20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1103 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0492  altronate oxidoreductase  99.31 
 
 		 1452 bp  2791    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.504858  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1103    100 
 
 		 1451 bp  2876    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.145219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0555  altronate oxidoreductase  99.72 
 
 		 1452 bp  2839    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3384  altronate oxidoreductase  81.82 
 
 		 1452 bp  194  5e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3510  altronate oxidoreductase  80.42 
 
 		 1452 bp  155  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0747  altronate oxidoreductase  79.81 
 
 		 1467 bp  123  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.400911  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0530  altronate oxidoreductase  83.85 
 
 		 1467 bp  105  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1685  altronate oxidoreductase  90.36 
 
 		 243 bp  101  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00119512  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01489  hypothetical protein  90.36 
 
 		 1452 bp  101  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2134  altronate oxidoreductase  90.36 
 
 		 1452 bp  101  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1688    90.36 
 
 		 2452 bp  101  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00110161  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01478  tagaturonate reductase  90.36 
 
 		 1452 bp  101  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1651  altronate oxidoreductase  90.36 
 
 		 1452 bp  101  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0488897  normal  0.828836 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2137  altronate oxidoreductase  90.36 
 
 		 1452 bp  101  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1721  altronate oxidoreductase  90.36 
 
 		 1452 bp  101  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0141374  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1603  altronate oxidoreductase  90.36 
 
 		 1452 bp  101  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2125  Mannitol dehydrogenase domain protein  90.36 
 
 		 1452 bp  101  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.048093  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0058  altronate oxidoreductase  87.84 
 
 		 1446 bp  75.8  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0064  altronate oxidoreductase  93.62 
 
 		 1446 bp  69.9  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2013  altronate oxidoreductase  93.75 
 
 		 1452 bp  48.1  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0988522  normal  0.0895016 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>