142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3569 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3440  Dna-J like membrane chaperone protein  99.64 
 
 
277 aa  561  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000544251  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0768  Dna-J like membrane chaperone protein  99.64 
 
 
277 aa  561  1.0000000000000001e-159  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128794  normal  0.0201885 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3569  Dna-J like membrane chaperone protein  100 
 
 
277 aa  563  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000771944  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0728  Dna-J like membrane chaperone protein  78.42 
 
 
273 aa  412  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000304706  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0106  Dna-J like membrane chaperone protein  70.04 
 
 
270 aa  398  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000540131  normal  0.839324 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0101  Dna-J like membrane chaperone protein  70.04 
 
 
270 aa  398  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000130204  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0104  Dna-J like membrane chaperone protein  70.04 
 
 
270 aa  398  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000141328  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0100  Dna-J like membrane chaperone protein  70.04 
 
 
270 aa  398  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000327368  normal  0.0501049 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0099  Dna-J like membrane chaperone protein  70.04 
 
 
270 aa  398  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3544  heat shock protein DnaJ domain protein  68.23 
 
 
271 aa  376  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  3.15628e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0061  Dna-J like membrane chaperone protein  68.59 
 
 
271 aa  377  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000204638  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0061  Dna-J like membrane chaperone protein  68.23 
 
 
271 aa  376  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000128159  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3600  Dna-J like membrane chaperone protein  68.23 
 
 
271 aa  376  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000271898  hitchhiker  0.00000323028 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0049  Dna-J like membrane chaperone protein  67.87 
 
 
271 aa  374  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000477601  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0059  Dna-J like membrane chaperone protein  67.87 
 
 
271 aa  374  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000026636  normal  0.688624 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00059  Dna-J like membrane chaperone protein  68.59 
 
 
271 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000486823  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00058  hypothetical protein  68.59 
 
 
271 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000167853  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0059  Dna-J like membrane chaperone protein  67.87 
 
 
271 aa  374  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000613097  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0604  Dna-J like membrane chaperone protein  67.51 
 
 
273 aa  360  1e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000356276  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3631  Dna-J like membrane chaperone protein  59.3 
 
 
291 aa  345  4e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.181642  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3828  Dna-J like membrane chaperone protein  58.62 
 
 
296 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.985148  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0567  Dna-J like membrane chaperone protein  53.02 
 
 
318 aa  314  9.999999999999999e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0637761  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0606  Dna-J like membrane chaperone protein  53.47 
 
 
305 aa  290  1e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21113  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1291  Dna-J like membrane chaperone protein  54.48 
 
 
289 aa  275  4e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000651268  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001661  DnaJ-like protein DjlA  54.86 
 
 
284 aa  266  2.9999999999999995e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0911  Dna-J like membrane chaperone protein  49.46 
 
 
262 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0269993  normal  0.373919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3203  Dna-J like membrane chaperone protein  49.46 
 
 
262 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.967283 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1020  Dna-J like membrane chaperone protein  47.29 
 
 
259 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.325317  normal  0.0319615 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1085  Dna-J like membrane chaperone protein  48.75 
 
 
262 aa  261  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367802  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3109  Dna-J like membrane chaperone protein  48.75 
 
 
262 aa  260  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0792555  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4522  Dna-J like membrane chaperone protein  49.1 
 
 
275 aa  258  1e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0970  Dna-J like membrane chaperone protein  48.01 
 
 
259 aa  257  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0207673  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0372  Dna-J like membrane chaperone protein  53.1 
 
 
283 aa  254  9e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0995  Dna-J like membrane chaperone protein  47.31 
 
 
262 aa  253  3e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.555246  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3633  Dna-J like membrane chaperone protein  48.39 
 
 
262 aa  250  2e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3306  Dna-J like membrane chaperone protein  48.39 
 
 
262 aa  249  3e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.044478  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0983  Dna-J like membrane chaperone protein  48.39 
 
 
262 aa  249  4e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.193447  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1052  Dna-J like membrane chaperone protein  48.39 
 
 
262 aa  249  4e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0982922  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03410  Dna-J like membrane chaperone protein  48.28 
 
 
288 aa  248  6e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00812  Dna-J like membrane chaperone protein  54.44 
 
 
286 aa  248  6e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0868  Dna-J like membrane chaperone protein  46.93 
 
 
259 aa  241  6e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2813  Dna-J like membrane chaperone protein  49.26 
 
 
256 aa  240  1e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0603068  normal  0.639961 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0885  Dna-J like membrane chaperone protein  45.13 
 
 
258 aa  241  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00720639  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3415  Dna-J like membrane chaperone protein  44.06 
 
 
284 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.258634  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2882  Dna-J like membrane chaperone protein  44.77 
 
 
259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450671  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3073  Dna-J like membrane chaperone protein  46.79 
 
 
257 aa  229  4e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.70305  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2865  Dna-J like membrane chaperone protein  49.24 
 
 
284 aa  226  4e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000787957  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1051  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  46.64 
 
 
268 aa  221  9e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0104  Dna-J like membrane chaperone protein  41.75 
 
 
271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000467525  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2075  Dna-J like membrane chaperone protein  41.84 
 
 
270 aa  194  2e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000570933  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0020  Dna-J like membrane chaperone protein  43.56 
 
 
276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2989  Dna-J like membrane chaperone protein  40.89 
 
 
264 aa  169  5e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.787211  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1055  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.3 
 
 
267 aa  169  5e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00001887  normal  0.815768 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2289  Dna-J like membrane chaperone protein  34.15 
 
 
296 aa  166  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2262  Dna-J like membrane chaperone protein  33.45 
 
 
296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2106  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.79 
 
 
260 aa  160  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0100  heat shock protein DnaJ-like protein  38.38 
 
 
257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1907  Dna-J like membrane chaperone protein  35.13 
 
 
271 aa  144  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0892  Dna-J like membrane chaperone protein  35.04 
 
 
257 aa  142  6e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.448212  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0910  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  29.35 
 
 
268 aa  108  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.2781  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4621  heat shock protein DnaJ, N-terminal  27.96 
 
 
255 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418995  normal  0.628986 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4007  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.28 
 
 
253 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4795  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.5 
 
 
254 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.424531  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5129  heat shock protein DnaJ-like  27.24 
 
 
255 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.583171  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0438  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.04 
 
 
255 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0557  DnaJ-like protein DjlA, putative  28.21 
 
 
255 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0441  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  28.72 
 
 
255 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.524438  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1747  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  28.92 
 
 
251 aa  94  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000151297  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0407  heat shock protein DnaJ domain protein  28.72 
 
 
255 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0742  hypothetical protein  31.53 
 
 
252 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0971129  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0880  heat shock protein DnaJ domain protein  26.55 
 
 
241 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161205  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0905  protein of unknown function DUF1332  26.91 
 
 
241 aa  87  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0299728  normal  0.285713 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0942  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  26.91 
 
 
241 aa  87  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0233536  normal  0.0990554 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0668  DnaJ domain-containing protein  25.62 
 
 
265 aa  82.4  0.000000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.165012  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0961  hypothetical protein  26.49 
 
 
257 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.483965  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46770  heat shock protein DnaJ-like protein  27.98 
 
 
253 aa  81.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1837  DnaJ domain-containing protein  28.26 
 
 
264 aa  80.1  0.00000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1630  silent information regulator protein Sir2  25.91 
 
 
244 aa  80.1  0.00000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.071584  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2868  protein of unknown function DUF1332  24 
 
 
235 aa  79.3  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.96346 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07800  hypothetical protein  29.28 
 
 
252 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0234725 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0397  heat shock protein DnaJ-like  33.33 
 
 
250 aa  72.8  0.000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2408  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  24.55 
 
 
236 aa  72.4  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.553614  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2006  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  24.51 
 
 
246 aa  72  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0210769 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2252  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  29.11 
 
 
266 aa  71.2  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4375  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  24.23 
 
 
240 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.283206  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4909  protein of unknown function DUF1332  23.37 
 
 
245 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.296192  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2105  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  25.17 
 
 
235 aa  68.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296971 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2608  heat shock protein DnaJ domain protein  24 
 
 
235 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.221974  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2908  molecular chaperone DnaJ family  25.45 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0977  DnaJ domain-containing protein  22.79 
 
 
212 aa  67.8  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1034  DnaJ domain-containing protein  22.79 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0627693  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2884  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  26.12 
 
 
256 aa  64.7  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.842041  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0546  DnaJ-like protein  23.11 
 
 
256 aa  65.1  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0827  DnaJ domain-containing protein  22.48 
 
 
212 aa  63.5  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2092  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  26.62 
 
 
233 aa  60.1  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.764372  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3513  Fis family transcriptional regulator  39.02 
 
 
251 aa  59.3  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0207  DnaJ domain-containing protein  22.41 
 
 
273 aa  58.9  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3726  heat shock protein DnaJ domain protein  45.16 
 
 
121 aa  57.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2298  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  27.4 
 
 
240 aa  56.2  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.622432  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24547  predicted protein  39.02 
 
 
2272 aa  55.1  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.733966  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>