23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_B0006 on replicon NC_010157
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010157  YpAngola_B0006  hypothetical protein  100 
 
 		 57 aa  122  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.114582 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2212  DNA polymerase V subunit UmuC  53.33 
 
 		 422 aa  53.9  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0650836 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2158  DNA polymerase V subunit UmuC  51.11 
 
 		 422 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.512063  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2162  DNA polymerase V subunit UmuC  51.11 
 
 		 422 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.229342 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1908  DNA-directed DNA polymerase  48.89 
 
 		 420 aa  50.8  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2215  DNA polymerase V subunit UmuC  48.89 
 
 		 422 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69246  normal  0.844364 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0053  mutagenesis and repair protein MucB  47.73 
 
 		 421 aa  46.2  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000259717  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0036  DNA polymerase V subunit UmuC  48.89 
 
 		 424 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0503759 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2464  DNA-directed DNA polymerase  44.44 
 
 		 422 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050901  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01169  hypothetical protein  44.44 
 
 		 422 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000148835  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1671  DNA polymerase V subunit UmuC  44.44 
 
 		 422 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0525212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0002  DNA polymerase V subunit UmuC  45.65 
 
 		 423 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1965  DNA polymerase V subunit UmuC  44.44 
 
 		 422 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000119892  normal  0.867639 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2441  DNA polymerase V subunit UmuC  44.44 
 
 		 422 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000365295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1329  DNA polymerase V subunit UmuC  44.44 
 
 		 422 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024147  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1287  DNA polymerase V subunit UmuC  44.44 
 
 		 422 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000534988  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01159  DNA polymerase V subunit UmuC  44.44 
 
 		 422 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000022565  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2606  DNA-directed DNA polymerase  46.67 
 
 		 422 aa  45.1  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.4458 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2458  DNA-directed DNA polymerase  44.44 
 
 		 424 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2342  DNA-directed DNA polymerase  44.44 
 
 		 424 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2353  DNA-directed DNA polymerase  44.44 
 
 		 424 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2005  DNA-directed DNA polymerase  44.44 
 
 		 424 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000515421 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1982  DNA-directed DNA polymerase  46.67 
 
 		 423 aa  40  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.84718  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>