110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3035 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00428  inosine/guanosine kinase  83.41 
 
 
434 aa  774    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3133  Inosine kinase  83.41 
 
 
434 aa  774    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.838114  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003853  inosine-guanosine kinase  72.81 
 
 
434 aa  687    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.088353  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0956  inosine-guanosine kinase  83.41 
 
 
434 aa  777    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0647  inosine-guanosine kinase  73.5 
 
 
434 aa  694    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.243174  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3035  inosine-guanosine kinase  100 
 
 
434 aa  910    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0618188  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01826  inosine kinase  73.04 
 
 
434 aa  684    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0554  inosine-guanosine kinase  83.41 
 
 
434 aa  774    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0516  inosine-guanosine kinase  83.41 
 
 
434 aa  774    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.812213  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1144  inosine kinase  89.4 
 
 
434 aa  822    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.956957  unclonable  0.0000000331815 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1258  inosine-guanosine kinase  100 
 
 
434 aa  910    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000666665  hitchhiker  0.00000119975 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3176  inosine kinase  100 
 
 
434 aa  910    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.706917  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3139  inosine kinase  83.41 
 
 
434 aa  774    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000536368 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0521  inosine kinase  83.41 
 
 
434 aa  774    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0701891  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0409  inosine kinase  83.41 
 
 
434 aa  774    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0543  inosine kinase  84.79 
 
 
434 aa  786    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0598  inosine kinase  84.79 
 
 
434 aa  786    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.366249  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0553  inosine kinase  84.79 
 
 
434 aa  786    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.770781 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0537  inosine kinase  84.79 
 
 
434 aa  786    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0538  inosine kinase  84.56 
 
 
434 aa  783    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1847  inosine-guanosine kinase  73.04 
 
 
434 aa  687    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.324608  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0569  inosine kinase  83.41 
 
 
434 aa  774    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.858923  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00433  hypothetical protein  83.41 
 
 
434 aa  774    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0433  inosine-guanosine kinase  66.36 
 
 
434 aa  629  1e-179  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.355559  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1541  inosine kinase  66.82 
 
 
434 aa  625  1e-178  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.209586  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2020  inosine-guanosine kinase  66.36 
 
 
434 aa  622  1e-177  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1431  inosine kinase  66.36 
 
 
434 aa  623  1e-177  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000183569  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2544  inosine kinase  67.05 
 
 
434 aa  622  1e-177  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.247957  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2295  inosine kinase  66.82 
 
 
434 aa  622  1e-177  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000546869  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2582  inosine kinase  67.05 
 
 
434 aa  622  1e-177  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00525217  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2659  inosine kinase  67.05 
 
 
434 aa  622  1e-177  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0486522  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1802  Inosine kinase  67.05 
 
 
434 aa  622  1e-177  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0521986  hitchhiker  0.0000108014 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2247  inosine-guanosine kinase  65.9 
 
 
434 aa  619  1e-176  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000474841  normal  0.0326769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2319  inosine-guanosine kinase  65.9 
 
 
434 aa  619  1e-176  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000788417  unclonable  0.0000471169 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2439  inosine-guanosine kinase  65.67 
 
 
434 aa  617  1e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0642312  normal  0.907957 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0500  inosine-guanosine kinase  64.98 
 
 
434 aa  616  1e-175  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0187048  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1317  inosine kinase  64.75 
 
 
434 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.110891  normal  0.220477 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05942  inosine-guanosine kinase  64.52 
 
 
434 aa  612  9.999999999999999e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000207  inosine-guanosine kinase  64.52 
 
 
434 aa  612  9.999999999999999e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.471058  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1530  inosine kinase  66.67 
 
 
442 aa  599  1e-170  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00064994  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2228  inosine kinase  64.75 
 
 
434 aa  591  1e-168  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0216466  hitchhiker  0.00128428 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2845  inosine kinase  64.75 
 
 
434 aa  592  1e-168  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000469104  decreased coverage  0.00000000256797 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1799  inosine kinase  65.9 
 
 
434 aa  592  1e-168  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00398478  hitchhiker  0.000000265344 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3227  inosine kinase  54.38 
 
 
432 aa  503  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00215137  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  25.7 
 
 
407 aa  72  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  26.46 
 
 
328 aa  71.2  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  26.64 
 
 
338 aa  71.2  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  23.77 
 
 
335 aa  69.3  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  22.37 
 
 
335 aa  68.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  25.84 
 
 
328 aa  66.6  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  29.18 
 
 
332 aa  66.6  0.0000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  25.66 
 
 
337 aa  66.2  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  27.69 
 
 
331 aa  66.2  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3022  PfkB domain protein  25.3 
 
 
333 aa  66.2  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523599  normal  0.417909 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  26.92 
 
 
337 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0690  carbohydrate kinase PfkB family  26.43 
 
 
338 aa  64.7  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  26.07 
 
 
337 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  23.83 
 
 
333 aa  63.5  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  22.59 
 
 
328 aa  63.5  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  23.44 
 
 
333 aa  62.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  25.64 
 
 
337 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  25.64 
 
 
337 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  25.54 
 
 
333 aa  60.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  25.43 
 
 
333 aa  60.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  24.67 
 
 
342 aa  59.7  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  24.9 
 
 
333 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  25.11 
 
 
333 aa  58.9  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  20.57 
 
 
341 aa  58.9  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  21.73 
 
 
331 aa  58.2  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  23.38 
 
 
335 aa  58.2  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  23.83 
 
 
334 aa  57.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  24.44 
 
 
336 aa  57.8  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  22.35 
 
 
348 aa  57.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  24.89 
 
 
333 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2764  PfkB  21.66 
 
 
370 aa  56.6  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.040802  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  25.54 
 
 
333 aa  55.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  26.05 
 
 
330 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  21.94 
 
 
327 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  21.94 
 
 
327 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1030  pfkB family carbohydrate kinase  23.87 
 
 
330 aa  53.9  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.577037  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1668  carbohydrate kinase PfkB family  24.28 
 
 
337 aa  53.9  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2691  ribokinase-like domain-containing protein  23.87 
 
 
330 aa  53.9  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272607  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  23.71 
 
 
333 aa  52.8  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  19.85 
 
 
328 aa  52.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  21.18 
 
 
338 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  24.37 
 
 
333 aa  52.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  20.71 
 
 
330 aa  52  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0198  ribokinase-like domain-containing protein  24.23 
 
 
330 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2568  ribokinase-like domain-containing protein  26.17 
 
 
333 aa  52  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  23.81 
 
 
333 aa  52  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  22.87 
 
 
298 aa  51.6  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  20.89 
 
 
339 aa  51.2  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000468276  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  24.37 
 
 
331 aa  50.1  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  25.21 
 
 
330 aa  49.7  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  25.21 
 
 
330 aa  49.7  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18364  predicted protein  26.75 
 
 
273 aa  48.9  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.132458 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2022  ribokinase-like domain-containing protein  25.75 
 
 
330 aa  48.5  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  25.48 
 
 
331 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  30.56 
 
 
309 aa  48.5  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  26.67 
 
 
297 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>