More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3964 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3964  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
268 aa  520  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2011  putative ABC transporter inner membrane component  64.34 
 
 
270 aa  329  4e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.050434  normal  0.0106691 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3263  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  66.79 
 
 
265 aa  322  3e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.857467  normal  0.639309 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0249  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  65.5 
 
 
270 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.181465  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3864  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  63.74 
 
 
280 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3259  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  66.92 
 
 
272 aa  292  4e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.966074  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1926  phosphonate ABC transporter ATPase  62.07 
 
 
269 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.749096  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3235  phosphonate ABC transporter permease  47.49 
 
 
268 aa  210  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3725  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  46.88 
 
 
262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0596  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  46.42 
 
 
262 aa  190  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00848061 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2368  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  45.25 
 
 
277 aa  189  4e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4576  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  48.96 
 
 
269 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1232  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  44.57 
 
 
265 aa  180  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.917781  normal  0.196342 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5616  phosphonate ABC transporter, permease protein  44.02 
 
 
259 aa  171  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0999  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  44.09 
 
 
264 aa  171  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4605  phosphonate ABC transporter, permease protein  44.02 
 
 
259 aa  171  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03975  phosphonate/organophosphate ester transporter  44.02 
 
 
272 aa  169  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3923  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  44.02 
 
 
259 aa  169  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4657  phosphonate ABC transporter, permease protein  44.02 
 
 
259 aa  169  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4344  phosphonate ABC transporter, permease protein  44.02 
 
 
259 aa  169  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4569  phosphonate ABC transporter, permease protein  44.02 
 
 
259 aa  169  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0307  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.45 
 
 
259 aa  169  6e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.685305  normal  0.115805 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0858  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  43.38 
 
 
261 aa  167  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00704551  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2906  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  41.78 
 
 
511 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00115761  normal  0.0544773 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1322  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  42.65 
 
 
533 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497345  normal  0.731542 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2888  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  43 
 
 
263 aa  162  6e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117638  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3857  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.67 
 
 
277 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3906  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.67 
 
 
277 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.482347 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2914  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40.38 
 
 
269 aa  157  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263053  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0367  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.33 
 
 
272 aa  155  9e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0859  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.37 
 
 
263 aa  153  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0148333  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2966  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.23 
 
 
266 aa  152  5.9999999999999996e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6089  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.13 
 
 
270 aa  152  7e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3257  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.84 
 
 
272 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.814913  normal  0.191415 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2675  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.59 
 
 
297 aa  150  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0563966 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3236  phosphonate ABC transporter permease  38.06 
 
 
276 aa  150  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3965  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  42 
 
 
272 aa  149  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.692533 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0595  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  41.67 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808391 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1747  phosphonate ABC transporter permease PhnE  42.78 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.415612  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20330  phosphonate ABC tranporter permease protein  42.78 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.293398  normal  0.582568 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1233  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.44 
 
 
266 aa  146  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.702272  normal  0.203861 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3336  phosphonate ABC transporter, permease protein  38.57 
 
 
271 aa  145  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4522  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.37 
 
 
280 aa  145  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0459  ABC type permease  42.41 
 
 
261 aa  145  5e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110388  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3302  phosphonate ABC transporter, permease protein  38.57 
 
 
271 aa  145  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314465  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0423  ABC type permease  42.41 
 
 
261 aa  145  5e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.436548  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3348  phosphonates ABC transporter, permease protein  38.57 
 
 
271 aa  145  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4577  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.01 
 
 
271 aa  144  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2409  phosphonates ABC transporter, permease protein  38.1 
 
 
271 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1418  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.86 
 
 
266 aa  144  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0837  ABC phosphonate transporter, inner membrane subunit PhnE  38.91 
 
 
280 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0879001 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0326  phosphonates ABC transporter, permease protein  38.1 
 
 
271 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2596  phosphonates ABC transporter, permease protein  38.1 
 
 
271 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1187  phosphonates ABC transporter, permease protein  38.1 
 
 
271 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0261  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.35 
 
 
271 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0745614 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1522  phosphonate ABC transporter, permease protein  32.75 
 
 
264 aa  143  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0252842  normal  0.0146163 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0912  phosphate ABC transporter permease  38.76 
 
 
275 aa  142  5e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.166132  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3991  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.99 
 
 
276 aa  142  6e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608155  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3240  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.99 
 
 
276 aa  142  6e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.655899  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2557  phosphonates ABC transporter, permease protein  40.64 
 
 
262 aa  142  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.108995  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0873  phosphonate ABC transporter inner membrane subunit  40 
 
 
265 aa  142  8e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.122179 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2249  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.11 
 
 
262 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.859646  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2298  ABC phosphonate permease  35.37 
 
 
271 aa  141  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2012  putative ABC transporter inner membrane component  39.41 
 
 
271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.100736  decreased coverage  0.00339933 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1280  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.55 
 
 
276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.61484  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5875  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.65 
 
 
277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3721  phosphonate ABC transporter, permease protein  32.75 
 
 
264 aa  140  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.254444  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3793  phosphonate ABC transporter, permease protein  32.75 
 
 
264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.893389  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3473  phosphonate ABC transporter permease  32.31 
 
 
264 aa  139  6e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3748  phosphonate ABC transporter permease  32.31 
 
 
264 aa  139  6e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3702  phosphonate ABC transporter, permease protein  32.31 
 
 
264 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000191718 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3744  phosphonate ABC transporter, permease protein  32.75 
 
 
264 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000212765  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3390  phosphonate ABC transporter, permease  31.88 
 
 
264 aa  137  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0936447  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4621  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.94 
 
 
280 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.438003 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2674  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.3 
 
 
266 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1925  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  35.68 
 
 
272 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.77597  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0250  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  40.21 
 
 
277 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2993  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  39.3 
 
 
266 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0998  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.67 
 
 
265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3371  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  31.44 
 
 
264 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0022523  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3439  phosphonate ABC transporter, permease  31.88 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0216  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40.31 
 
 
341 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4036  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40.31 
 
 
341 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.311979  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3380  putative phosphonate transport system permease protein htxC phnE  37.44 
 
 
273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.590376  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0773  phosphonate ABC transporter permease  39.42 
 
 
292 aa  132  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.741951  normal  0.989098 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1451  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  31.67 
 
 
269 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.349089  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3724  phosphonate ABC transporter permease  36.49 
 
 
265 aa  131  9e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0183  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  38.8 
 
 
267 aa  131  9e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685184  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17510  Phosphonate transport systems inner membrane component  36.71 
 
 
269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0827  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  42.86 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.152622  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2338  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  30.13 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000033517  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1321  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.15 
 
 
288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3326  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  32.51 
 
 
365 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0337  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, permease component  36.32 
 
 
269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4179  phosphonate ABC transporter permease  35.66 
 
 
288 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4995  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.17 
 
 
245 aa  129  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.250762  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0182  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.15 
 
 
542 aa  129  5.0000000000000004e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2681  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40.74 
 
 
288 aa  129  6e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4151  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.19 
 
 
274 aa  129  7.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0177  phosphonate ABC transporter permease  35.92 
 
 
264 aa  128  8.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000132377  normal  0.0614362 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>