26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_4183 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0033  asmA family protein  98.07 
 
 		 569 aa  1113    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4874  AsmA family protein  58.42 
 
 		 553 aa  638    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000517487 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0038  asmA family protein  99.82 
 
 		 569 aa  1131    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4183  AsmA family protein  100 
 
 		 569 aa  1134    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4498  AsmA family protein  56.34 
 
 		 563 aa  620  1e-176  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4215  AsmA family protein  56.67 
 
 		 564 aa  619  1e-176  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4151  AsmA family protein  55.04 
 
 		 582 aa  607  9.999999999999999e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3954  AsmA family protein  53.51 
 
 		 575 aa  598  1e-170  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0050  AsmA family protein  48.85 
 
 		 569 aa  565  1e-160  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3866  AsmA family protein  49.02 
 
 		 569 aa  567  1e-160  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0056  AsmA family protein  49.02 
 
 		 569 aa  567  1e-160  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.21174 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3990  AsmA family protein  49.2 
 
 		 569 aa  566  1e-160  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03513  hypothetical protein  48.85 
 
 		 569 aa  565  1e-160  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.693109  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5028  AsmA family protein  48.76 
 
 		 569 aa  565  1e-160  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4106  AsmA family protein  49.02 
 
 		 569 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4159  AsmA family protein  48.67 
 
 		 569 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3955  AsmA family protein  48.32 
 
 		 569 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.795434  normal  0.512774 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4134  AsmA family protein  48.5 
 
 		 569 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4028  AsmA family protein  48.32 
 
 		 569 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3965  AsmA family protein  48.32 
 
 		 569 aa  548  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4074  AsmA family protein  48.47 
 
 		 559 aa  538  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.583657 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0072  AsmA family protein  45.07 
 
 		 573 aa  518  1e-146  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.11824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2929  hypothetical protein  23.12 
 
 		 660 aa  95.9  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001897  hypothetical protein  23.56 
 
 		 692 aa  89.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00596  hypothetical protein  23.82 
 
 		 731 aa  86.3  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2311  hypothetical protein  24.93 
 
 		 628 aa  82  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>