21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4994 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009717  Xaut_4994  hypothetical protein  100 
 
 
398 aa  808    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4154  hypothetical protein  55.03 
 
 
406 aa  432  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0603844  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4238  hypothetical protein  43.72 
 
 
403 aa  348  1e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4329  hypothetical protein  42.42 
 
 
399 aa  305  8.000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00310641  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6244  hypothetical protein  40.55 
 
 
409 aa  287  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6826  hypothetical protein  38.94 
 
 
480 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0336179  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1674  hypothetical protein  42.35 
 
 
380 aa  276  4e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.252915 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4748  hypothetical protein  38.54 
 
 
429 aa  261  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3958  hypothetical protein  35.83 
 
 
408 aa  216  4e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1564  hypothetical protein  33.92 
 
 
422 aa  212  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144406  normal  0.0475856 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2564  hypothetical protein  32.83 
 
 
402 aa  207  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2244  hypothetical protein  33.25 
 
 
406 aa  206  6e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.311601 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5361  hypothetical protein  24.33 
 
 
409 aa  87.4  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0691141 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4991  hypothetical protein  25.22 
 
 
489 aa  84  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354735  hitchhiker  0.00100031 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4289  hypothetical protein  22.46 
 
 
433 aa  73.2  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5232  hypothetical protein  23.5 
 
 
406 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500943  normal  0.262246 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1568  hypothetical protein  23.21 
 
 
406 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5030  protein of unknown function DUF1173  22.98 
 
 
441 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.015581  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5585  hypothetical protein  25.64 
 
 
410 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28091  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5425  hypothetical protein  23.36 
 
 
451 aa  53.5  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6249  hypothetical protein  21.57 
 
 
408 aa  52.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>