19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1051 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1051  hypothetical protein  100 
 
 		 44 aa  87.4  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.894744  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3255  hypothetical protein  57.14 
 
 		 75 aa  47.4  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0879  protein of unknown function DUF903  51.43 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.1898  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3378  protein of unknown function DUF903  57.14 
 
 		 73 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02621  hypothetical protein  51.43 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4074  putative lipoprotein  51.43 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000281927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3061  putative lipoprotein  51.43 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000593312  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2950  putative lipoprotein  51.43 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000110567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0903  hypothetical protein  51.43 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3115  putative lipoprotein  51.43 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000261259  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2953  putative lipoprotein  51.43 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000202648  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02660  hypothetical protein  51.43 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3209  putative lipoprotein  51.43 
 
 		 75 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00813099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3194  hypothetical protein  51.43 
 
 		 75 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0360225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3146  putative lipoprotein  51.43 
 
 		 75 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000180237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3129  putative lipoprotein  51.43 
 
 		 75 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000119893  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3309  putative lipoprotein  51.43 
 
 		 75 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00054484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0926  hypothetical protein  57.14 
 
 		 73 aa  44.7  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000581798  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3179  protein of unknown function DUF903  59.38 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.854338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>