141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0665 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0665  outer membrane lipoprotein PcP  100 
 
 
155 aa  298  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0736  17 kDa surface antigen  98.06 
 
 
155 aa  294  4e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1769  outer membrane lipoprotein Pcp  69.68 
 
 
155 aa  200  7e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000141648  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2558  outer membrane lipoprotein Pcp  69.03 
 
 
155 aa  198  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000494181  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1877  17 kDa surface antigen  69.03 
 
 
155 aa  198  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000817006  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01611  outer membrane lipoprotein  61.29 
 
 
155 aa  173  7e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1999  17 kDa surface antigen  61.29 
 
 
155 aa  173  7e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00005432  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2353  outer membrane lipoprotein SlyB  61.29 
 
 
155 aa  173  7e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00612536  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01601  hypothetical protein  61.29 
 
 
155 aa  173  7e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1717  outer membrane lipoprotein SlyB  61.29 
 
 
155 aa  173  7e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.535204  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1851  outer membrane lipoprotein SlyB  61.29 
 
 
155 aa  173  7e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000135134  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1988  17 kDa surface antigen  61.29 
 
 
155 aa  173  7e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.636223  hitchhiker  0.00129397 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1558  outer membrane lipoprotein SlyB  61.29 
 
 
155 aa  173  7e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1833  outer membrane lipoprotein SlyB  61.29 
 
 
155 aa  173  7e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.520508  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1615  outer membrane lipoprotein pcp  61.29 
 
 
155 aa  171  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.397211 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1729  outer membrane lipoprotein pcp  61.29 
 
 
155 aa  171  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0331047  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1542  outer membrane lipoprotein pcp  61.29 
 
 
155 aa  171  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.318649  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1898  outer membrane lipoprotein pcp  61.29 
 
 
155 aa  171  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.470796  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1555  outer membrane lipoprotein pcp  61.29 
 
 
155 aa  171  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.949838 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1807  17 kDa surface antigen  65.49 
 
 
155 aa  166  7e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.55882  hitchhiker  0.000926812 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2215  17 kDa surface antigen  56.49 
 
 
163 aa  155  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.443445  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2665  17 kDa surface antigen  60 
 
 
155 aa  154  6e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000160562  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2381  17 kDa surface antigen  60 
 
 
155 aa  152  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00375113  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1723  17 kDa surface antigen  58.06 
 
 
155 aa  150  5.9999999999999996e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00134301  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0378  outer membrane lipoprotein PcP  66.67 
 
 
155 aa  149  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1219  outer membrane lipoprotein PcP  66.67 
 
 
155 aa  149  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0445  17 kDa surface antigen  66.03 
 
 
155 aa  147  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1690  17 kDa surface antigen  56.77 
 
 
155 aa  142  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26678  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1300  17 kDa surface antigen  44.74 
 
 
155 aa  105  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.843728  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6520  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  33.77 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0470  17 kDa surface antigen  36.18 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000215158  normal  0.945637 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1151  17 kDa surface antigen  40.71 
 
 
154 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.965272  normal  0.0962172 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6233  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  34.18 
 
 
157 aa  68.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0997303  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003797  putative outer membrane lipoprotein Pcp  34.87 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3682  outer membrane lipoprotein  37.25 
 
 
157 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0863126  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4325  hypothetical protein  39.33 
 
 
154 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.138091  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0952  outer membrane lipoprotein pcp precursor  41.5 
 
 
153 aa  62.4  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.013543  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3449  17 kDa surface antigen  35.53 
 
 
157 aa  62.4  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499306  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50740  hypothetical protein  39.04 
 
 
154 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00688218 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0116  17 kDa surface antigen  37.25 
 
 
157 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.72771  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0599  17 kDa surface antigen  37.25 
 
 
157 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.181181  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0568  17 kDa surface antigen  37.25 
 
 
157 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.533396  decreased coverage  0.000059328 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2792  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  35.21 
 
 
155 aa  60.8  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00797712  normal  0.981386 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2052  hypothetical protein  29.32 
 
 
155 aa  60.8  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000276746  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0501  17 kDa surface antigen  37.25 
 
 
157 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.354763  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0525  17 kDa surface antigen  37.25 
 
 
157 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.308041 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1838  17 kDa surface antigen  27.74 
 
 
164 aa  60.1  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000536943  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1167  17 kDa surface antigen  36.36 
 
 
154 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1131  17 kDa surface antigen  36.36 
 
 
154 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.40399  normal  0.0112028 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1231  surface antigen protein  34.56 
 
 
154 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.302793  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4284  17 kDa surface antigen  36.36 
 
 
154 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5596  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  31.65 
 
 
153 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2695  17 kDa surface antigen  31.06 
 
 
160 aa  57.8  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000023242  normal  0.114925 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3852  lipoprotein SlyB, putative  34.39 
 
 
154 aa  57  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.782854 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0511  hypothetical protein  41.51 
 
 
208 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1890  17 kDa surface antigen  32.69 
 
 
158 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.219648  hitchhiker  0.0000108744 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2635  17 kDa surface antigen  34.19 
 
 
162 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2468  17 kDa surface antigen  34.13 
 
 
156 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000341658  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3223  17 kDa surface antigen  36.8 
 
 
272 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.866673  normal  0.25243 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0228  hypothetical protein  38.89 
 
 
218 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.557986  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0957  SlyB protein  38.89 
 
 
218 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3432  17 kDa surface antigen  34.21 
 
 
158 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0751416  normal  0.0130273 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1411  surface antigen family protein  38.89 
 
 
218 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895937  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1607  surface antigen family protein  38.89 
 
 
218 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.962323  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2531  surface antigen family protein  38.89 
 
 
218 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0265  surface antigen family protein  38.89 
 
 
218 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0526  putative outer membrane lipoprotein, SlyB-like  34.87 
 
 
158 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0527356  normal  0.789075 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4902  17 kDa surface antigen  39.62 
 
 
204 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19520  outer membrane lipoprotein  38.93 
 
 
154 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2673  surface antigen family protein  37.96 
 
 
218 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110868  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2507  outer membrane lipoprotein  38.56 
 
 
157 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3507  outer membrane lipoprotein  38.56 
 
 
157 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1157  outer membrane lipoprotein  38.56 
 
 
157 aa  51.6  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0428  outer membrane lipoprotein  38.56 
 
 
157 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1287  outer membrane lipoprotein  38.56 
 
 
157 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3471  outer membrane lipoprotein  38.56 
 
 
157 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.31165  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3509  outer membrane lipoprotein  38.56 
 
 
157 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3277  outer membrane lipoprotein  38.56 
 
 
157 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5451  17 kDa surface antigen  42.53 
 
 
206 aa  51.2  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349423  normal  0.317102 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2871  17 kDa surface antigen-like protein  33.8 
 
 
155 aa  50.8  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000441534  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1308  17 kDa surface antigen  40.19 
 
 
217 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3037  17 kDa surface antigen  34.72 
 
 
155 aa  50.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1311  hypothetical protein  39.73 
 
 
179 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000260311 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1326  hypothetical protein  39.73 
 
 
179 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000689224 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1288  hypothetical protein  39.73 
 
 
179 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2157  hypothetical protein  39.73 
 
 
179 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000013622 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1973  hypothetical protein  39.73 
 
 
179 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126955  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1927  hypothetical protein  45.16 
 
 
178 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.339305  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1625  hypothetical protein  34.41 
 
 
175 aa  48.1  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.813311  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2785  17 kDa surface antigen  37.25 
 
 
157 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.245544  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3565  17 kDa surface antigen  37.5 
 
 
225 aa  47.8  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2627  17 kDa surface antigen  33.33 
 
 
155 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.940371  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2528  17 kDa surface antigen  32.69 
 
 
158 aa  47.4  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000371225  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2622  hypothetical protein  31.97 
 
 
156 aa  47  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0066  outer membrane lipoprotein  36.79 
 
 
216 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647379  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1652  17 kDa surface antigen  31.75 
 
 
156 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000172178  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2016  hypothetical protein  36.99 
 
 
179 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246184 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1727  17 kDa surface antigen  31.75 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000263697  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2250  17 kDa surface antigen  33.65 
 
 
164 aa  45.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454882  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0134  17 kDa surface antigen  54.55 
 
 
257 aa  46.2  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.227874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>