More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0095 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0095  histidine kinase  100 
 
 
375 aa  708    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0309  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 
400 aa  126  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.13648 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 
441 aa  125  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  37.32 
 
 
401 aa  124  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  32.38 
 
 
392 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.46 
 
 
403 aa  120  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  32.22 
 
 
462 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  38.35 
 
 
395 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6964  histidine kinase  34.27 
 
 
399 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.198128  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 
469 aa  107  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 
496 aa  106  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2468  histidine kinase  33.06 
 
 
393 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000420477  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2086  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 
389 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724108  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  31.11 
 
 
399 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7842  histidine kinase  32.78 
 
 
402 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  38.94 
 
 
442 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  35.24 
 
 
392 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 
394 aa  101  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 
394 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  30.05 
 
 
380 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  33.33 
 
 
405 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 
423 aa  100  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  29.73 
 
 
430 aa  100  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  29.09 
 
 
378 aa  99.8  7e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  34.16 
 
 
408 aa  99.8  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  30.24 
 
 
372 aa  99.8  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  26.58 
 
 
421 aa  99  1e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11590  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
612 aa  98.6  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338093  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  33.7 
 
 
428 aa  98.2  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  33.06 
 
 
367 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2410  histidine kinase  33.15 
 
 
343 aa  98.6  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000188304  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  38.99 
 
 
457 aa  97.1  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2513  histidine kinase  30.67 
 
 
424 aa  96.7  6e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0276657  normal  0.73288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1615  histidine kinase  34.96 
 
 
407 aa  96.3  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0650745  normal  0.0536208 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39190  signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 
601 aa  96.3  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.240452 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  34.68 
 
 
399 aa  95.5  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  32.08 
 
 
381 aa  95.5  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 
420 aa  94.7  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33000  signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 
411 aa  95.1  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.250015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.42 
 
 
386 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0103  histidine kinase  38.91 
 
 
393 aa  95.1  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.105504  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 
536 aa  95.1  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  30.55 
 
 
433 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 
441 aa  93.6  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  34.62 
 
 
478 aa  93.2  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  35.75 
 
 
423 aa  93.2  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  30.15 
 
 
410 aa  93.2  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  27.35 
 
 
406 aa  92.8  8e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 
406 aa  92.8  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  27.69 
 
 
430 aa  92.8  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0610  putative two-component system sensor kinase  38.89 
 
 
372 aa  92.8  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  36.2 
 
 
422 aa  92.8  9e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  35 
 
 
370 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  31.86 
 
 
438 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3670  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.43 
 
 
371 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1961  histidine kinase  35.78 
 
 
420 aa  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1319  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  36.76 
 
 
384 aa  90.9  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03530  signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 
484 aa  90.9  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8792  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.88 
 
 
380 aa  90.5  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.524564  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5264  histidine kinase  29.86 
 
 
376 aa  90.5  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  34.88 
 
 
369 aa  90.1  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2269  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  30.56 
 
 
446 aa  89.7  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00214967  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0906  histidine kinase  27.91 
 
 
381 aa  89.7  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2107  histidine kinase  30.08 
 
 
401 aa  89.4  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.51786 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3315  histidine kinase  35.24 
 
 
393 aa  89.4  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0173887  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  32.58 
 
 
442 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6162  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.81 
 
 
415 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  decreased coverage  0.000124452 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2014  histidine kinase  36.12 
 
 
387 aa  89  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3474  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  31.97 
 
 
385 aa  88.6  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3239  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  36.44 
 
 
422 aa  89  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.771417  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0405  histidine kinase  36.7 
 
 
379 aa  89  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2473  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 
391 aa  89.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0506045  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
405 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  30.57 
 
 
397 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 
382 aa  87.4  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.935263  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3391  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 
445 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0809012  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2233  histidine kinase  33.52 
 
 
357 aa  87.4  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370495  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1733  histidine kinase  35.39 
 
 
385 aa  87  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179615  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.7 
 
 
438 aa  87.4  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.621089  normal  0.0286843 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3749  histidine kinase  29.89 
 
 
393 aa  87  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  37.21 
 
 
407 aa  87  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8244  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.93 
 
 
357 aa  86.7  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.249642 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15920  signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 
367 aa  86.7  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.89616 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 
444 aa  86.7  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 
470 aa  86.7  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0504  histidine kinase  31.1 
 
 
407 aa  86.3  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.991268 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  33.91 
 
 
393 aa  86.3  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0760  histidine kinase  36.49 
 
 
461 aa  86.3  8e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.29757  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36940  signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 
441 aa  86.3  9e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  32.62 
 
 
384 aa  86.3  9e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25050  signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 
360 aa  85.9  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193402  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.75 
 
 
386 aa  85.5  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0545  histidine kinase  34.55 
 
 
382 aa  85.5  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  32.86 
 
 
400 aa  85.9  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0823  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.62 
 
 
417 aa  84.7  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 
407 aa  84.7  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2556  histidine kinase  35.68 
 
 
416 aa  84.7  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.121674  normal  0.0692801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4576  histidine kinase  35.14 
 
 
394 aa  85.1  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312812  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1821  histidine kinase  37.14 
 
 
384 aa  85.1  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.317719  normal  0.0945618 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3391  histidine kinase  31.94 
 
 
356 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.382044  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>