28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2544 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A1944  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  308  2e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000019157  normal  0.132767 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2544  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  307  2.9999999999999997e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.10259e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2632  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  307  2.9999999999999997e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000555352  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1753  hypothetical protein  86 
 
 		 152 aa  261  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137665  decreased coverage  0.000000411108 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2164  hypothetical protein  80 
 
 		 150 aa  245  1e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000275676  normal  0.229611 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2687  protein of unknown function DUF1047  80 
 
 		 150 aa  245  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  2.43085e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00960  hypothetical protein  80 
 
 		 150 aa  245  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000190076  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00967  hypothetical protein  80 
 
 		 150 aa  245  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000351017  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1120  hypothetical protein  80 
 
 		 150 aa  245  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345625  normal  0.906723 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1065  hypothetical protein  80 
 
 		 150 aa  245  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.95489e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2640  hypothetical protein  80 
 
 		 150 aa  245  2e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000830726  hitchhiker  0.000000341922 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1070  hypothetical protein  79.33 
 
 		 150 aa  243  8e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000010913  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2859  hypothetical protein  81.08 
 
 		 153 aa  243  8e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000499435  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2360  hypothetical protein  79.33 
 
 		 150 aa  242  9.999999999999999e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.93337e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1144  hypothetical protein  78.52 
 
 		 150 aa  242  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000646309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1027  hypothetical protein  78.52 
 
 		 150 aa  242  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000404614  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1132  hypothetical protein  78.52 
 
 		 150 aa  242  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000320725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1178  hypothetical protein  78.52 
 
 		 150 aa  242  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000328612  normal  0.811815 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1110  hypothetical protein  78.52 
 
 		 150 aa  242  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000188427  hitchhiker  0.00310953 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2550  hypothetical protein  78 
 
 		 152 aa  237  5e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000402776  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1468  hypothetical protein  77.18 
 
 		 151 aa  234  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000258069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1565  hypothetical protein  77.03 
 
 		 153 aa  232  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1599  hypothetical protein  73.83 
 
 		 157 aa  226  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000141741  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1558  hypothetical protein  57.14 
 
 		 148 aa  174  3e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00564355  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02330  hypothetical protein  55.1 
 
 		 149 aa  169  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003445  hypothetical protein  55.1 
 
 		 149 aa  169  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000947124  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1089  hypothetical protein  52.38 
 
 		 169 aa  162  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0857  hypothetical protein  51.7 
 
 		 148 aa  157  5e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000117366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>