13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1204 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1204  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  384  1e-106  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.601718  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1824  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  384  1e-106  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1178  hypothetical protein  94.68 
 
 
188 aa  367  1e-101  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.446218  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1207  hypothetical protein  54.1 
 
 
182 aa  195  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0553382  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0376  hypothetical protein  29.31 
 
 
182 aa  79  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000043617  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2858  hypothetical protein  28.74 
 
 
182 aa  77  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000914413  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1472  hypothetical protein  26.14 
 
 
198 aa  73.2  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3065  hypothetical protein  27.71 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1189  hypothetical protein  26.86 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000115787  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1233  hypothetical protein  27.27 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272813  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3415  hypothetical protein  28.43 
 
 
228 aa  57  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48327  hitchhiker  0.00123882 
 
 
-
 
NC_002936  DET1101  hypothetical protein  29.14 
 
 
190 aa  54.7  0.0000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000139057  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1410  hypothetical protein  24.44 
 
 
195 aa  41.6  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>