102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lplt30 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lppt30  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt31  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt30  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt31  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt33  tRNA-Lys  91.78 
 
 
73 bp  97.6  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt33  tRNA-Lys  91.78 
 
 
73 bp  97.6  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0033  tRNA-Lys  88.89 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0006  tRNA-Lys  86.11 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0019  tRNA-Lys  86.11 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.870164 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2330  tRNA-Lys  87.5 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2542  tRNA-Lys  87.5 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000723865  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0023  tRNA-Lys  86.11 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.483776  normal  0.0816799 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0025  tRNA-Lys  86.11 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.469225  normal  0.082047 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0039  tRNA-Lys  86.11 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.219334  normal  0.700265 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0057  tRNA-Lys  85.53 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000607595  normal  0.906339 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0058  tRNA-Lys  85.53 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000626368  normal  0.708619 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0059  tRNA-Lys  85.53 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000522849  normal  0.720074 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0060  tRNA-Lys  85.53 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000123741  normal  0.545219 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0061  tRNA-Lys  85.53 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000126169  normal  0.545219 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0062  tRNA-Lys  85.53 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000112705  normal  0.545219 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0064  tRNA-Lys  85.53 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000484105  normal  0.405062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0028  tRNA-Lys  86.11 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.252737  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0030  tRNA-Lys  86.11 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.692876  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0084  tRNA-Lys  86.11 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0065  tRNA-Lys  86.11 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.448477  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0073  tRNA-Lys  86.11 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.115368  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0013  tRNA-Lys  86.11 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.671128  normal  0.694866 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t13  tRNA-Lys  85.51 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000197803  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t15  tRNA-Lys  85.51 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00592778  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t23  tRNA-Lys  85.51 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.806894 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t13  tRNA-Lys  84.72 
 
 
76 bp  56  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741896  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t52  tRNA-Lys  84.72 
 
 
76 bp  56  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.412315  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA11  tRNA-Lys  84.72 
 
 
76 bp  56  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00000000654973  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA23  tRNA-Lys  84.72 
 
 
76 bp  56  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0002  tRNA-Lys  84.21 
 
 
76 bp  56  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R72  tRNA-Lys  84.72 
 
 
76 bp  56  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.564318  normal  0.506273 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R83  tRNA-Lys  84.72 
 
 
76 bp  56  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115902  normal  0.137047 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0023  tRNA-Lys  86.11 
 
 
75 bp  56  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000728017  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0024  tRNA-Lys  86.11 
 
 
75 bp  56  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000367183  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0025  tRNA-Lys  86.11 
 
 
75 bp  56  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000379634  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4531  tRNA-Lys  84.72 
 
 
78 bp  56  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5178  tRNA-Lys  84.72 
 
 
78 bp  56  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.847952  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1660  tRNA-Lys  84.72 
 
 
76 bp  56  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0521  tRNA-Lys  84.72 
 
 
76 bp  56  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0072  tRNA-Lys  84.21 
 
 
76 bp  56  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.18023  normal  0.42489 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Val-3  tRNA-Val  96.77 
 
 
77 bp  54  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00184226  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1734  tRNA-Lys  92.31 
 
 
76 bp  54  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.183043  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1735  tRNA-Lys  92.31 
 
 
76 bp  54  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186999  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1736  tRNA-Lys  92.31 
 
 
76 bp  54  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.336069  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1737  tRNA-Lys  92.31 
 
 
76 bp  54  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.319153  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1738  tRNA-Lys  92.31 
 
 
76 bp  54  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.847044  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1739  tRNA-Lys  92.31 
 
 
76 bp  54  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.829671  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0046  tRNA-Val  96.77 
 
 
77 bp  54  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.461452  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1248  tRNA-Val  96.77 
 
 
77 bp  54  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.134542  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26570  tRNA-Lys  92.11 
 
 
76 bp  52  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000438766  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0052  tRNA-Lys  92.11 
 
 
76 bp  52  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0125474  normal  0.521924 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0053  tRNA-Lys  92.11 
 
 
76 bp  52  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000949911  hitchhiker  0.00166028 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51660  tRNA-Lys  84.06 
 
 
73 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  9.69309e-16  hitchhiker  0.000488803 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60150  tRNA-Lys  84.06 
 
 
73 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000526914  hitchhiker  0.0000000110611 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60080  tRNA-Lys  84.06 
 
 
73 bp  50.1  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.662949  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60410  tRNA-Lys  84.06 
 
 
73 bp  50.1  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200595  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0018  tRNA-Lys  91.67 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.50415e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0019  tRNA-Lys  91.67 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.61246e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0039  tRNA-Lys  91.67 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.722493  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0040  tRNA-Lys  91.67 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.710582  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0054  tRNA-Lys  91.67 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104235  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0055  tRNA-Lys  91.67 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000306269  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0056  tRNA-Lys  91.67 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000278009  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0057  tRNA-Lys  91.67 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000124727  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0058  tRNA-Lys  91.67 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000115493  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0059  tRNA-Lys  91.67 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000128133  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0035  tRNA-Lys  82.89 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0379309  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0036  tRNA-Lys  82.89 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0360191  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0037  tRNA-Lys  82.89 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00809358  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0038  tRNA-Lys  82.89 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0168892  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0039  tRNA-Lys  82.89 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0153762  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0032  tRNA-Lys  91.67 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0037  tRNA-Lys  91.67 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000000657367  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0038  tRNA-Lys  91.67 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000000329533  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0056  tRNA-Lys  91.67 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000735522  normal  0.906339 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0063  tRNA-Lys  91.67 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000807703  normal  0.539027 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0065  tRNA-Lys  91.67 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000203658  normal  0.402163 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  93.55 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0847408  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0020  tRNA-Lys  96.3 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.768536  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0123  tRNA-Arg  93.55 
 
 
78 bp  46.1  0.001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.553606  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0008  tRNA-Val  93.55 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0410887  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0029  tRNA-Val  93.55 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0051  tRNA-Lys  96.3 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000619589  hitchhiker  0.0000190999 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0052  tRNA-Lys  96.3 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000683016  hitchhiker  0.000091513 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0053  tRNA-Lys  96.3 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000619589  hitchhiker  0.0000900565 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0060  tRNA-Lys  96.3 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0060  tRNA-Lys  96.3 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.845098  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna43  tRNA-Lys  96.3 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0022  tRNA-Lys  96.3 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0195324  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0049  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212894 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  96.15 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.047659  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt41  tRNA-Val  93.33 
 
 
78 bp  44.1  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0047  tRNA-Lys  96.15 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0025  tRNA-Lys  96.15 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6048  tRNA-Lys  96.15 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.019189  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>