279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_B0008 on replicon NC_009705
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009705  YpsIP31758_B0008  M23 peptidase domain-containing protein  100 
 
 		 351 aa  726    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  41.18 
 
 		 305 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  40 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  40 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  34.74 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0060  hypothetical protein  39.29 
 
 		 430 aa  58.2  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.86289e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  38.82 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  38.82 
 
 		 351 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  33.62 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5984  peptidase M23B  35.48 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0310033  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  37.65 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  35.59 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  36.9 
 
 		 491 aa  56.6  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  27.61 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  38.38 
 
 		 455 aa  56.2  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1223  Peptidase M23  31.36 
 
 		 414 aa  55.8  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  32.48 
 
 		 313 aa  55.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  30 
 
 		 457 aa  55.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2410  peptidoglycan-binding LysM  40.23 
 
 		 295 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000688679  unclonable  0.000000112748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7995  Peptidase M23  35.05 
 
 		 536 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  34.75 
 
 		 244 aa  54.7  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  38.1 
 
 		 266 aa  54.3  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  39.77 
 
 		 455 aa  54.7  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  36.9 
 
 		 318 aa  54.3  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1445  peptidase, M23/M37 family  32.43 
 
 		 274 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.813249  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  35 
 
 		 460 aa  53.9  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1828  hypothetical protein  38.1 
 
 		 440 aa  53.9  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000168261  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  38.89 
 
 		 268 aa  53.9  0.000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2112  hypothetical protein  38.1 
 
 		 441 aa  53.9  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000011239  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  30.66 
 
 		 323 aa  53.5  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3491  peptidase M23B  35.14 
 
 		 280 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.172269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  37.65 
 
 		 231 aa  53.1  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19390  metalloendopeptidase-like membrane protein  38.1 
 
 		 287 aa  53.1  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341339  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  32.2 
 
 		 352 aa  53.5  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  33.33 
 
 		 300 aa  53.1  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  34 
 
 		 367 aa  53.1  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4428  Peptidase M23  32.94 
 
 		 272 aa  53.1  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1304  peptidase M23B  32.22 
 
 		 413 aa  52.8  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137059  normal  0.602682 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2450  peptidase M23B  30.77 
 
 		 428 aa  52.8  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1354  peptidase M23B  30.5 
 
 		 424 aa  52.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000810467  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1258  peptidase M23B  31.53 
 
 		 274 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  37.37 
 
 		 454 aa  51.2  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2416  hypothetical protein  35.63 
 
 		 410 aa  51.6  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000144361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2026  hypothetical protein  35.63 
 
 		 438 aa  51.2  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148125  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1368  peptidase M23  31.65 
 
 		 434 aa  52  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  33.05 
 
 		 524 aa  51.6  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3512  peptidase M23B  34.09 
 
 		 299 aa  51.6  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000873252  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2139  hypothetical protein  35.63 
 
 		 438 aa  51.2  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000192356  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2470  Peptidase M23  35.29 
 
 		 332 aa  51.2  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  34.88 
 
 		 388 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  36.36 
 
 		 453 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  38.37 
 
 		 438 aa  50.4  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3442  Peptidase M23  34.12 
 
 		 546 aa  50.8  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  32.22 
 
 		 384 aa  50.4  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1938  peptidase, M23/M37 family  31.25 
 
 		 564 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2868799999999999e-45 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  31.46 
 
 		 446 aa  50.1  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04900  metalloendopeptidase-like membrane protein  34.52 
 
 		 235 aa  50.1  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  30.85 
 
 		 348 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2772  hypothetical protein  33.7 
 
 		 440 aa  50.1  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000802583  hitchhiker  0.00694213 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15100  hypothetical protein  31.53 
 
 		 282 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.000839665 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2495  Peptidase M23  38.1 
 
 		 331 aa  50.1  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  35.71 
 
 		 319 aa  49.7  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  29.9 
 
 		 283 aa  49.7  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0853  exported peptidase  35.71 
 
 		 446 aa  49.7  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.141822  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1765  M24/M37 family peptidase  31.88 
 
 		 564 aa  49.7  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000130231  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1903  M23/37 family peptidase  31.88 
 
 		 564 aa  49.7  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000402629  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2504  peptidase M23B  33.33 
 
 		 423 aa  49.7  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331029  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  37.37 
 
 		 459 aa  49.7  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  36.78 
 
 		 303 aa  49.7  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2250  hypothetical protein  38.1 
 
 		 470 aa  49.7  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0038093  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0038  peptidase M23B  33.72 
 
 		 597 aa  49.7  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4205  peptidase M23B  34.88 
 
 		 236 aa  49.7  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3225  peptidase M23B  31.52 
 
 		 443 aa  49.7  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.755339  normal  0.375504 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3518  Peptidase M23  34.12 
 
 		 406 aa  49.7  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.829131  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1909  peptidase, M23/M37 family  31.25 
 
 		 564 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00585964  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4626  peptidase M23B  33.72 
 
 		 592 aa  49.3  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0163104 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1554  M24/M37 family peptidase  30.5 
 
 		 423 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000152765  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1742  peptidase M23/M37 family protein  31.25 
 
 		 564 aa  49.3  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000319429  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  32.14 
 
 		 285 aa  49.3  0.00009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05623  hypothetical protein  35.23 
 
 		 328 aa  49.3  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1592  peptidase, M23/M37 family  30.5 
 
 		 423 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000620859  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4473  peptidase M23B  32.95 
 
 		 630 aa  49.3  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0267  peptidoglycan hydrolase  34.26 
 
 		 316 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.578781  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  37.37 
 
 		 456 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0260  peptidoglycan hydrolase  34.26 
 
 		 316 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1339  M24/M37 family peptidase  30.5 
 
 		 417 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000501622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1314  cell wall endopeptidase  30.5 
 
 		 423 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000373067  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1313  cell wall endopeptidase  30.5 
 
 		 423 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000309784  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  30.13 
 
 		 754 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1152  peptidase M23B  31.82 
 
 		 414 aa  49.3  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000291008  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1646  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  37.65 
 
 		 248 aa  48.9  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.570168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  35.71 
 
 		 369 aa  49.3  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1523  peptidase, M23/M37 family  30.5 
 
 		 423 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.25649e-59 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2141  hypothetical protein  34.52 
 
 		 486 aa  48.9  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.0000028881  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3112  peptidase M23B  30.6 
 
 		 633 aa  48.9  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.233689 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3080  peptidase M23B  36.9 
 
 		 247 aa  49.3  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.390999  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3705  peptidase M23B  32.94 
 
 		 340 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  29.91 
 
 		 301 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1328  hypothetical protein  30.63 
 
 		 282 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4510  peptidase M23B  31.4 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>