110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1198 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03110  cell wall structural complex MreBCD, actin-like component MreB  84.33 
 
 		 1044 bp  769    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000155968  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0456  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  84.33 
 
 		 1044 bp  769    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000227973  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0263    83.51 
 
 		 1120 bp  700    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000154526  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0252  rod shape-determining protein MreB  84.28 
 
 		 1044 bp  763    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00115776  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3687  rod shape-determining protein MreB  84.42 
 
 		 1044 bp  777    Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000064313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0398  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 		 1044 bp  2070    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0857463  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3440  rod shape-determining protein MreB  84.33 
 
 		 1044 bp  769    Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.46785e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3734  rod shape-determining protein MreB  84.23 
 
 		 1044 bp  761    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000718605  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4411  rod shape-determining protein MreB  86.4 
 
 		 1044 bp  944    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000473686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1198    100 
 
 		 1044 bp  2070    Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000543988  hitchhiker  0.00888609 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0465  rod shape-determining protein MreB  99.9 
 
 		 1044 bp  2062    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000238277  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0456  rod shape-determining protein MreB  84.33 
 
 		 1044 bp  769    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000507844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3546  rod shape-determining protein MreB  84.42 
 
 		 1044 bp  777    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000601391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3835  rod shape-determining protein MreB  85.52 
 
 		 1044 bp  870    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00197853  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03061  hypothetical protein  84.33 
 
 		 1044 bp  769    Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000154905  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3677  rod shape-determining protein MreB  83.22 
 
 		 1044 bp  680    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3282  rod shape-determining protein MreB  84.13 
 
 		 1044 bp  753    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000051141  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3637  rod shape-determining protein MreB  84.52 
 
 		 1044 bp  785    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000940362  hitchhiker  0.00158537 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3672  rod shape-determining protein MreB  84.52 
 
 		 1044 bp  785    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000126331  normal  0.279818 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3566  rod shape-determining protein MreB  84.62 
 
 		 1044 bp  793    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000307307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3565  rod shape-determining protein MreB  84.71 
 
 		 1044 bp  801    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000236359  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3734  rod shape-determining protein MreB  84.33 
 
 		 1044 bp  769    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000617813  normal  0.0424676 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4567  rod shape-determining protein MreB  84.23 
 
 		 1044 bp  761    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000238726  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0403  rod shape-determining protein MreB  80.49 
 
 		 1050 bp  353  6e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000126028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0467  rod shape-determining protein MreB  80.09 
 
 		 1050 bp  341  1.9999999999999998e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000395514  normal  0.671219 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2834  rod shape-determining protein MreB  78.74 
 
 		 1044 bp  315  1e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000019673  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0483  rod shape-determining protein MreB  80.05 
 
 		 1044 bp  311  2.0000000000000002e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0558  rod shape-determining protein MreB  79.26 
 
 		 1050 bp  283  5e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000306946  normal  0.447345 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3738  rod shape-determining protein MreB  81.71 
 
 		 1050 bp  280  8e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000049309  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03685  rod shape-determining protein MreB  79.01 
 
 		 1044 bp  252  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3754  rod shape-determining protein MreB  80.86 
 
 		 1050 bp  248  3e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000701456  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00264  rod shape-determining protein MreB  81.51 
 
 		 1044 bp  232  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000119217  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0479  rod shape-determining protein MreB  78.47 
 
 		 1050 bp  226  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000232389  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3648  rod shape-determining protein MreB  78.47 
 
 		 1050 bp  226  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000380554  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4098  rod shape-determining protein MreB  79.35 
 
 		 1050 bp  224  3.9999999999999997e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3472  rod shape-determining protein MreB  78.35 
 
 		 1050 bp  218  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000392935  normal  0.627264 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0497  rod shape-determining protein MreB  78.26 
 
 		 1050 bp  214  4e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000391443  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0518  rod shape-determining protein MreB  78.26 
 
 		 1050 bp  214  4e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000418886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3822  rod shape-determining protein MreB  77.9 
 
 		 1050 bp  190  6e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000619946  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0522  rod shape-determining protein MreB  77.9 
 
 		 1050 bp  190  6e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000845532  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0574  rod shape-determining protein MreB  79.44 
 
 		 1050 bp  188  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000161982  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4402  rod shape-determining protein MreB  77.96 
 
 		 1050 bp  188  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000143177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0049  rod shape-determining protein MreB  78.51 
 
 		 1044 bp  186  9.000000000000001e-45  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.483131  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3334  rod shape-determining protein MreB  78.74 
 
 		 1047 bp  147  7e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000427845  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002383  rod shape-determining protein MreB  81 
 
 		 1044 bp  143  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000533641  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4561  rod shape-determining protein MreB  79.76 
 
 		 1044 bp  125  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0973  rod shape-determining protein MreB  78.44 
 
 		 1038 bp  101  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118066  normal  0.719218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58150  rod shape-determining protein MreB  80.17 
 
 		 1038 bp  99.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.138961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0838  rod shape-determining protein MreB  81.38 
 
 		 1038 bp  95.6  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00330287  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0933  rod shape-determining protein MreB  78.17 
 
 		 1038 bp  93.7  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.283099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1127  rod shape-determining protein MreB  88.37 
 
 		 1056 bp  91.7  4e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000227657  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3923  rod shape-determining protein MreB  81.5 
 
 		 1044 bp  89.7  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2021  rod shape-determining protein MreB  85.71 
 
 		 1044 bp  83.8  0.00000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0698648  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4163  rod shape-determining protein MreB  90.77 
 
 		 1038 bp  81.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2491  rod shape-determining protein MreB  90.77 
 
 		 1044 bp  81.8  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00448666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3454  rod shape-determining protein MreB  82.68 
 
 		 1047 bp  77.8  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1122  rod shape-determining protein MreB  78.74 
 
 		 1044 bp  75.8  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.201462 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5095  rod shape-determining protein MreB  87.01 
 
 		 1038 bp  73.8  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1376  rod shape-determining protein MreB  83.65 
 
 		 1044 bp  71.9  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0877019  normal  0.0232358 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1630  rod shape-determining protein MreB  90.74 
 
 		 1047 bp  67.9  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0107268  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3192  rod shape-determining protein MreB  84.04 
 
 		 1032 bp  67.9  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000000467509  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4472  rod shape-determining protein MreB  86.96 
 
 		 1038 bp  65.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0514  rod shape-determining protein MreB  89.29 
 
 		 1047 bp  63.9  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0183  rod shape-determining protein MreB  80 
 
 		 1044 bp  61.9  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000147765  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4777  rod shape-determining protein MreB  82.24 
 
 		 1062 bp  61.9  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000529713  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0940  rod shape-determining protein MreB  85.92 
 
 		 1038 bp  61.9  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4282  rod shape-determining protein MreB  85.92 
 
 		 1038 bp  61.9  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0470  rod shape-determining protein MreB  81.58 
 
 		 1029 bp  60  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2240  rod shape-determining protein MreB  82.65 
 
 		 1038 bp  60  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1412  rod shape-determining protein MreB  85.14 
 
 		 1035 bp  60  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000497097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1670  rod shape-determining protein MreB  94.74 
 
 		 1077 bp  60  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618582 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0873  rod shape-determining protein MreB  92.68 
 
 		 1099 bp  58  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0844  rod shape-determining protein MreB  92.68 
 
 		 1100 bp  58  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2728  rod shape-determining protein MreB  80.29 
 
 		 1044 bp  58  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000992624  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0856  rod shape-determining protein MreB  83.15 
 
 		 1038 bp  58  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1937  rod shape-determining protein MreB  82.8 
 
 		 1044 bp  58  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000814712  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3367  rod shape-determining protein MreB  92.68 
 
 		 1044 bp  58  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0260  rod shape-determining protein MreB  94.44 
 
 		 1044 bp  56  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.516664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0051  rod shape-determining protein MreB  81.73 
 
 		 1044 bp  56  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0766615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0420  rod shape-determining protein MreB  84.72 
 
 		 1029 bp  56  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0445177  hitchhiker  0.000156302 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0164  rod shape-determining protein MreB  89.58 
 
 		 1041 bp  56  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12650  rod shape-determining protein MreB  81.73 
 
 		 1038 bp  56  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0483  rod shape-determining protein MreB  89.36 
 
 		 1029 bp  54  0.00008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.025319  normal  0.0218935 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6461  rod shape-determining protein MreB  83.13 
 
 		 1044 bp  54  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0169  rod shape-determining protein MreB  82.11 
 
 		 1044 bp  54  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1257  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  89.36 
 
 		 1056 bp  54  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.574418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4158  rod shape-determining protein Mbl  88 
 
 		 1038 bp  52  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.53074  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0515  rod shape-determining protein MreB  85.48 
 
 		 1059 bp  52  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000344491  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0354  rod shape-determining protein MreB  90.48 
 
 		 1044 bp  52  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1648  rod shape-determining protein MreB  85.48 
 
 		 1059 bp  52  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  2.03031e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04262  rod shape-determining protein MreB  90.48 
 
 		 1047 bp  52  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.917856  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0236  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 		 1044 bp  52  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0162  rod shape-determining protein MreB  93.94 
 
 		 1044 bp  50.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0525916  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0116  rod shape-determining protein MreB  84.62 
 
 		 1044 bp  50.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0076  rod shape-determining protein MreB  84.06 
 
 		 1044 bp  50.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.780876  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2785  rod shape-determining protein MreB  93.94 
 
 		 1044 bp  50.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2294  rod shape-determining protein MreB  93.94 
 
 		 1044 bp  50.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.691991  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0170  rod shape-determining protein MreB  93.94 
 
 		 1044 bp  50.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.695664  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2374  rod shape-determining protein MreB  93.94 
 
 		 1044 bp  50.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  93.94 
 
 		 1044 bp  50.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000181914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>