27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1827 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1827  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  308  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1719  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  308  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00113382  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2617  hypothetical protein  99.34 
 
 		 152 aa  305  1.0000000000000001e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.597605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1440  hypothetical protein  48.75 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.591275  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1328  hypothetical protein  48.75 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0457315  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3583  Protein of unknown function DUF2502  49.3 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000921365  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3425  hypothetical protein  49.3 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.199084  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3414  hypothetical protein  52.7 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.824951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2733  hypothetical protein  50 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.504136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0781  hypothetical protein  46.55 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3591  conserved hypothetical protein  34.57 
 
 		 98 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3650  hypothetical protein  35 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00005  hypothetical protein  35 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00005  hypothetical protein  35 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0567  hypothetical protein  29.2 
 
 		 98 aa  51.6  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2726  hypothetical protein  32.32 
 
 		 99 aa  51.2  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00442656  normal  0.0144375 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0006  hypothetical protein  33.75 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0736332  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0811  hypothetical protein  57.89 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0270674  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2681  hypothetical protein  31.46 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146587  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2925  hypothetical protein  31.4 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.110417 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02300  hypothetical protein  31.46 
 
 		 108 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1279  hypothetical protein  31.46 
 
 		 108 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.887196  normal  0.128459 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2542  hypothetical protein  31.46 
 
 		 108 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2759  hypothetical protein  31.46 
 
 		 108 aa  45.1  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3622  hypothetical protein  31.46 
 
 		 108 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.669652  normal  0.697764 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1267  conserved hypothetical protein  31.46 
 
 		 108 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.389303  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02261  hypothetical protein  31.46 
 
 		 108 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>