20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0934 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl0934  hypothetical protein  100 
 
 
112 aa  225  2e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0964  hypothetical protein  99.11 
 
 
112 aa  221  2e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1216  hypothetical protein  39.47 
 
 
114 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.934469  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3059  hypothetical protein  40.35 
 
 
114 aa  69.3  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5059  hypothetical protein  39.39 
 
 
133 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.210325  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1807  hypothetical protein  37.39 
 
 
113 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.250952  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1312  hypothetical protein  38.53 
 
 
109 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00893975  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1290  hypothetical protein  39.39 
 
 
111 aa  65.1  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0435  hypothetical protein  33.94 
 
 
118 aa  63.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.425168 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3109  hypothetical protein  32.41 
 
 
110 aa  62.8  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0187  hypothetical protein  38.38 
 
 
113 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.704355  normal  0.309268 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2776  hypothetical protein  36.27 
 
 
113 aa  60.1  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0303  hypothetical protein  39.09 
 
 
126 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0189  hypothetical protein  37.37 
 
 
113 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.948948  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0395  hypothetical protein  36.08 
 
 
129 aa  58.9  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0802537 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0052  hypothetical protein  32.29 
 
 
112 aa  57  0.00000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1078  hypothetical protein  34.31 
 
 
113 aa  55.1  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0132  hypothetical protein  34.34 
 
 
112 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.633937  normal  0.655967 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3767  hypothetical protein  41.18 
 
 
73 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2825  hypothetical protein  27.84 
 
 
123 aa  45.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.712693  normal  0.211414 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>