More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0393 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0393  30S ribosomal protein S10  100 
 
 
105 aa  211  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0368  30S ribosomal protein S10  100 
 
 
105 aa  211  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0874  ribosomal protein S10  84.16 
 
 
103 aa  179  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.522199  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4318  30S ribosomal protein S10  85.15 
 
 
103 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000242072  unclonable  0.0000000000477389 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0183  30S ribosomal protein S10  85.15 
 
 
103 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140291  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4691  30S ribosomal protein S10  85.15 
 
 
103 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000838307  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0212  30S ribosomal protein S10  86.14 
 
 
103 aa  177  4e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000277123  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0583  ribosomal protein S10  85.15 
 
 
103 aa  177  5.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572032  normal  0.180599 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3637  ribosomal protein S10  85.15 
 
 
103 aa  177  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000269105  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3637  30S ribosomal protein S10  85.15 
 
 
103 aa  177  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000584006  normal  0.459498 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4545  ribosomal protein S10  85.15 
 
 
103 aa  177  5.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000155488  hitchhiker  0.00172679 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3710  ribosomal protein S10  85.15 
 
 
103 aa  177  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000120586  normal  0.692874 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3916  ribosomal protein S10  85.15 
 
 
103 aa  177  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.06232e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4002  30S ribosomal protein S10  85.15 
 
 
103 aa  177  5.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000661379  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3808  30S ribosomal protein S10  85.15 
 
 
103 aa  177  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000064612  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0404  30S ribosomal protein S10  85.15 
 
 
103 aa  177  5.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0007092  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0322  30S ribosomal protein S10  85.15 
 
 
103 aa  177  5.999999999999999e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000012719  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0058  SSU ribosomal protein S10P  85.15 
 
 
103 aa  177  5.999999999999999e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000415336  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0282  ribosomal protein S10  85.15 
 
 
103 aa  177  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000746506  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3745  30S ribosomal protein S10  85.15 
 
 
103 aa  177  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00135486  normal  0.0277892 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3823  30S ribosomal protein S10  85.15 
 
 
103 aa  177  5.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000546327  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0230  30S ribosomal protein S10  85.15 
 
 
103 aa  176  9e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0157  30S ribosomal protein S10  85.15 
 
 
103 aa  176  9e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000255753  decreased coverage  0.0000448668 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0169  30S ribosomal protein S10  85.15 
 
 
103 aa  176  9e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000585443  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0198  30S ribosomal protein S10  85.15 
 
 
103 aa  176  9e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000200655  unclonable  0.0000000000157318 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0193  30S ribosomal protein S10  85.15 
 
 
103 aa  176  9e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000424599  decreased coverage  0.00027939 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3752  SSU ribosomal protein S10P  84.16 
 
 
103 aa  176  9e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000621266  hitchhiker  0.0036093 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0198  30S ribosomal protein S10  85.15 
 
 
103 aa  176  9e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000267319  hitchhiker  0.0000000013297 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0199  30S ribosomal protein S10  84.16 
 
 
103 aa  175  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000181945  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4057  30S ribosomal protein S10  84.16 
 
 
103 aa  175  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000379961  hitchhiker  0.000000000138432 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0625  ribosomal protein S10  83.17 
 
 
103 aa  176  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000000466292  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4549  30S ribosomal protein S10  83.17 
 
 
103 aa  176  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000213954  normal  0.0597614 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0718  30S ribosomal protein S10  85 
 
 
103 aa  176  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000141431  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0195  30S ribosomal protein S10  84.16 
 
 
103 aa  175  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000645818  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4171  30S ribosomal protein S10  84.16 
 
 
103 aa  175  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000385608  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3525  ribosomal protein S10  83.17 
 
 
103 aa  176  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000457129  hitchhiker  0.0000321241 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3760  30S ribosomal protein S10  84.16 
 
 
103 aa  175  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000001631  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0147  ribosomal protein S10  84.16 
 
 
103 aa  175  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000495355  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0453  30S ribosomal protein S10  82.18 
 
 
103 aa  174  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0704355  unclonable  0.000000189493 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0483  30S ribosomal protein S10  82.18 
 
 
103 aa  174  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.000151275  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5080  30S ribosomal protein S10  82.18 
 
 
103 aa  174  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000793453  normal  0.270334 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4750  30S ribosomal protein S10  82.18 
 
 
103 aa  174  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000671466  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0486  30S ribosomal protein S10  82.18 
 
 
103 aa  174  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000131122  normal  0.0380301 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0836  30S ribosomal protein S10  82.18 
 
 
103 aa  174  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0236552  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0319  30S ribosomal protein S10  83 
 
 
103 aa  174  5e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0188597  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4277  ribosomal protein S10  83 
 
 
103 aa  174  5e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000346918  unclonable  0.00000000000359419 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08840  30S ribosomal protein S10  82.18 
 
 
103 aa  174  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000352676  normal  0.0199275 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0959  30S ribosomal protein S10  81.19 
 
 
103 aa  173  7e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000233604  unclonable  0.00000000572443 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03172  30S ribosomal protein S10  83.17 
 
 
103 aa  172  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00056658  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0392  ribosomal protein S10  83.17 
 
 
103 aa  172  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000318105  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06240  30S ribosomal protein S10  81.19 
 
 
103 aa  172  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00394017  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2325  30S ribosomal protein S10  81.55 
 
 
104 aa  172  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00118497  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3706  30S ribosomal protein S10  83.17 
 
 
103 aa  172  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000100932  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3515  30S ribosomal protein S10  83.17 
 
 
103 aa  172  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000492299  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4644  30S ribosomal protein S10  83.17 
 
 
103 aa  172  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000052499  normal  0.0424233 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03123  hypothetical protein  83.17 
 
 
103 aa  172  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000601511  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3910  30S ribosomal protein S10  81.19 
 
 
103 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00375138  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0859  30S ribosomal protein S10  80.39 
 
 
109 aa  172  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.591238  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0392  30S ribosomal protein S10  83.17 
 
 
103 aa  172  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000144875  hitchhiker  0.00689004 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3616  30S ribosomal protein S10  83.17 
 
 
103 aa  172  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387491  hitchhiker  0.00493043 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3804  30S ribosomal protein S10  83.17 
 
 
103 aa  172  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111294  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2175  30S ribosomal protein S10  82 
 
 
103 aa  172  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000032436  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0420  SSU ribosomal protein S10P  80.39 
 
 
103 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00124832  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0468  30S ribosomal protein S10  81 
 
 
103 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000173961  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0488  30S ribosomal protein S10  81.19 
 
 
103 aa  171  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000350893  hitchhiker  0.00967015 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0483  30S ribosomal protein S10  81.19 
 
 
103 aa  171  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000105944  normal  0.026966 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0294  ribosomal protein S10  79.21 
 
 
103 aa  170  5.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000065146  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0457  30S ribosomal protein S10  79.21 
 
 
103 aa  170  5.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.403688  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0425  30S ribosomal protein S10  80.2 
 
 
103 aa  169  7.999999999999999e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000101436  hitchhiker  0.0000276478 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00444  30S ribosomal protein S10  81 
 
 
103 aa  169  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0405184  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00729  30S ribosomal protein S10  81 
 
 
103 aa  169  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001743  SSU ribosomal protein S10p (S20e)  81 
 
 
103 aa  169  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000127695  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0327  ribosomal protein S10  82.18 
 
 
103 aa  168  2e-41  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2373  30S ribosomal protein S10  77.45 
 
 
103 aa  165  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.837203  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2325  30S ribosomal protein S10  76.47 
 
 
103 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000023421  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2170  ribosomal protein S10  75.49 
 
 
103 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00128539  normal  0.372781 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0322  ribosomal protein S10  74.51 
 
 
103 aa  161  3e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000145691  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1855  30S ribosomal protein S10  76.7 
 
 
115 aa  160  5.0000000000000005e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000106721  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0336  30S ribosomal protein S10  76.7 
 
 
110 aa  160  6e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000189298  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0755  30S ribosomal protein S10  74.26 
 
 
103 aa  156  8e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000508535  normal  0.0162488 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5071  30S ribosomal protein S10  74.26 
 
 
102 aa  156  9e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.755306 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1363  30S ribosomal protein S10  74.26 
 
 
102 aa  156  9e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.562313 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2294  30S ribosomal protein S10  74.26 
 
 
102 aa  156  9e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.335659 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3185  30S ribosomal protein S10  74.26 
 
 
102 aa  156  9e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.887844  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1544  30S ribosomal protein S10  74.26 
 
 
102 aa  156  9e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3668  30S ribosomal protein S10  74.26 
 
 
102 aa  156  9e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3449  30S ribosomal protein S10  74.26 
 
 
102 aa  156  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.852431 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0275  30S ribosomal protein S10  74 
 
 
106 aa  155  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04522  30S ribosomal protein S10  71.84 
 
 
104 aa  155  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000034971  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1678  30S ribosomal protein S10  73.27 
 
 
102 aa  154  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.196634  hitchhiker  0.0000449756 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2689  30S ribosomal protein S10  74 
 
 
102 aa  154  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.283235  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0582  30S ribosomal protein S10  70.87 
 
 
103 aa  154  4e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0245  30S ribosomal protein S10  73 
 
 
104 aa  153  9e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.814405  normal  0.941593 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0985  30S ribosomal protein S10  72.28 
 
 
102 aa  153  9e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547253  normal  0.0405609 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1429  30S ribosomal protein S10  71.29 
 
 
102 aa  152  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0117668  normal  0.0108914 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1331  30S ribosomal protein S10  71.29 
 
 
102 aa  152  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104333  normal  0.0980723 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0354  30S ribosomal protein S10  71.29 
 
 
102 aa  152  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1839  30S ribosomal protein S10  72.28 
 
 
102 aa  152  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.051766  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1907  30S ribosomal protein S10  71.29 
 
 
102 aa  152  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000187857  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1796  SSU ribosomal protein S10P  73.74 
 
 
104 aa  152  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.13057  normal  0.040484 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>