More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1268 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00413  multidrug efflux system protein  67.71 
 
 
1049 aa  1414    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02361  aminoglycoside/multidrug efflux system  79.63 
 
 
1037 aa  1754    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03124  multidrug efflux system protein  65.09 
 
 
1034 aa  1350    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03362  multidrug transporter, RpoS-dependent  62.02 
 
 
1037 aa  1280    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0199  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  62.02 
 
 
1037 aa  1280    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0440  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  64.99 
 
 
1034 aa  1350    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1200  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  79.63 
 
 
1037 aa  1754    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3148  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  67.71 
 
 
1049 aa  1414    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2696  AcrB/AcrD/AcrF family protein  59.28 
 
 
1052 aa  1268    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1385  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  60.06 
 
 
1050 aa  1291    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.252885 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2818  multidrug efflux RND transporter MexD  50.44 
 
 
1042 aa  992    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.231957  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3456  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  53.7 
 
 
1042 aa  1055    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.417579 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0010  putative acriflavin resistance transmembrane protein  55.13 
 
 
1049 aa  1129    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.461171  normal  0.0539399 
 
 
-
 
NC_003296  RS01889  drug efflux transmembrane protein  61.59 
 
 
1053 aa  1283    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.43508  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0312  multidrug efflux system transmembrane protein  50.98 
 
 
1049 aa  984    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.712007  normal  0.0691835 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1355  hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  45.07 
 
 
1052 aa  849    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0292  hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  43.86 
 
 
1051 aa  845    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4692  AcrB/AcrD/AcrF family protein  63.05 
 
 
1044 aa  1339    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2592  AcrB/AcrD/AcrF family protein  49.13 
 
 
1047 aa  982    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.886048  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4304  AcrB/AcrD/AcrF family protein  60.54 
 
 
1044 aa  1289    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0316  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  62.9 
 
 
1066 aa  1307    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.611401  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2282  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  49.23 
 
 
1047 aa  1007    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0161777 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2865  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  62.15 
 
 
1048 aa  1266    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.536014  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4008  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  60.64 
 
 
1044 aa  1294    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.507214  normal  0.0226563 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1576  RND superfmily multidrug/dye/detergent efflux pump AcrB  56.9 
 
 
1075 aa  1225    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00327215  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2161  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  43.1 
 
 
1040 aa  838    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297975  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6289  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  45.92 
 
 
1076 aa  915    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.72315  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3441  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  57.75 
 
 
1051 aa  1176    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.388058  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4089  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  60.4 
 
 
1050 aa  1301    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1417  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  62.96 
 
 
1054 aa  1294    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2741  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  50.05 
 
 
1053 aa  1013    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0254632  normal  0.595563 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3838  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  43.06 
 
 
1057 aa  855    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1019  inner membrane protein  63 
 
 
1066 aa  1311    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2058  multidrug efflux protein  51.4 
 
 
1043 aa  1045    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.572121  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1279  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  61.14 
 
 
1054 aa  1288    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0197931  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2757  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  50.1 
 
 
1043 aa  996    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0156651  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2894  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  54.29 
 
 
1032 aa  1095    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0114017  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3318  cation efflux transporter  53.94 
 
 
1039 aa  1089    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0288  acridine efflux pump  60 
 
 
1053 aa  1243    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6608  hydrophobe/amphiphile efflux-1 pump, HAE1  61.84 
 
 
1063 aa  1276    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164679  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6824  hydrophobe/amphiphile efflux pump  50 
 
 
1047 aa  971    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.78636  normal  0.200306 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4768  multidrug efflux protein  51.36 
 
 
1045 aa  1040    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157004  normal  0.612563 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4995  hydrophobe/amphiphile efflux-1 pump, HAE1  43.82 
 
 
1053 aa  899    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5939  hydrophobe/amphiphile efflux-1 pump, HAE1  62.8 
 
 
1066 aa  1308    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.794955  normal  0.377291 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1194  hydrophobe/amphiphile efflux pump protein  59.27 
 
 
1047 aa  1240    Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000151988  normal  0.324447 
 
 
 
NC_007517  Gmet_0810  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  58.5 
 
 
1053 aa  1276    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0578255 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1532  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  55.37 
 
 
1049 aa  1211    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.075861  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0536  resistance-nodulation-cell division family transporter  43.33 
 
 
1034 aa  847    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0688  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  43.66 
 
 
1057 aa  868    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.67862  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1118  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  49.61 
 
 
1052 aa  1004    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.558549  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2051  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  62.62 
 
 
1050 aa  1287    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.625984  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0681  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  63.09 
 
 
1066 aa  1313    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.321186  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2444  multidrug efflux protein  51.85 
 
 
1043 aa  1048    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.678369  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0517  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  60.5 
 
 
1055 aa  1221    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735363  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2239  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  61.17 
 
 
1048 aa  1283    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4026  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  49.32 
 
 
1053 aa  1016    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.698151 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1219  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  55.21 
 
 
1044 aa  1124    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164773  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2065  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  53.63 
 
 
1052 aa  1037    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1871  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  60.79 
 
 
1046 aa  1245    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2729  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  50.82 
 
 
1036 aa  1018    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0409192  normal  0.0822346 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1360  multidrug efflux protein  48.74 
 
 
1037 aa  981    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2036  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  53.4 
 
 
1059 aa  1059    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.602316  hitchhiker  0.00575958 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0709  RND efflux hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  62.32 
 
 
1069 aa  1315    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.125833  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1743  RND family hydrophobe/amphiphile efflux pump  45.96 
 
 
1084 aa  951    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.134866  normal  0.952788 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2985  RND family hydrophobe/amphiphile efflux pump  45.84 
 
 
1068 aa  931    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.684616 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3602  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  60.59 
 
 
1046 aa  1272    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2681  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  49.66 
 
 
1049 aa  993    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0839162  normal  0.444783 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3330  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  48.65 
 
 
1042 aa  1002    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.66718  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3780  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  49.22 
 
 
1054 aa  1006    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0221065 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3538  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  49.71 
 
 
1056 aa  1004    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1758  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  56.64 
 
 
1100 aa  1218    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.04251 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1121  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  44.67 
 
 
1044 aa  908    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3589  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  58.04 
 
 
1050 aa  1205    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421189  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3924  multidrug efflux system protein  61.64 
 
 
1048 aa  1294    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0170856  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1449  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  50.96 
 
 
1054 aa  968    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.819785  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1143  multidrug efflux protein  51.26 
 
 
1046 aa  1012    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.829538  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1998  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  63.09 
 
 
1066 aa  1310    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4471  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  50.79 
 
 
1047 aa  1012    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5600  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  57.05 
 
 
1065 aa  1169    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5838  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  61.35 
 
 
1063 aa  1258    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347364  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6372  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  44.39 
 
 
1059 aa  907    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3799  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  53.91 
 
 
1053 aa  1076    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3836  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  62.72 
 
 
1044 aa  1327    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3929  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  62.72 
 
 
1044 aa  1327    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3862  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  61.17 
 
 
1051 aa  1290    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.395414  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1521  multidrug efflux protein  51.75 
 
 
1045 aa  1025    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2655  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  62.71 
 
 
1066 aa  1306    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.665349  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05540  RND multidrug efflux transporter MexB  63.53 
 
 
1046 aa  1347    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.277681  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38410  multidrug efflux protein  50.43 
 
 
1045 aa  1077    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0368685 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60830  multidrug efflux RND transporter MexD  49.66 
 
 
1043 aa  983    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.503401  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1623  multidrug efflux protein  51.26 
 
 
1046 aa  1012    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1706  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  44.39 
 
 
1059 aa  907    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2608  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  63.09 
 
 
1066 aa  1310    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728592  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3895  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  50.79 
 
 
1047 aa  1012    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.735116  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5964  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  57.24 
 
 
1065 aa  1172    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6205  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  61.35 
 
 
1063 aa  1258    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.956257  normal  0.010149 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3679  acriflavin resistance protein  55.79 
 
 
1057 aa  1146    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.441622  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3922  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.2 
 
 
1052 aa  840    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.222699 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3161  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  57.66 
 
 
1041 aa  1243    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.362215  unclonable  0.00000213823 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4045  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  63.3 
 
 
1044 aa  1335    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>