More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3490 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A1033  dihydrolipoamide acetyltransferase  95.64 
 
 
509 aa  909    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00114  dihydrolipoamide acetyltransferase  80 
 
 
630 aa  791    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3487  pyruvate dehydrogenase complex dihydrolipoamide acetyltransferase  80 
 
 
630 aa  791    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.671766  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3567  dihydrolipoamide acetyltransferase  81.75 
 
 
629 aa  772    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0420  dihydrolipoamide acetyltransferase  68.69 
 
 
620 aa  695    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0458953  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4010  dihydrolipoamide acetyltransferase  79.13 
 
 
630 aa  748    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0295537  normal  0.722357 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3362  dihydrolipoamide acetyltransferase  97.73 
 
 
526 aa  912    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.135919  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0166  dihydrolipoamide acetyltransferase  80.19 
 
 
629 aa  762    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0119  dihydrolipoamide acetyltransferase  80 
 
 
630 aa  791    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0825086  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0172  dihydrolipoamide acetyltransferase  80.95 
 
 
628 aa  762    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1989  dihydrolipoamide acetyltransferase  72.83 
 
 
637 aa  701    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3753  dihydrolipoamide acetyltransferase  81.94 
 
 
627 aa  794    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.14416  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002551  dihydrolipoamide acetyltransferase component of pyruvate dehydrogenase complex  72.08 
 
 
631 aa  701    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3490  dihydrolipoamide acetyltransferase  100 
 
 
528 aa  1044    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0675  dihydrolipoamide acetyltransferase  77.42 
 
 
616 aa  771    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.296776  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0166  dihydrolipoamide acetyltransferase  80.19 
 
 
629 aa  763    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0376  dihydrolipoamide acetyltransferase  71.08 
 
 
642 aa  694    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104894 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0122  dihydrolipoamide acetyltransferase  79.81 
 
 
630 aa  790    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00199092  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00113  hypothetical protein  80 
 
 
630 aa  791    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0167  dihydrolipoamide acetyltransferase  80.19 
 
 
629 aa  763    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3382  dihydrolipoamide acetyltransferase  68.75 
 
 
632 aa  695    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.141641  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0320  dihydrolipoamide acetyltransferase  70.34 
 
 
617 aa  694    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.907798  normal  0.0349479 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0108  dihydrolipoamide acetyltransferase  80 
 
 
630 aa  791    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313744  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0175  dihydrolipoamide acetyltransferase  80.19 
 
 
629 aa  790    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0661  dihydrolipoamide acetyltransferase  81.33 
 
 
628 aa  785    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0663507  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3544  dihydrolipoamide acetyltransferase  80 
 
 
630 aa  791    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.484984  normal  0.109653 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0635  dihydrolipoamide acetyltransferase  78.18 
 
 
626 aa  782    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1094  pyruvate dehydrogenase, E2 complex  70.28 
 
 
585 aa  746    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0125  dihydrolipoamide acetyltransferase  80 
 
 
630 aa  791    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.754691  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03463  dihydrolipoamide acetyltransferase  71.32 
 
 
635 aa  694    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0117  dihydrolipoamide acetyltransferase  80 
 
 
630 aa  791    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00424432  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3776  pyruvate dehydrogenase complex dihydrolipoamide acetyltransferase  59.17 
 
 
665 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000518885  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3351  pyruvate dehydrogenase complex dihydrolipoamide acetyltransferase  58.47 
 
 
664 aa  595  1e-169  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0659347  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0432  dihydrolipoyllysine-residue succinyltransferase  58.41 
 
 
545 aa  587  1e-166  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000010678 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4053  pyruvate dehydrogenase complex dihydrolipoamide acetyltransferase  58.77 
 
 
665 aa  586  1e-166  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0706974  normal  0.844012 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3912  pyruvate dehydrogenase complex dihydrolipoamide acetyltransferase  58.59 
 
 
663 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00272212  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3933  pyruvate dehydrogenase complex dihydrolipoamide acetyltransferase  58.59 
 
 
665 aa  581  1e-164  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000917222  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3855  pyruvate dehydrogenase complex dihydrolipoamide acetyltransferase  59.49 
 
 
665 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000583648 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4806  dihydrolipoamide acetyltransferase  56.61 
 
 
549 aa  573  1.0000000000000001e-162  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3416  pyruvate dehydrogenase complex dihydrolipoamide acetyltransferase  58.02 
 
 
669 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0772097  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3430  pyruvate dehydrogenase complex dihydrolipoamide acetyltransferase  59.07 
 
 
650 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0425  pyruvate dehydrogenase complex, E2 component, dihydrolipoamide acetyltransferase  56.97 
 
 
677 aa  570  1e-161  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2926  2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide acetyltransferase E2 component  58.9 
 
 
543 aa  571  1e-161  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.33639 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0427  pyruvate dehydrogenase complex dihydrolipoamide acetyltransferase  57.89 
 
 
668 aa  570  1e-161  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00328554  normal  0.268378 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0429  pyruvate dehydrogenase complex dihydrolipoamide acetyltransferase  57.55 
 
 
673 aa  568  1e-160  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0849559  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3598  pyruvate dehydrogenase complex dihydrolipoamide acetyltransferase  57.22 
 
 
671 aa  567  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0152681  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03224  pyruvate dehydrogenase complex, E2 component, dihydrolipoamide acetyltransferase  55.88 
 
 
679 aa  564  1.0000000000000001e-159  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.133104  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2463  pyruvate dehydrogenase complex dihydrolipoamide acetyltransferase  54.05 
 
 
567 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0881564  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0270  pyruvate dehydrogenase complex dihydrolipoamide acetyltransferase  55.87 
 
 
565 aa  533  1e-150  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1980  dihydrolipoamide acetyltransferase  50.55 
 
 
551 aa  527  1e-148  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000318047  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1910  dihydrolipoamide acetyltransferase  50.73 
 
 
551 aa  527  1e-148  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000157717  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2671  dihydrolipoamide acetyltransferase  54.04 
 
 
556 aa  516  1.0000000000000001e-145  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.221644  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2127  dihydrolipoamide S-succinyltransferase  55.33 
 
 
543 aa  511  1e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.046485  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1197  dihydrolipoamide acetyltransferase  55.04 
 
 
554 aa  508  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00531613  normal  0.708438 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2163  pyruvate dehydrogenase complex dihydrolipoamide acetyltransferase  53.76 
 
 
556 aa  506  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666563  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1865  dihydrolipoamide acetyltransferase  54.25 
 
 
548 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.117468  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1469  dihydrolipoamide acetyltransferase  51.95 
 
 
548 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0483474  normal  0.4659 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1601  dihydrolipoamide acetyltransferase  54.15 
 
 
554 aa  503  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105041  normal  0.367645 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0856  dihydrolipoamide acetyltransferase  48.1 
 
 
695 aa  502  1e-141  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1618  dihydrolipoamide acetyltransferase  52.94 
 
 
561 aa  501  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0710124  normal  0.720466 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1501  dihydrolipoamide acetyltransferase  53.78 
 
 
529 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0225824  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2154  dihydrolipoamide acetyltransferase  53.79 
 
 
549 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.272445  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1720  dihydrolipoamide acetyltransferase  53.78 
 
 
529 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.077494  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2229  dihydrolipoamide acetyltransferase  53.78 
 
 
529 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.907838  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2744  dihydrolipoamide acetyltransferase  53.8 
 
 
547 aa  500  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3521  dihydrolipoamide acetyltransferase  50.09 
 
 
570 aa  499  1e-140  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.541134  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5442  dihydrolipoamide acetyltransferase  54.43 
 
 
548 aa  499  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3979  pyruvate dehydrogenase complex dihydrolipoamide acetyltransferase  51.56 
 
 
563 aa  500  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.057463  decreased coverage  0.00853533 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2136  dihydrolipoamide acetyltransferase  53.79 
 
 
549 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.329724  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3091  dihydrolipoamide acetyltransferase  53.78 
 
 
529 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000396529  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5941  dihydrolipoamide acetyltransferase  53.79 
 
 
549 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2611  dihydrolipoamide acetyltransferase  54.38 
 
 
543 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2666  dihydrolipoamide acetyltransferase  53.89 
 
 
548 aa  497  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1946  dihydrolipoamide acetyltransferase  53.5 
 
 
557 aa  496  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.017866  decreased coverage  0.000672984 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2046  dihydrolipoamide acetyltransferase  53.03 
 
 
544 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0735  pyruvate dehydrogenase complex dihydrolipoamide acetyltransferase  52.71 
 
 
534 aa  498  1e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288359  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2173  dihydrolipoamide acetyltransferase  52.34 
 
 
551 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.978477  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1134  dihydrolipoamide acetyltransferase  53.32 
 
 
555 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.175796  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1460  dihydrolipoamide acetyltransferase  46.45 
 
 
544 aa  489  1e-137  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1523  dihydrolipoamide acetyltransferase  47.18 
 
 
544 aa  490  1e-137  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03101  dihydrolipoamide acetyltransferase  48.48 
 
 
598 aa  490  1e-137  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66310  dihydrolipoamide acetyltransferase  51.79 
 
 
547 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.156843  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0575  dihydrolipoamide acetyltransferase  51.01 
 
 
656 aa  482  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.157653  hitchhiker  0.000480279 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1647  pyruvate dehydrogenase complex dihydrolipoamide acetyltransferase  52.79 
 
 
554 aa  484  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.344967 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5752  dihydrolipoamide acetyltransferase  52.55 
 
 
547 aa  481  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277388  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1304  dihydrolipoamide acetyltransferase  54.05 
 
 
554 aa  479  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2131  dihydrolipoamide acetyltransferase  48.75 
 
 
554 aa  481  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.799453  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2213  dihydrolipoamide acetyltransferase  49.65 
 
 
562 aa  479  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0504217  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1826  pyruvate dehydrogenase complex dihydrolipoamide acetyltransferase  48.02 
 
 
552 aa  480  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.531385  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2306  pyruvate dehydrogenase complex dihydrolipoamide acetyltransferase  49.81 
 
 
644 aa  474  1e-132  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.656327  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1542  dihydrolipoamide acetyltransferase  53.32 
 
 
555 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0721099  normal  0.0527209 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0517  dihydrolipoamide acetyltransferase  49.02 
 
 
557 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.153939  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2590  dihydrolipoamide acetyltransferase  51.81 
 
 
550 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.546958  decreased coverage  0.000383256 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1553  pyruvate dehydrogenase complex dihydrolipoamide acetyltransferase  54.04 
 
 
442 aa  468  9.999999999999999e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.674254  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2075  dehydrogenase catalytic domain-containing protein  53.45 
 
 
442 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5006  pyruvate dehydrogenase complex, E2 component, dihydrolipoamide acetyltransferase  50 
 
 
548 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0462  dihydrolipoamide acetyltransferase  54.1 
 
 
651 aa  464  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257215  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4865  dihydrolipoamide acetyltransferase  53.01 
 
 
547 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.472751  normal  0.213682 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3327  pyruvate dehydrogenase complex dihydrolipoamide acetyltransferase  47.66 
 
 
552 aa  460  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0366  dihydrolipoamide acetyltransferase  53.75 
 
 
545 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.106174 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>