More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1089 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1143  CrcB protein  100 
 
 		 126 aa  228  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1089  CrcB-like protein  100 
 
 		 120 aa  228  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.678509  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3566  crcB-like protein  99.17 
 
 		 126 aa  227  4e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00153243  normal  0.458256 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1326  crcB protein  70 
 
 		 129 aa  140  9e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1370  camphor resistance protein CrcB  69.17 
 
 		 129 aa  137  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5115  Camphor resistance CrcB protein  55.45 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1468  CrcB protein  54.29 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1306  CrcB protein  54.29 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  33.61 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  33.33 
 
 		 118 aa  70.1  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1548  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  39.09 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  37.07 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  37.84 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  40.18 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  40.34 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  36.07 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  32.76 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  36.8 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2648  CrcB protein  38.64 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0838344  normal  0.517536 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0814  CrcB protein  35.45 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  37.38 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  36.8 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  39.02 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  33.33 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0820  CrcB protein  35.4 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000163322  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  36.67 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  36.36 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4784  camphor resistance protein CrcB  32.48 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1088  camphor resistance protein CrcB  34.48 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.97219  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3565  camphor resistance protein CrcB  34.48 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00692175  normal  0.464407 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1142  camphor resistance protein CrcB  34.48 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.747152  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13087  camphor resistance protein CrcB  37.9 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.3757  normal  0.719495 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5186  camphor resistance protein CrcB  32.74 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5216  camphor resistance protein CrcB  31.62 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0397  CrcB protein  38.94 
 
 		 166 aa  60.1  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.302556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4408  camphor resistance protein CrcB  37.29 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  40.35 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  32.48 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4941  camphor resistance protein CrcB  31.62 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  34.55 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5319  camphor resistance protein CrcB  31.62 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3649  camphor resistance protein CrcB  31.86 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.602908  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5220  camphor resistance protein CrcB  32.48 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000234645  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5235  camphor resistance protein CrcB  31.62 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4903  camphor resistance protein CrcB  31.62 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2948  hypothetical protein  37.21 
 
 		 270 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4802  camphor resistance protein CrcB  31.62 
 
 		 137 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7364  CrcB protein  37.04 
 
 		 120 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  41.3 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  35.58 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  35.58 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0243  Camphor resistance CrcB protein  37.7 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  34.45 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  36.26 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0027  camphor resistance protein CrcB  33.61 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0257719 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  32.74 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3267  CrcB protein  31.3 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.954917  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0789  CrcB protein  37.84 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.76348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2385  camphor resistance protein CrcB  47.67 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427512 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28190  camphor resistance protein CrcB  37.61 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152767  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0513  CrcB protein  30.51 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1481  camphor resistance CrcB protein  35.23 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  38.89 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0524  camphor resistance protein CrcB  30.25 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000767193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  34.48 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3620  camphor resistance protein CrcB  36 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  34.62 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  32.76 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  31.86 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  33.94 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1835  camphor resistance protein CrcB  31.67 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1870  camphor resistance protein CrcB  31.67 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  32.76 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5217  camphor resistance protein CrcB  32.77 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  39.5 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0028  camphor resistance protein CrcB  30.97 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0202  camphor resistance protein CrcB  32.35 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0802663 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0818  camphor resistance protein CrcB  37.17 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.682767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4785  camphor resistance protein CrcB  32.77 
 
 		 118 aa  53.5  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  36.25 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  35.48 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4904  camphor resistance protein CrcB  32.77 
 
 		 118 aa  53.5  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  40.19 
 
 		 130 aa  53.5  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4942  camphor resistance protein CrcB  32.77 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4803  camphor resistance protein CrcB  32.77 
 
 		 118 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3583  camphor resistance protein CrcB  37.27 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0447685  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5320  camphor resistance protein CrcB  32.77 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2324  camphor resistance protein CrcB  36.63 
 
 		 173 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.618348  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2843  camphor resistance protein CrcB  33.64 
 
 		 130 aa  52.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0819  camphor resistance protein CrcB  32.71 
 
 		 121 aa  52.8  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5236  camphor resistance protein CrcB  32.77 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2721  Camphor resistance CrcB protein  35.56 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.186875 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0768  camphor resistance protein CrcB  37.17 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  38.53 
 
 		 124 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0846  CrcB protein  38.1 
 
 		 125 aa  52.8  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0135352 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5187  camphor resistance protein CrcB  32.77 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>