130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0726 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04008  C4-dicarboxylate antiporter  84.99 
 
 		 433 aa  707    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3854  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family  84.76 
 
 		 433 aa  705    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3679  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  100 
 
 		 433 aa  857    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5654  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  84.99 
 
 		 433 aa  707    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00371648  normal  0.384394 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4379  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  84.99 
 
 		 433 aa  707    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0860444  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4693  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  84.76 
 
 		 433 aa  706    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0405  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  89.61 
 
 		 433 aa  749    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.219267  hitchhiker  0.00256647 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0726  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  100 
 
 		 433 aa  857    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3826  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  100 
 
 		 433 aa  857    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3874  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  84.99 
 
 		 433 aa  707    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03970  hypothetical protein  84.99 
 
 		 433 aa  707    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4607  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  84.99 
 
 		 433 aa  707    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.104112  normal  0.747742 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4667  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  84.99 
 
 		 433 aa  707    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.654313  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4686  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  84.76 
 
 		 433 aa  709    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4743  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  84.76 
 
 		 433 aa  709    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.722845 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4595  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  84.76 
 
 		 433 aa  709    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4603  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  84.76 
 
 		 433 aa  709    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.880498  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4721  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  84.76 
 
 		 433 aa  709    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0855825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2007  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family  60.96 
 
 		 433 aa  522  1e-147  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3893  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family protein  59.45 
 
 		 433 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0325  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  62.21 
 
 		 433 aa  492  9.999999999999999e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000434648 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0588  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  57.8 
 
 		 435 aa  489  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3533  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  62.44 
 
 		 433 aa  484  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3408  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  62.44 
 
 		 433 aa  487  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0505  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  63.13 
 
 		 433 aa  483  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3748  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter  59.91 
 
 		 433 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0617  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter  59.91 
 
 		 433 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0639  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family  59.91 
 
 		 433 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0724  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  63.12 
 
 		 433 aa  472  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0681  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family protein  59.13 
 
 		 415 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0644  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter  59.6 
 
 		 415 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2701  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  57.14 
 
 		 433 aa  449  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1556  anaerobic C4-dicarboxylate transporter DcuA  50 
 
 		 497 aa  440  9.999999999999999e-123  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.678975  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1644  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  56.11 
 
 		 445 aa  435  1e-121  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1910  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter  54.09 
 
 		 433 aa  436  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0126461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04830  anaerobic c4-dicarboxylate membrane transporter family protein  60.81 
 
 		 432 aa  437  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.664542 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1117  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  55.76 
 
 		 444 aa  420  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002213  C4-dicarboxylate transporter anaerobic  54.82 
 
 		 435 aa  415  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2271  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  56.91 
 
 		 435 aa  414  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1912  hypothetical protein  51.47 
 
 		 446 aa  413  1e-114  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000048049  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00155  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  54.59 
 
 		 435 aa  413  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0390  IspD/IspF bifunctional enzyme  52.95 
 
 		 447 aa  411  1e-113  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.889279  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0083  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  51.79 
 
 		 442 aa  379  1e-104  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0123  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  51.79 
 
 		 442 aa  377  1e-103  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0139  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  52.83 
 
 		 444 aa  375  1e-103  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0095  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  52.02 
 
 		 442 aa  364  1e-99  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1605  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family  46.47 
 
 		 441 aa  360  4e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1089  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  46.92 
 
 		 432 aa  346  4e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2657  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family  43.68 
 
 		 433 aa  330  4e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000544517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2005  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  42.96 
 
 		 433 aa  319  6e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0366  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  43.88 
 
 		 437 aa  316  5e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3278  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family  41.48 
 
 		 443 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.737723 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0441  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  43.42 
 
 		 437 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0488  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  43.65 
 
 		 437 aa  313  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0354  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  43.42 
 
 		 437 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0364  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  43.42 
 
 		 437 aa  312  9e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0378  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  43.42 
 
 		 437 aa  312  9e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0421  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  43.65 
 
 		 437 aa  312  9e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4883  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  43.19 
 
 		 437 aa  311  2e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3974  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  43.44 
 
 		 439 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0489  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  43.19 
 
 		 437 aa  310  4e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2084  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  43.21 
 
 		 453 aa  309  8e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1756  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  43.9 
 
 		 453 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0351  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  43.19 
 
 		 437 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0359  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  43.88 
 
 		 437 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3871  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  43.21 
 
 		 439 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0593006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3793  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  43.21 
 
 		 439 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.261131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3805  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  43.21 
 
 		 439 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2178  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  43.46 
 
 		 453 aa  306  5.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3913  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  42.99 
 
 		 439 aa  305  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.689386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1227  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  43.28 
 
 		 437 aa  305  9.000000000000001e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0182987  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3845  anaerobic c4-dicarboxylate membrane transporter family protein  40.72 
 
 		 441 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0240  hypothetical protein  39.91 
 
 		 439 aa  300  4e-80  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0209  anaerobic C4-dicarboxylate transporter DcuA  43.86 
 
 		 423 aa  297  2e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1023  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  37.84 
 
 		 442 aa  294  3e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0158  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  41.91 
 
 		 436 aa  293  5e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000075  C4-dicarboxylate like transporter  37.61 
 
 		 443 aa  292  7e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.834607  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05690  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  37.16 
 
 		 443 aa  290  3e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2500  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  36.96 
 
 		 447 aa  286  5.999999999999999e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2120  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  38.65 
 
 		 441 aa  280  5e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.20125  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1566  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  37.5 
 
 		 441 aa  277  2e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3993  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  39.82 
 
 		 440 aa  276  4e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000171498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2479  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  36.76 
 
 		 447 aa  273  4.0000000000000004e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0685  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  37.9 
 
 		 438 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1726  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  38.39 
 
 		 447 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1800  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  38.39 
 
 		 447 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.920741  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0307  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  36.63 
 
 		 447 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4417  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  37.14 
 
 		 447 aa  264  2e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3841  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  36.14 
 
 		 438 aa  263  3e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0302  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  36.63 
 
 		 447 aa  264  3e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0298  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  36.63 
 
 		 447 aa  264  3e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0303  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  36.63 
 
 		 447 aa  264  3e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2751  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  37.22 
 
 		 442 aa  261  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4182  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  37.47 
 
 		 441 aa  261  1e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.877677 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3222  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  37.72 
 
 		 447 aa  260  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3726  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  36.24 
 
 		 447 aa  258  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00035323 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3359  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  37.5 
 
 		 447 aa  258  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0293  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  36.4 
 
 		 447 aa  257  3e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000600202 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0293  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  36.4 
 
 		 447 aa  257  3e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000012855 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1304  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  37.05 
 
 		 443 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000133068 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>