100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0169 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_0169  ferrous iron transport protein A  100 
 
 
75 aa  149  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3745  ferrous iron transport protein A  100 
 
 
75 aa  149  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3984  ferrous iron transport protein A  100 
 
 
75 aa  149  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4628  ferrous iron transport protein A  76.71 
 
 
74 aa  114  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0305  FeoA family protein  77.46 
 
 
75 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03212  hypothetical protein  77.46 
 
 
75 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4715  ferrous iron transport protein A  77.46 
 
 
75 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3789  ferrous iron transport protein A  77.46 
 
 
75 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3689  ferrous iron transport protein A  77.46 
 
 
75 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.990042 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0305  ferrous iron transport protein A  77.46 
 
 
75 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0806192 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3883  ferrous iron transport protein A  77.46 
 
 
75 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3605  ferrous iron transport protein A  77.46 
 
 
75 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03260  ferrous iron transport protein A  77.46 
 
 
75 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3778  ferrous iron transport protein A  74.65 
 
 
75 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3812  ferrous iron transport protein A  74.65 
 
 
75 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3874  ferrous iron transport protein A  74.65 
 
 
75 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3706  ferrous iron transport protein A  74.65 
 
 
75 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3703  ferrous iron transport protein A  74.65 
 
 
75 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3821  ferrous iron transport protein A  73.24 
 
 
75 aa  109  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.732277  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56690  ferrous iron transport protein A  64.71 
 
 
75 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4930  ferrous iron transport protein A  61.76 
 
 
75 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0466  FeoA family protein  43.75 
 
 
79 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1819  ferrous iron transport protein A  43.75 
 
 
79 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.253417  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3854  Fe2+ transport system protein B-like protein  40.58 
 
 
117 aa  62  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.746971 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22720  ferrous iron transport protein A  41.94 
 
 
75 aa  61.6  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0106  FeoA family protein  44.26 
 
 
84 aa  60.8  0.000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2469  hypothetical protein  43.55 
 
 
81 aa  60.1  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0238  ferrous iron transport protein A  45.9 
 
 
89 aa  58.9  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1932  FeoA family protein  42.86 
 
 
75 aa  58.9  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.373471  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1960  ferrous iron transport protein A  45.9 
 
 
78 aa  58.9  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2072  FeoA family protein  41.27 
 
 
75 aa  57.8  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0168  hypothetical protein  37.1 
 
 
110 aa  55.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2712  ferrous iron transporter A  52 
 
 
75 aa  54.7  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2585  ferrous iron transporter A  52 
 
 
75 aa  54.3  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4235  FeoA family protein  42 
 
 
74 aa  51.6  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.679143  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0872  FeoA family protein  47.06 
 
 
79 aa  50.4  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3411  FeoA family protein  37.04 
 
 
77 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1786  FeoA family protein  30.14 
 
 
76 aa  48.9  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0221139  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1341  hypothetical protein  38.46 
 
 
80 aa  49.3  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.932772  normal  0.0916633 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3292  hypothetical protein  37.04 
 
 
77 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27216  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0857  hypothetical protein  38.71 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.577958  normal  0.227068 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2257  ferrous iron transport protein FeoA  50 
 
 
75 aa  48.5  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0433  FeoA family protein  37.74 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3367  FeoA family protein  35.19 
 
 
77 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0874  FeoA family protein  33.93 
 
 
154 aa  48.1  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000423206  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0622  FeoA family protein  38.89 
 
 
75 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.927847 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4104  FeoA family protein  31.94 
 
 
77 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.418864  normal  0.543833 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01363  hypothetical protein  40 
 
 
75 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2566  FeoA family protein  33.33 
 
 
74 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0107  FeoA family protein  41.3 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1665  ferrous iron transport protein A  41.3 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0972  FeoA family protein  40 
 
 
94 aa  46.2  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0271378 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0633  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  50 
 
 
231 aa  45.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1930  ferrous iron transport protein A  36.21 
 
 
74 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000000534516  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2465  FeoA family protein  38.3 
 
 
94 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0760  FeoA family protein  37.04 
 
 
82 aa  44.7  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000119012  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1450  ferrous iron transport protein A  34.69 
 
 
82 aa  45.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348854  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0777  hypothetical protein  34 
 
 
82 aa  44.7  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.658901  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0896  FeoA family protein  30.36 
 
 
154 aa  44.7  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000698283  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1953  FeoA family protein  32 
 
 
80 aa  43.9  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16120  ferrous iron transporter FeoB  40.91 
 
 
785 aa  43.9  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000453744 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2844  FeoA family protein  38.64 
 
 
88 aa  43.9  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0645  FeoA family protein  40 
 
 
74 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.967049  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0719  ferrous iron transport protein B  36.73 
 
 
829 aa  43.5  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0311256  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0292  ferrous iron transport protein B  37.04 
 
 
784 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000454012  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3659  FeoA family protein  32 
 
 
75 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2724  FeoA family protein  29.31 
 
 
75 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000395552  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2435  FeoA family protein  34 
 
 
95 aa  42.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1912  putative ferrous iron transport protein  43.9 
 
 
81 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00246631  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1630  feoA protein  43.9 
 
 
83 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000000794157  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0974  FeoA family protein  39.58 
 
 
106 aa  42.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0128498  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2214  FeoA family protein  38.64 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4261  FeoA family protein  40.91 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.609569  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2075  ferrous iron transport protein A  35.56 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.874306 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2012  FeoA family protein  33.33 
 
 
81 aa  41.6  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181667  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0895  hypothetical protein  34.92 
 
 
76 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.859474 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004104  ferrous iron transport protein A  44.44 
 
 
47 aa  41.6  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0194  Fe2+ transport system protein A  40.91 
 
 
152 aa  42  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000592794  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0745  FeoA family protein  38.3 
 
 
79 aa  41.6  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.445851 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3766  FeoA family protein  30 
 
 
75 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0318  FeoA family protein  43.18 
 
 
75 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0792  FeoA family protein  30.77 
 
 
76 aa  41.6  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1435  hypothetical protein  38 
 
 
84 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000347504  normal  0.0226993 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1459  FeoA family protein  36.36 
 
 
75 aa  41.2  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0291796  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1656  FeoA family protein  28.57 
 
 
75 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000197005  hitchhiker  0.000120569 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1193  FeoA family protein  30.65 
 
 
73 aa  40.8  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0285  Fe2+ transport system protein A  36.54 
 
 
157 aa  40.8  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.621067  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0714  ferrous iron transport protein A  28.85 
 
 
85 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3460  FeoA family protein  36.36 
 
 
73 aa  40.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000115859  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0680  ferrous iron transport protein A  28.85 
 
 
85 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0624  ferrous iron transport protein A  28.85 
 
 
85 aa  40.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0624  ferrous iron transport protein A  28.85 
 
 
85 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000493594  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0783  ferrous iron transport protein A, putative  28.85 
 
 
85 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0130272  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0843  putative ferrous iron transport protein A  28.85 
 
 
85 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.923464  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0749  putative ferrous iron transport protein A  28.85 
 
 
85 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4588  putative ferrous iron transport protein A  28.85 
 
 
85 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0769  putative ferrous iron transport protein A  28.85 
 
 
85 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000079809 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0972  FeoA family protein  32.61 
 
 
81 aa  40.4  0.009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000216007  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0902  FeoA family protein  33.33 
 
 
76 aa  40.4  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0959583  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0619  hypothetical protein  30.19 
 
 
73 aa  40.4  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000301048  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>