More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A3566 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A3566  crcB-like protein  100 
 
 
126 aa  240  5e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00153243  normal  0.458256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1143  CrcB protein  99.21 
 
 
126 aa  238  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1089  CrcB-like protein  99.17 
 
 
120 aa  227  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.678509  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1326  crcB protein  69.05 
 
 
129 aa  147  4e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1370  camphor resistance protein CrcB  68.25 
 
 
129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5115  Camphor resistance CrcB protein  55.17 
 
 
127 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1468  CrcB protein  54.95 
 
 
127 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1306  CrcB protein  54.95 
 
 
127 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  32.79 
 
 
134 aa  71.2  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  31.97 
 
 
118 aa  70.5  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1548  camphor resistance protein CrcB  38.98 
 
 
129 aa  69.3  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  38.05 
 
 
134 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  37.1 
 
 
125 aa  68.6  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  37.17 
 
 
128 aa  68.2  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  40.16 
 
 
125 aa  67  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  41.46 
 
 
125 aa  67  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  35.77 
 
 
122 aa  66.2  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  32.79 
 
 
123 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  33.61 
 
 
130 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0814  CrcB protein  36.36 
 
 
129 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  36.36 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
131 aa  63.9  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2648  CrcB protein  37.36 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0838344  normal  0.517536 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  36.22 
 
 
124 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  36.22 
 
 
124 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5186  camphor resistance protein CrcB  33.63 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4784  camphor resistance protein CrcB  31.4 
 
 
137 aa  62  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5216  camphor resistance protein CrcB  32.74 
 
 
137 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3565  camphor resistance protein CrcB  34.19 
 
 
134 aa  61.2  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00692175  normal  0.464407 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  37.08 
 
 
131 aa  61.6  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1088  camphor resistance protein CrcB  34.19 
 
 
134 aa  61.2  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.97219  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1142  camphor resistance protein CrcB  34.19 
 
 
134 aa  61.2  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.747152  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0820  CrcB protein  35.4 
 
 
134 aa  61.2  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000163322  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0397  CrcB protein  39.83 
 
 
166 aa  60.8  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.302556  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  36.67 
 
 
129 aa  60.8  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  36.36 
 
 
132 aa  60.8  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4408  camphor resistance protein CrcB  37.39 
 
 
122 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3649  camphor resistance protein CrcB  31.86 
 
 
135 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.602908  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  40.18 
 
 
128 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4941  camphor resistance protein CrcB  32.74 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5319  camphor resistance protein CrcB  32.74 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  32.48 
 
 
151 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13087  camphor resistance protein CrcB  37.69 
 
 
126 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.3757  normal  0.719495 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0027  camphor resistance protein CrcB  33.61 
 
 
118 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0257719 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  40.18 
 
 
128 aa  58.5  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  34.55 
 
 
124 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4802  camphor resistance protein CrcB  31.4 
 
 
137 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5220  camphor resistance protein CrcB  32.48 
 
 
144 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000234645  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0513  CrcB protein  30.08 
 
 
125 aa  57.4  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2385  camphor resistance protein CrcB  48.84 
 
 
127 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427512 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3267  CrcB protein  32.76 
 
 
124 aa  57.4  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.954917  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4903  camphor resistance protein CrcB  31.62 
 
 
134 aa  57.4  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  38.3 
 
 
129 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0243  Camphor resistance CrcB protein  38.21 
 
 
123 aa  57.4  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2948  hypothetical protein  37.21 
 
 
270 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  39.34 
 
 
131 aa  57.4  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5235  camphor resistance protein CrcB  32.74 
 
 
144 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  32.74 
 
 
193 aa  56.6  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  37.08 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  32.74 
 
 
119 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4785  camphor resistance protein CrcB  32.79 
 
 
118 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4803  camphor resistance protein CrcB  32.79 
 
 
118 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  35.58 
 
 
127 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  34.45 
 
 
128 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7364  CrcB protein  35.85 
 
 
120 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  34.17 
 
 
124 aa  56.6  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  35.58 
 
 
127 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5217  camphor resistance protein CrcB  31.97 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4942  camphor resistance protein CrcB  32.79 
 
 
118 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5320  camphor resistance protein CrcB  32.79 
 
 
118 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5221  camphor resistance protein CrcB  32.79 
 
 
118 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5236  camphor resistance protein CrcB  32.79 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0028  camphor resistance protein CrcB  31.86 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  37.07 
 
 
124 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0789  CrcB protein  37.84 
 
 
124 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.76348  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1481  camphor resistance CrcB protein  35.23 
 
 
132 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  33.94 
 
 
136 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3620  camphor resistance protein CrcB  36 
 
 
124 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  40.22 
 
 
228 aa  54.7  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0524  camphor resistance protein CrcB  30.25 
 
 
140 aa  54.7  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000767193  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  34.62 
 
 
127 aa  54.7  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  31.4 
 
 
126 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  31.4 
 
 
126 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1835  camphor resistance protein CrcB  30.16 
 
 
147 aa  54.3  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5187  camphor resistance protein CrcB  31.97 
 
 
118 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1870  camphor resistance protein CrcB  30.16 
 
 
147 aa  54.3  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0846  Integral membrane protein for chromosome condensation  31.75 
 
 
121 aa  54.3  0.0000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.523851  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  35.37 
 
 
124 aa  54.3  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  37.17 
 
 
124 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3650  camphor resistance protein CrcB  33.94 
 
 
120 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.842841  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  34.68 
 
 
125 aa  54.3  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2721  Camphor resistance CrcB protein  34.78 
 
 
139 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.186875 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1339  CrcB family protein  28.57 
 
 
117 aa  53.9  0.0000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0192605  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28190  camphor resistance protein CrcB  36.7 
 
 
124 aa  53.9  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152767  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  40.19 
 
 
130 aa  53.9  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  35.48 
 
 
142 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  32.2 
 
 
123 aa  53.9  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0818  camphor resistance protein CrcB  37.17 
 
 
137 aa  53.9  0.0000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.682767  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0202  camphor resistance protein CrcB  32.35 
 
 
132 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0802663 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>