137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1747 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_4015  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  60.22 
 
 
1114 aa  1196    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.186712  normal  0.268037 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05437  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  60.48 
 
 
1137 aa  1171    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.487403  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1815  exodeoxyribonuclease V gamma chain  98.13 
 
 
1121 aa  2174    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1747  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  100 
 
 
1121 aa  2217    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.632036  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0582  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  31.11 
 
 
1091 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1054  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  30.28 
 
 
1085 aa  394  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0325  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  30.44 
 
 
1071 aa  389  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00559956 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3233  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.62 
 
 
1131 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.911528 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0345  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.74 
 
 
1074 aa  380  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2148  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.77 
 
 
1061 aa  382  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1434  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.66 
 
 
1068 aa  372  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.686584  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3391  exonuclease V subunit gamma  28.58 
 
 
1132 aa  363  9e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.884703  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3816  exonuclease V subunit gamma  29.97 
 
 
1123 aa  360  8e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.826552  normal  0.163807 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1937  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.2 
 
 
1187 aa  360  9.999999999999999e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1625  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  31.53 
 
 
1173 aa  358  2.9999999999999997e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.158099  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1458  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.17 
 
 
1149 aa  358  3.9999999999999996e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1271  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.78 
 
 
1164 aa  356  1e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2641  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28 
 
 
1190 aa  356  1e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.144342 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0912  exonuclease V subunit gamma  28.63 
 
 
1132 aa  353  1e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.986553  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1533  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  30.73 
 
 
1054 aa  351  4e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55690  exodeoxyribonuclease V gamma chain  29.95 
 
 
1171 aa  349  1e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1905  exonuclease V subunit gamma  28.6 
 
 
1148 aa  348  3e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2419  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.53 
 
 
1269 aa  348  4e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3159  exonuclease V subunit gamma  29.39 
 
 
1123 aa  346  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0989  exonuclease V subunit gamma  28.27 
 
 
1123 aa  345  2e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3322  exonuclease V subunit gamma  29.17 
 
 
1123 aa  345  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.056399 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3222  exonuclease V subunit gamma  29.17 
 
 
1123 aa  345  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.790994  normal  0.118959 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3142  exonuclease V subunit gamma  29.17 
 
 
1123 aa  345  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3208  exonuclease V subunit gamma  29.17 
 
 
1123 aa  345  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.330224 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0680  exonuclease V subunit gamma  26.33 
 
 
1127 aa  343  7e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257765  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3009  exonuclease V subunit gamma  29 
 
 
1128 aa  343  8e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3233  exonuclease V subunit gamma  28.19 
 
 
1123 aa  343  1e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4674  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  31.13 
 
 
1160 aa  342  2e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0516374 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3265  exonuclease V subunit gamma  28.98 
 
 
1124 aa  342  2e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.625608  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1360  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.79 
 
 
1077 aa  342  2.9999999999999998e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1041  exonuclease V subunit gamma  28.18 
 
 
1123 aa  341  4e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4087  exonuclease V subunit gamma  28.71 
 
 
1122 aa  340  9.999999999999999e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.459792  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1894  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  30.35 
 
 
1060 aa  339  1.9999999999999998e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000000164621 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03302  exonuclease V subunit gamma  28.42 
 
 
1164 aa  339  1.9999999999999998e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0869  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.62 
 
 
1122 aa  338  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0545  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.31 
 
 
1098 aa  338  2.9999999999999997e-91  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.444064  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4538  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  32.04 
 
 
1160 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.483988  normal  0.0568406 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3142  exonuclease V subunit gamma  28.62 
 
 
1122 aa  338  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0893  exonuclease V subunit gamma  28.62 
 
 
1122 aa  338  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2969  exonuclease V subunit gamma  28.53 
 
 
1122 aa  338  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.481674  normal  0.0228423 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1402  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.45 
 
 
1077 aa  337  5.999999999999999e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.937343  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02670  exonuclease V (RecBCD complex), gamma chain  28.53 
 
 
1122 aa  337  9e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02631  hypothetical protein  28.53 
 
 
1122 aa  337  9e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2968  exonuclease V subunit gamma  28.53 
 
 
1122 aa  336  1e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0803  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  30 
 
 
1184 aa  335  3e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.316931  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2110  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.58 
 
 
1226 aa  335  3e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0688  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  30.03 
 
 
1150 aa  335  4e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.131155  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0763  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  29.22 
 
 
1127 aa  334  7.000000000000001e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3040  exonuclease V subunit gamma  28.36 
 
 
1122 aa  333  1e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1985  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  31.92 
 
 
1158 aa  332  2e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18739  normal  0.278857 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002684  exodeoxyribonuclease V gamma chain  28.47 
 
 
1163 aa  332  4e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4564  hypothetical protein  27.21 
 
 
1260 aa  328  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2278  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.21 
 
 
1260 aa  328  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4672  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.8 
 
 
1159 aa  328  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155523 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4852  exodeoxyribonuclease V gamma chain  30.81 
 
 
1156 aa  327  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2129  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.3 
 
 
1192 aa  325  2e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2048  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.58 
 
 
1270 aa  325  4e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2095  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.61 
 
 
1270 aa  325  4e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0776  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  30.02 
 
 
1158 aa  321  6e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1853  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.92 
 
 
1234 aa  320  1e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51720  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  30.82 
 
 
1168 aa  320  1e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2290  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.54 
 
 
1274 aa  320  1e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0760  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.34 
 
 
1158 aa  320  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0191191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2245  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.89 
 
 
1234 aa  315  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.965648 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1756  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.01 
 
 
1166 aa  315  3.9999999999999997e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1775  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.72 
 
 
1236 aa  315  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0680  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  29.84 
 
 
1157 aa  313  7.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0012  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.79 
 
 
1197 aa  313  9e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0563  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.08 
 
 
1183 aa  311  5.9999999999999995e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.480964  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0996  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  27.97 
 
 
1075 aa  308  5.0000000000000004e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.958514 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1900  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.53 
 
 
1163 aa  304  5.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0373  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.03 
 
 
1064 aa  304  6.000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01027  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.29 
 
 
1206 aa  304  8.000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2149  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.38 
 
 
1270 aa  300  8e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2024  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.6 
 
 
1162 aa  299  2e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.93867  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4569  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.9 
 
 
1169 aa  286  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2533  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.28 
 
 
1270 aa  283  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.568964  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0690  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.61 
 
 
1138 aa  279  2e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1168  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  30.82 
 
 
1210 aa  275  3e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0268  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.26 
 
 
1144 aa  274  6e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2351  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.34 
 
 
1375 aa  265  3e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2546  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  30.8 
 
 
1130 aa  265  4.999999999999999e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2931  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  30.8 
 
 
1130 aa  265  4.999999999999999e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0520  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  31.07 
 
 
1174 aa  258  6e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.318804  normal  0.0360548 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2769  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  24.57 
 
 
1198 aa  245  3e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2296  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.17 
 
 
1103 aa  243  1e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.566051  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0992  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.14 
 
 
1158 aa  235  3e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.218847  normal  0.146183 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1776  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  30.06 
 
 
1294 aa  236  3e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000148654 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3372  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.84 
 
 
1143 aa  234  9e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.369157  normal  0.661883 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1849  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.91 
 
 
1218 aa  228  4e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.013439  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3908  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.28 
 
 
1141 aa  228  7e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00208129  normal  0.199175 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2170  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  24.77 
 
 
1063 aa  226  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.411228  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0251  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.37 
 
 
1113 aa  226  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1749  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.19 
 
 
1121 aa  220  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.246728  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10642  exonuclease V gamma subunit recC  28.32 
 
 
1097 aa  219  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.167031  normal  0.143221 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>