70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2343 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2343  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  100 
 
 		 592 aa  1163    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.970374  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1575  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  98.48 
 
 		 592 aa  1147    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.016741  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0800  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  57.9 
 
 		 587 aa  577  1.0000000000000001e-163  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06790  hypothetical protein  54.58 
 
 		 594 aa  545  1e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00130  hypothetical protein  54.56 
 
 		 594 aa  531  1e-149  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06490  type IV secretory pathway, VirD4 component  39.04 
 
 		 634 aa  341  2e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00928914  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0452  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  38.66 
 
 		 621 aa  337  3.9999999999999995e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4706  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  35.56 
 
 		 490 aa  231  2e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.220064  normal  0.843758 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5436  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  36.15 
 
 		 611 aa  229  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.561912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8942  conjugative transfer gene complex protein  36.55 
 
 		 613 aa  224  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.312755  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0689  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  34.51 
 
 		 636 aa  196  8.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.01424  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2246  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  32.69 
 
 		 506 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1576  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  32.12 
 
 		 453 aa  182  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540203  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4500  conjugative transfer gene complex protein  30.05 
 
 		 589 aa  171  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.610328  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4560  putative TraG-family protein  32 
 
 		 589 aa  169  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0985941 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4273  conjugative transfer gene complex protein  33.89 
 
 		 591 aa  166  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5521  TRAG family protein  30.79 
 
 		 604 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.197372  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4219  conjugative transfer gene complex protein  30.14 
 
 		 590 aa  160  8e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2361  hypothetical protein  31.82 
 
 		 598 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.210389  normal  0.401092 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0363  type IV secretory pathway VirD4 component  27.56 
 
 		 602 aa  130  9.000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.397437  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0263  conjugal transfer protein  27.38 
 
 		 583 aa  128  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0192996  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1381  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  27.29 
 
 		 656 aa  114  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1438  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  30.2 
 
 		 562 aa  113  9e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00273235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0604  hypothetical protein  30.12 
 
 		 399 aa  112  3e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3305  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  26.62 
 
 		 690 aa  99.4  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000882445  normal  0.114382 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1764  putative type IV secretory pathway protein VirD4  26.08 
 
 		 575 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347607  normal  0.197247 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6495  TRAG family protein  25.17 
 
 		 583 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2647  putative Type IV secretory pathway protein VirD4  25.17 
 
 		 576 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4192  TRAG family protein  24.84 
 
 		 570 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0247  putative type IV secretory pathway protein VirD4  27.17 
 
 		 648 aa  78.2  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.865084 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4843  TRAG protein  24.62 
 
 		 557 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3323  TRAG family protein  24.62 
 
 		 570 aa  77  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0458  putative type IV secretory pathway protein VirD4  23.41 
 
 		 593 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1362  TRAG family protein  28.08 
 
 		 663 aa  69.7  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.824009  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0172  TRAG family protein  23.41 
 
 		 594 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.218422 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4169  TRAG protein  22.4 
 
 		 678 aa  66.6  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5000  TRAG family protein  23.03 
 
 		 670 aa  64.7  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4554  TRAG family protein  20.51 
 
 		 695 aa  63.5  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6396  TRAG family protein  22.18 
 
 		 699 aa  60.8  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.969912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1502  TRAG family protein  25.36 
 
 		 610 aa  59.3  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.343787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4938  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  31.16 
 
 		 669 aa  58.5  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2738  TRAG family protein  21.67 
 
 		 606 aa  55.1  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0976  TRAG family protein  23.05 
 
 		 912 aa  55.1  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5019  TRAG family protein  21.71 
 
 		 758 aa  54.7  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6143  type IV secretion system protein VirD4  23.12 
 
 		 548 aa  54.3  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9810  conjugative coupling protein  20.27 
 
 		 699 aa  54.3  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4368  TRAG family protein  23.94 
 
 		 713 aa  53.9  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.538935 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0206  putative type IV secretory pathway VirD4 protein  25.83 
 
 		 386 aa  53.1  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.415512  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0680  agrobacteirum virulence protein VirD4  23.27 
 
 		 554 aa  52.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1514  TRAG family protein  21.11 
 
 		 606 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5785  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  25.12 
 
 		 471 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435047  normal  0.0557182 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0170  cmgd4  19.53 
 
 		 658 aa  52  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.035471  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0162  hypothetical protein  20.58 
 
 		 633 aa  50.8  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1111  type IV secretion system protein VirD4  25.35 
 
 		 509 aa  50.4  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2451  TRAG family protein  25.71 
 
 		 559 aa  49.7  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.885622  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5823  TRAG family protein  21.33 
 
 		 651 aa  48.9  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3620  TRAG family protein  22.71 
 
 		 896 aa  46.6  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0601306  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0180  hypothetical protein  20.63 
 
 		 633 aa  46.6  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4436  TRAG protein  22.46 
 
 		 714 aa  46.6  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3548  conjugal transfer coupling protein TraG  24.04 
 
 		 664 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0007  hypothetical protein  25.82 
 
 		 628 aa  46.2  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3006  conjugal transfer coupling protein TraG  22.94 
 
 		 663 aa  45.8  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5331  TRAG family protein  22.4 
 
 		 658 aa  45.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.390385 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0788  TRAG family protein  25.52 
 
 		 590 aa  45.4  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2352  Sigma 54 interacting domain protein  25.17 
 
 		 672 aa  45.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2618  conjugal transfer coupling protein TraG  32.89 
 
 		 687 aa  44.7  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8210  type IV secretion system protein VirD4  25 
 
 		 663 aa  45.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.493038  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7438  conjugal transfer coupling protein TraG  33.78 
 
 		 660 aa  44.7  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291662  normal  0.932105 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a021  conjugal transfer protein TraG/VirD4  20.31 
 
 		 598 aa  44.7  0.005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1805  TRAG family protein  25.77 
 
 		 598 aa  43.5  0.01  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>