More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2244 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2244  replicative DNA helicase  100 
 
 		 457 aa  934    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000169478  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1140  replicative DNA helicase  64.76 
 
 		 462 aa  612  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0320772  hitchhiker  6.75353e-23 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2248  DnaB family helicase  62.45 
 
 		 463 aa  595  1e-169  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000601799  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0625  replicative DNA helicase  48.47 
 
 		 458 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.849454  hitchhiker  0.00500749 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0385  replicative DNA helicase  48.47 
 
 		 458 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.139833  hitchhiker  0.000000000000128218 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2920  replicative DNA helicase  49.43 
 
 		 458 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0425045  hitchhiker  0.00000000000000950507 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4929  replicative DNA helicase  34.85 
 
 		 464 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0585  replicative DNA helicase  34.62 
 
 		 464 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.35566 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0649  replicative DNA helicase  35.15 
 
 		 464 aa  220  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112072 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4873  replicative DNA helicase  33.71 
 
 		 465 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.581353 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5658  replicative DNA helicase  34.92 
 
 		 464 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313319  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4664  replicative DNA helicase  33.94 
 
 		 465 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0851035 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4754  replicative DNA helicase  33.71 
 
 		 465 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.100967 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65130  replicative DNA helicase  34.92 
 
 		 464 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4930  replicative DNA helicase  34.09 
 
 		 465 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000680092 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07680  replicative DNA helicase  34.4 
 
 		 463 aa  216  5.9999999999999996e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0758  replicative DNA helicase  35.36 
 
 		 468 aa  216  7e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000129174  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4444  replicative DNA helicase  34.27 
 
 		 447 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0931  replicative DNA helicase  36.01 
 
 		 470 aa  213  5.999999999999999e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000071326 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3917  replicative DNA helicase  35.14 
 
 		 468 aa  212  1e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0538  replicative DNA helicase  33.71 
 
 		 465 aa  211  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0892  replicative DNA helicase  33.87 
 
 		 462 aa  211  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3248  primary replicative DNA helicase  35.14 
 
 		 468 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559812  hitchhiker  0.000199485 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0692  primary replicative DNA helicase  35.14 
 
 		 468 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000012144  hitchhiker  0.000391995 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0713  primary replicative DNA helicase  34.91 
 
 		 468 aa  209  6e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000291308  hitchhiker  0.0000817807 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58990  putative DNA helicase  34.2 
 
 		 448 aa  209  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144919  normal  0.0290117 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0521  replicative DNA helicase  34.91 
 
 		 468 aa  206  5e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000437695  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1531  DnaB helicase  35.42 
 
 		 448 aa  206  6e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.498152  normal  0.108939 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  34.68 
 
 		 462 aa  206  8e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2278  replicative DNA helicase  34.16 
 
 		 455 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.467849  hitchhiker  0.000000922003 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3346  replicative DNA helicase  33.78 
 
 		 468 aa  203  6e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0700986  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0746  replicative DNA helicase  33.94 
 
 		 468 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000104004  hitchhiker  0.000200026 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  33.64 
 
 		 461 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3638  replicative DNA helicase  33.94 
 
 		 468 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132195  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0716  replicative DNA helicase  33.94 
 
 		 468 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000107977  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0737  replicative DNA helicase  33.94 
 
 		 468 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000169496  unclonable  0.00000000000388708 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1060  primary replicative DNA helicase  34.39 
 
 		 488 aa  201  3e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3278  replicative DNA helicase  33.63 
 
 		 468 aa  200  5e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000542812  unclonable  0.00000295185 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3058  replicative DNA helicase  34.15 
 
 		 468 aa  199  7e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000123089  normal  0.262766 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  33.72 
 
 		 461 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2068  DnaB helicase  37.39 
 
 		 466 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4292  replicative DNA helicase  32.88 
 
 		 471 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4115  replicative DNA helicase  34.93 
 
 		 451 aa  196  6e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03924  replicative DNA helicase  32.65 
 
 		 471 aa  196  7e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.53441  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4513  replicative DNA helicase  32.65 
 
 		 471 aa  196  7e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3976  replicative DNA helicase  32.65 
 
 		 471 aa  196  7e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.40263 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03884  hypothetical protein  32.65 
 
 		 471 aa  196  7e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.543473  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4543  replicative DNA helicase  32.65 
 
 		 471 aa  196  7e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5554  replicative DNA helicase  32.65 
 
 		 471 aa  196  7e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4604  replicative DNA helicase  32.65 
 
 		 471 aa  196  7e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3581  replicative DNA helicase  32.96 
 
 		 468 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000011661  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3941  replicative DNA helicase  32.65 
 
 		 471 aa  195  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2782  replicative DNA helicase  33.48 
 
 		 468 aa  195  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000557541  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0251  replicative DNA helicase  33.79 
 
 		 478 aa  195  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000686038  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  33.79 
 
 		 465 aa  194  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002337  replicative DNA helicase  33.18 
 
 		 466 aa  194  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000292135  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0256  replicative DNA helicase  32.73 
 
 		 470 aa  193  4e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.663248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1232  replicative DNA helicase  34.27 
 
 		 452 aa  193  4e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.323473  normal  0.298764 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4207  replicative DNA helicase  33.18 
 
 		 468 aa  193  6e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000507576  hitchhiker  0.000100726 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0762  replicative DNA helicase  33.41 
 
 		 468 aa  192  8e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000711425  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2382  replicative DNA helicase  32.56 
 
 		 472 aa  192  9e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  32.41 
 
 		 447 aa  192  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0709  replicative DNA helicase  32.88 
 
 		 467 aa  191  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.446407  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2002  replicative DNA helicase  34.01 
 
 		 463 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2101  primary replicative DNA helicase  34.93 
 
 		 463 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1947  replicative DNA helicase  32.66 
 
 		 470 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1975  replicative DNA helicase  33.93 
 
 		 463 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131049  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0302  replicative DNA helicase  34.25 
 
 		 451 aa  191  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000556041 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00018  replicative DNA helicase  33.71 
 
 		 466 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4361  replicative DNA helicase  32.88 
 
 		 472 aa  190  4e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4640  replicative DNA helicase  32.58 
 
 		 471 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.215125 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1186  replicative DNA helicase  34.62 
 
 		 462 aa  190  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.104196  normal  0.0632375 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4494  replicative DNA helicase  32.58 
 
 		 471 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.865331  normal  0.0705585 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4589  replicative DNA helicase  32.58 
 
 		 471 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.481251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4503  replicative DNA helicase  32.58 
 
 		 471 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0382  replicative DNA helicase  32.59 
 
 		 465 aa  190  4e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00608518  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4588  replicative DNA helicase  32.58 
 
 		 471 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1247  replicative DNA helicase  34.62 
 
 		 462 aa  190  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.250408  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1311  replicative DNA helicase  34.54 
 
 		 473 aa  189  7e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3596  replicative DNA helicase  32.71 
 
 		 437 aa  189  9e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0741  replicative DNA helicase  32.44 
 
 		 468 aa  189  9e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3855  replicative DNA helicase  31.54 
 
 		 451 aa  188  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000204415  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3765  replicative DNA helicase  31.54 
 
 		 468 aa  188  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002721  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0755  replicative DNA helicase  31.54 
 
 		 468 aa  188  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000903078  normal  0.0879158 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3498  replicative DNA helicase  31.77 
 
 		 468 aa  188  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  32.95 
 
 		 460 aa  187  4e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0357  replicative DNA helicase  38.13 
 
 		 465 aa  187  4e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.973101 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0223  DnaB helicase  33.33 
 
 		 472 aa  187  4e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3371  DnaB family helicase  32.73 
 
 		 455 aa  187  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  32.95 
 
 		 460 aa  186  6e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3461  replicative DNA helicase  31.26 
 
 		 458 aa  186  6e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.951861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1337  replicative DNA helicase  31.89 
 
 		 450 aa  186  9e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3636  replicative DNA helicase  31.77 
 
 		 468 aa  186  9e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.578582  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0192  replicative DNA helicase DnaB  32.05 
 
 		 466 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0607  replicative DNA helicase  31.32 
 
 		 453 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1790  replicative DNA helicase  32.58 
 
 		 461 aa  184  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0711961 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1220  primary replicative DNA helicase  34.69 
 
 		 469 aa  183  6e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2452  replicative DNA helicase  32.58 
 
 		 461 aa  183  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.034153  normal  0.221442 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  32.89 
 
 		 446 aa  183  6e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3665  replicative DNA helicase  32.07 
 
 		 470 aa  183  7e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000253139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>