23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0330 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0330  hypothetical protein  100 
 
 
104 aa  218  3e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0716  hypothetical protein  94.57 
 
 
361 aa  185  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0881  hypothetical protein  94.57 
 
 
361 aa  185  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1813  hypothetical protein  94.57 
 
 
361 aa  185  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1945  hypothetical protein  94.57 
 
 
361 aa  185  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2052  hypothetical protein  94.57 
 
 
261 aa  185  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2895  hypothetical protein  94.57 
 
 
361 aa  185  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0038  hypothetical protein  94.57 
 
 
361 aa  185  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1851  hypothetical protein  93.48 
 
 
361 aa  183  8e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0446  transposase IS4 family protein  55 
 
 
354 aa  74.3  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.449518 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5057  hypothetical protein  46.38 
 
 
183 aa  70.1  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00408513  normal  0.218379 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2720  transposase, IS4  41.98 
 
 
331 aa  67.4  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828953  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2834  transposase, IS4  41.98 
 
 
331 aa  67.4  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0452405  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2912  transposase IS4 family protein  41.98 
 
 
331 aa  67.4  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2932  transposase IS4 family protein  41.98 
 
 
331 aa  67.4  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2989  transposase IS4 family protein  41.98 
 
 
331 aa  67.4  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5377  transposase IS4 family protein  49.12 
 
 
354 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.302051 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2594  hypothetical protein  30.38 
 
 
219 aa  47.4  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00339974  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1784  transposase, IS4  30.38 
 
 
352 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2440  transposase, IS4  30.38 
 
 
352 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1056  hypothetical protein  37.74 
 
 
66 aa  44.3  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0265402 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0405  transposase IS4 family protein  32.35 
 
 
383 aa  40.4  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00559123 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0411  transposase IS4 family protein  32.35 
 
 
383 aa  40.4  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.215728  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>