38.03 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2542  transport-associated protein  33.01 
 
 		 105 aa  42.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000702242 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  46.81 
 
 		 204 aa  42.7  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  46.81 
 
 		 204 aa  42.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  46.81 
 
 		 204 aa  42.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1679  transport-associated protein  33.85 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.3238  normal  0.893681 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4971  transport-associated  33.85 
 
 		 115 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314311  normal  0.115696 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0916  transport-associated  40.32 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1671  transport-associated  32.04 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  36.07 
 
 		 201 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  36.07 
 
 		 201 aa  41.2  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  36.07 
 
 		 201 aa  41.2  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  36.07 
 
 		 201 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  36.07 
 
 		 201 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  36.07 
 
 		 201 aa  41.2  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  36.07 
 
 		 201 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  36.07 
 
 		 201 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1805  transport-associated protein  35.21 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2047  transport-associated protein  28 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5453  transport-associated protein  31.82 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.627587  hitchhiker  0.00543554 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  33.33 
 
 		 205 aa  40.4  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2909  putative lipoprotein  36.92 
 
 		 104 aa  40  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.434819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4015  transport-associated  31.43 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  36.07 
 
 		 201 aa  40  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>