14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1494 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1494  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 130 aa  273  8e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.8674  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0030  glycosy hydrolase family protein  53.12 
 
 		 207 aa  147  6e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0210043  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1039  glycoside hydrolase family 25  28.46 
 
 		 249 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0314219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1185  glycoside hydrolase family 25  26.92 
 
 		 249 aa  50.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.635675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2632  glycoside hydrolase family 25  25.78 
 
 		 268 aa  48.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1718  glycoside hydrolase family 25  34.43 
 
 		 235 aa  46.2  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02030  predicted hydrolase  28.23 
 
 		 272 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01994  hypothetical protein  28.23 
 
 		 272 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0797  glycoside hydrolase family 25  31.71 
 
 		 255 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.140444 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0703  glycoside hydrolase family 25  23.26 
 
 		 257 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356119  normal  0.422369 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1136  glycosyl hydrolase family 25  28.23 
 
 		 272 aa  41.6  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.284707  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3081  glycosyl hydrolase family 25  28.23 
 
 		 272 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.150513 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30340  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  30.26 
 
 		 294 aa  42  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2390  glycosy hydrolase family protein  27.42 
 
 		 272 aa  40.4  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>